Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G001132.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QGM2
Pfam -
Panther DB PTHR33698 PTHR33698:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G41470 : Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g64380.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G185400 transporter-related, putative, expressed -
2 Sobic.007G055400 expressed protein -
3 Sobic.001G084200 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
4 Sobic.006G138966 - -
5 Sobic.009G168700 ammonium transporter protein, putative, expressed K03320: amt, AMT, ammonium transporter, Amt family
6 Sobic.001G192750 - -
7 Sobic.004G067850 - -
8 Sobic.008G032850 - -
9 Sobic.002G342200 expressed protein -
10 Sobic.008G020400 - -
11 Sobic.008G085600 - -
12 Sobic.009G066850 - -
13 Sobic.007G024900 OsWAK110 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
14 Sobic.006G178200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
15 Sobic.002G302400 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
16 Sobic.005G073101 - -
17 Sobic.010G229200 - -
18 Sobic.005G082950 - -
19 Sobic.006G149650 - -
20 Sobic.K044402 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G001132 Sobic001G001132 Sobic002G185400 Sobic002G185400 Sobic001G001132--Sobic002G185400 Sobic007G055400 Sobic007G055400 Sobic001G001132--Sobic007G055400 Sobic001G084200 Sobic001G084200 Sobic001G001132--Sobic001G084200 Sobic006G138966 Sobic006G138966 Sobic001G001132--Sobic006G138966 Sobic009G168700 Sobic009G168700 Sobic001G001132--Sobic009G168700 Sobic001G192750 Sobic001G192750 Sobic001G001132--Sobic001G192750 Sobic004G067850 Sobic004G067850 Sobic001G001132--Sobic004G067850 Sobic008G032850 Sobic008G032850 Sobic001G001132--Sobic008G032850 Sobic002G342200 Sobic002G342200 Sobic001G001132--Sobic002G342200 Sobic002G185400--Sobic001G084200 Sobic002G185400--Sobic001G001132 Sobic002G185400--Sobic009G168700 Sobic002G185400--Sobic006G138966 Sobic005G073101 Sobic005G073101 Sobic002G185400--Sobic005G073101 Sobic002G185400--Sobic001G192750 Sobic002G185400--Sobic004G067850 Sobic002G185400--Sobic008G032850 Sobic002G185400--Sobic002G342200 SobicK044402 SobicK044402 Sobic007G055400--SobicK044402 Sobic003G143401 Sobic003G143401 Sobic007G055400--Sobic003G143401 Sobic007G055400--Sobic004G067850 Sobic007G055400--Sobic008G032850 Sobic007G055400--Sobic001G001132 Sobic009G227650 Sobic009G227650 Sobic007G055400--Sobic009G227650 Sobic008G085600 Sobic008G085600 Sobic007G055400--Sobic008G085600 Sobic010G262650 Sobic010G262650 Sobic007G055400--Sobic010G262650 Sobic010G158601 Sobic010G158601 Sobic007G055400--Sobic010G158601 Sobic001G084200--Sobic009G168700 Sobic001G084200--Sobic004G067850 Sobic001G084200--Sobic008G032850 Sobic006G178200 Sobic006G178200 Sobic001G084200--Sobic006G178200 Sobic002G302400 Sobic002G302400 Sobic001G084200--Sobic002G302400 Sobic008G192100 Sobic008G192100 Sobic001G084200--Sobic008G192100 Sobic005G082950 Sobic005G082950 Sobic001G084200--Sobic005G082950 Sobic004G048600 Sobic004G048600 Sobic001G084200--Sobic004G048600 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic001G084200--Sobic001G272300 Sobic006G138966--Sobic005G073101 Sobic006G138966--Sobic001G084200 Sobic006G138966--Sobic004G067850 Sobic006G138966--Sobic008G032850 Sobic006G138966--Sobic001G192750 Sobic006G138966--Sobic009G168700 Sobic009G066850 Sobic009G066850 Sobic006G138966--Sobic009G066850 Sobic001G450100 Sobic001G450100 Sobic006G138966--Sobic001G450100 Sobic006G138966--Sobic002G302400 Sobic009G168700--Sobic001G084200 Sobic009G168700--Sobic002G302400 Sobic009G168700--Sobic008G192100 Sobic009G168700--Sobic005G082950 Sobic010G021600 Sobic010G021600 Sobic009G168700--Sobic010G021600 Sobic009G168700--Sobic008G032850 Sobic009G168700--Sobic004G048600 Sobic009G168700--Sobic004G067850 SobicK042700 SobicK042700 Sobic009G168700--SobicK042700 Sobic001G192750--Sobic009G066850 Sobic001G192750--Sobic004G067850 Sobic001G192750--Sobic008G032850 Sobic001G192750--Sobic001G084200 Sobic001G192750--Sobic009G168700 Sobic001G192750--Sobic006G138966 Sobic001G192750--Sobic002G302400 Sobic001G192750--Sobic008G192100 Sobic001G192750--Sobic001G272300 Sobic004G067850--Sobic008G032850 Sobic004G067850--Sobic002G302400 Sobic004G067850--Sobic001G272300 Sobic008G032850--Sobic004G067850 Sobic008G032850--Sobic002G302400 Sobic008G032850--Sobic001G272300 Sobic002G342200--Sobic009G168700 Sobic002G342200--Sobic004G048600 Sobic002G342200--Sobic006G178200 Sobic009G147100 Sobic009G147100 Sobic002G342200--Sobic009G147100 Sobic003G291050 Sobic003G291050 Sobic002G342200--Sobic003G291050 Sobic002G342200--Sobic008G192100 Sobic004G019900 Sobic004G019900 Sobic002G342200--Sobic004G019900 Sobic002G342200--Sobic002G302400 Sobic002G342200--Sobic005G082950
Octagon: transcription factors


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