Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G035300.1
Synonym Sb01g003300
Functional annotation ZOS3-20 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt C5WV19
Pfam PF13912
Panther DB PTHR26374 PTHR26374:SF202
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G59820 : C2H2-type zinc finger family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g60540.1 : ZOS3-20 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008801 , Zm00025a008795 , Zm00025a039693
Brachypodium KQK10499 , KQK12449 , KQK12444 , KQK12443
Barley HORVU5Hr1G112930.3 , HORVU5Hr1G112930.2 , HORVU5Hr1G112930.1 , HORVU3Hr1G086790.3 , HORVU3Hr1G086790.2 , HORVU3Hr1G086790.4
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G022300 carrier, putative, expressed -
2 Sobic.001G228900 exostosin family domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G325500 ankyrin repeat family protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G106500 hydroquinone glucosyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.002G165020 - -
6 Sobic.002G417600 ATOFP17/OFP17, putative, expressed -
7 Sobic.008G019900 - -
8 Sobic.K010100 expressed protein -
9 Sobic.010G127500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
10 Sobic.010G116000 ZOS1-08 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
11 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
12 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
13 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
14 Sobic.001G317900 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
15 Sobic.005G083932 - -
16 Sobic.002G253200 thaumatin, putative, expressed -
17 Sobic.008G174400 OsFBX464 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G191200 OsFBX55 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G260900 - -
20 Sobic.006G030250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G035300 Sobic001G035300 Sobic007G022300 Sobic007G022300 Sobic001G035300--Sobic007G022300 Sobic001G228900 Sobic001G228900 Sobic001G035300--Sobic001G228900 Sobic002G325500 Sobic002G325500 Sobic001G035300--Sobic002G325500 Sobic004G106500 Sobic004G106500 Sobic001G035300--Sobic004G106500 Sobic002G165020 Sobic002G165020 Sobic001G035300--Sobic002G165020 Sobic002G417600 Sobic002G417600 Sobic001G035300--Sobic002G417600 Sobic008G019900 Sobic008G019900 Sobic001G035300--Sobic008G019900 SobicK010100 SobicK010100 Sobic001G035300--SobicK010100 Sobic010G127500 Sobic010G127500 Sobic001G035300--Sobic010G127500 Sobic007G022300--Sobic001G035300 Sobic009G092200 Sobic009G092200 Sobic007G022300--Sobic009G092200 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic007G022300--Sobic001G317900 Sobic002G191200 Sobic002G191200 Sobic007G022300--Sobic002G191200 Sobic008G174400 Sobic008G174400 Sobic007G022300--Sobic008G174400 Sobic005G083932 Sobic005G083932 Sobic007G022300--Sobic005G083932 Sobic001G228900--Sobic001G035300 Sobic001G228900--Sobic002G325500 Sobic007G199101 Sobic007G199101 Sobic001G228900--Sobic007G199101 Sobic001G228900--Sobic002G417600 Sobic001G228900--Sobic008G019900 Sobic001G228900--Sobic007G022300 Sobic002G099100 Sobic002G099100 Sobic001G228900--Sobic002G099100 Sobic007G212250 Sobic007G212250 Sobic001G228900--Sobic007G212250 Sobic006G190150 Sobic006G190150 Sobic001G228900--Sobic006G190150 Sobic002G325500--Sobic001G035300 Sobic002G424500 Sobic002G424500 Sobic002G325500--Sobic002G424500 Sobic007G005100 Sobic007G005100 Sobic002G325500--Sobic007G005100 Sobic002G325500--Sobic004G106500 Sobic002G325500--Sobic001G228900 Sobic007G061600 Sobic007G061600 Sobic002G325500--Sobic007G061600 Sobic008G078800 Sobic008G078800 Sobic002G325500--Sobic008G078800 Sobic002G325500--Sobic008G019900 Sobic002G325500--SobicK010100 Sobic004G106500--Sobic008G019900 Sobic004G187600 Sobic004G187600 Sobic004G106500--Sobic004G187600 Sobic004G106500--Sobic008G078800 Sobic004G106500--Sobic002G325500 Sobic004G037100 Sobic004G037100 Sobic004G106500--Sobic004G037100 Sobic004G046400 Sobic004G046400 Sobic004G106500--Sobic004G046400 Sobic004G106500--Sobic002G165020 Sobic006G266800 Sobic006G266800 Sobic004G106500--Sobic006G266800 Sobic004G106500--Sobic007G005100 Sobic006G183900 Sobic006G183900 Sobic002G165020--Sobic006G183900 Sobic004G248500 Sobic004G248500 Sobic002G165020--Sobic004G248500 Sobic008G035700 Sobic008G035700 Sobic002G165020--Sobic008G035700 Sobic007G109600 Sobic007G109600 Sobic002G165020--Sobic007G109600 Sobic003G287200 Sobic003G287200 Sobic002G165020--Sobic003G287200 Sobic006G117500 Sobic006G117500 Sobic002G165020--Sobic006G117500 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic002G165020--Sobic010G096700 Sobic002G235800 Sobic002G235800 Sobic002G165020--Sobic002G235800 Sobic010G274400 Sobic010G274400 Sobic002G165020--Sobic010G274400 Sobic002G417600--Sobic008G078800 Sobic002G381200 Sobic002G381200 Sobic002G417600--Sobic002G381200 Sobic001G300700 Sobic001G300700 Sobic002G417600--Sobic001G300700 Sobic002G417600--Sobic001G228900 Sobic002G417600--Sobic001G035300 Sobic002G417600--Sobic004G106500 Sobic002G417600--Sobic002G325500 Sobic003G249200 Sobic003G249200 Sobic002G417600--Sobic003G249200 Sobic002G417600--Sobic004G187600 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic008G019900--Sobic003G240400 Sobic006G019700 Sobic006G019700 Sobic008G019900--Sobic006G019700 Sobic006G028500 Sobic006G028500 Sobic008G019900--Sobic006G028500 Sobic003G182200 Sobic003G182200 Sobic008G019900--Sobic003G182200 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic008G019900--Sobic004G322800 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic008G019900--Sobic010G148800 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic008G019900--Sobic010G152400 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic008G019900--Sobic008G034900 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic008G019900--Sobic010G082000 Sobic003G080600 Sobic003G080600 SobicK010100--Sobic003G080600 SobicK010100--Sobic002G165020 Sobic010G219800 Sobic010G219800 SobicK010100--Sobic010G219800 SobicK010100--Sobic002G235800 Sobic005G161900 Sobic005G161900 SobicK010100--Sobic005G161900 SobicK010100--Sobic004G106500 SobicK010100--Sobic002G424500 SobicK010100--Sobic002G325500 Sobic006G246500 Sobic006G246500 SobicK010100--Sobic006G246500 Sobic006G030250 Sobic006G030250 Sobic010G127500--Sobic006G030250 Sobic010G127500--Sobic001G317900 Sobic010G127500--Sobic005G083932 Sobic010G127500--Sobic008G174400 Sobic010G127500--Sobic002G191200 Sobic002G373500 Sobic002G373500 Sobic010G127500--Sobic002G373500
Octagon: transcription factors


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