Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G019900.1
Synonym Sb08g001760
Functional annotation -
UniProt C5YQR4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028993
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G240400 leaf senescence related protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G019700 transferase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G028500 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 2, putative, expressed -
4 Sobic.003G182200 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1, putative, expressed -
5 Sobic.004G322800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
6 Sobic.010G148800 WRKY31, expressed -
7 Sobic.010G152400 glycosyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.008G034900 PAN domain-containing protein At5g03700 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.010G082000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
10 Sobic.004G306900 amino acid transporter, putative, expressed -
11 Sobic.008G019800 - -
12 Sobic.002G404100 annexin, putative, expressed -
13 Sobic.001G229000 xyloglucan galactosyltransferase KATAMARI1, putative, expressed -
14 Sobic.009G219200 expressed protein -
15 Sobic.001G438200 expressed protein -
16 Sobic.007G086300 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
17 Sobic.006G079300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
18 Sobic.002G255000 AIR12, putative, expressed -
19 Sobic.010G158400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G065800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G019900 Sobic008G019900 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic008G019900--Sobic003G240400 Sobic006G019700 Sobic006G019700 Sobic008G019900--Sobic006G019700 Sobic006G028500 Sobic006G028500 Sobic008G019900--Sobic006G028500 Sobic003G182200 Sobic003G182200 Sobic008G019900--Sobic003G182200 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic008G019900--Sobic004G322800 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic008G019900--Sobic010G148800 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic008G019900--Sobic010G152400 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic008G019900--Sobic008G034900 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic008G019900--Sobic010G082000 Sobic003G240400--Sobic010G082000 Sobic003G215300 Sobic003G215300 Sobic003G240400--Sobic003G215300 Sobic001G263300 Sobic001G263300 Sobic003G240400--Sobic001G263300 Sobic006G196400 Sobic006G196400 Sobic003G240400--Sobic006G196400 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic003G240400--Sobic007G090600 Sobic003G240400--Sobic010G152400 Sobic003G240400--Sobic006G028500 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic003G240400--Sobic003G000100 Sobic008G035800 Sobic008G035800 Sobic003G240400--Sobic008G035800 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic006G019700--Sobic004G306900 Sobic006G019700--Sobic003G182200 Sobic006G019700--Sobic006G028500 Sobic004G322100 Sobic004G322100 Sobic006G019700--Sobic004G322100 Sobic006G019700--Sobic010G082000 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic006G019700--Sobic006G092700 Sobic006G019700--Sobic010G152400 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic006G019700--Sobic006G135300 Sobic006G019700--Sobic003G000100 Sobic006G028500--Sobic004G306900 Sobic006G028500--Sobic006G019700 Sobic004G110700 Sobic004G110700 Sobic006G028500--Sobic004G110700 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic006G028500--Sobic001G229000 Sobic006G028500--Sobic003G240400 Sobic006G028500--Sobic010G082000 Sobic006G028500--Sobic004G322100 Sobic006G028500--Sobic010G152400 Sobic006G028500--Sobic003G000100 Sobic007G100700 Sobic007G100700 Sobic003G182200--Sobic007G100700 Sobic003G182200--Sobic006G019700 Sobic003G426500 Sobic003G426500 Sobic003G182200--Sobic003G426500 Sobic003G182200--Sobic006G092700 Sobic008G011700 Sobic008G011700 Sobic003G182200--Sobic008G011700 Sobic003G182200--Sobic004G306900 Sobic003G182200--Sobic004G322100 Sobic009G259800 Sobic009G259800 Sobic003G182200--Sobic009G259800 Sobic007G008600 Sobic007G008600 Sobic003G182200--Sobic007G008600 Sobic004G322800--Sobic010G148800 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic004G322800--Sobic006G079300 Sobic009G074500 Sobic009G074500 Sobic004G322800--Sobic009G074500 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic004G322800--Sobic001G242100 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic004G322800--Sobic001G438200 Sobic004G209400 Sobic004G209400 Sobic004G322800--Sobic004G209400 Sobic009G199001 Sobic009G199001 Sobic004G322800--Sobic009G199001 Sobic003G282200 Sobic003G282200 Sobic004G322800--Sobic003G282200 Sobic002G404100 Sobic002G404100 Sobic004G322800--Sobic002G404100 Sobic005G065900 Sobic005G065900 Sobic010G148800--Sobic005G065900 Sobic010G148800--Sobic004G322800 Sobic006G256900 Sobic006G256900 Sobic010G148800--Sobic006G256900 Sobic005G066432 Sobic005G066432 Sobic010G148800--Sobic005G066432 Sobic010G148800--Sobic009G199001 Sobic010G148800--Sobic002G404100 Sobic002G042200 Sobic002G042200 Sobic010G148800--Sobic002G042200 Sobic009G219200 Sobic009G219200 Sobic010G148800--Sobic009G219200 Sobic010G148800--Sobic006G079300 Sobic010G152400--Sobic003G000100 Sobic010G152400--Sobic004G322100 Sobic010G152400--Sobic003G240400 Sobic010G152400--Sobic004G306900 Sobic010G152400--Sobic006G092700 Sobic010G152400--Sobic010G082000 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic010G152400--Sobic006G003100 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic010G152400--Sobic004G106100 Sobic010G152400--Sobic006G019700 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic008G034900--Sobic007G086300 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic008G034900--Sobic002G392100 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic008G034900--Sobic009G065800 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic008G034900--Sobic001G319300 Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic008G034900--Sobic008G020000 Sobic008G022100 Sobic008G022100 Sobic008G034900--Sobic008G022100 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic008G034900--Sobic003G064800 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic008G034900--Sobic003G167300 Sobic002G068000 Sobic002G068000 Sobic008G034900--Sobic002G068000 Sobic010G082000--Sobic006G092700 Sobic010G082000--Sobic003G240400 Sobic010G082000--Sobic006G135300 Sobic010G082000--Sobic010G152400 Sobic010G082000--Sobic006G028500 Sobic010G082000--Sobic003G215300 Sobic010G082000--Sobic006G019700 Sobic007G073000 Sobic007G073000 Sobic010G082000--Sobic007G073000 Sobic010G082000--Sobic006G196400
Octagon: transcription factors


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