Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G034900.1
Synonym Sb08g003020
Functional annotation PAN domain-containing protein At5g03700 precursor, putative, expressed
UniProt C5YRQ1
Pfam PF00954 PF01453
Panther DB PTHR11795 PTHR11795:SF378
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03700 : D-mannose binding lectin protein with Apple-like carbohydrate-binding domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g05240.1 : PAN domain-containing protein At5g03700 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033678 , Zm00025a033474 , Zm00025a053872
Brachypodium KQJ99699
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G086300 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
2 Sobic.002G392100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.009G065800 - -
4 Sobic.001G319300 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
5 Sobic.008G020000 - -
6 Sobic.008G022100 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K14641: apyrase
7 Sobic.003G064800 dirigent, putative, expressed -
8 Sobic.003G167300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
9 Sobic.002G068000 expressed protein -
10 Sobic.001G182200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
11 Sobic.002G391400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
12 Sobic.006G205700 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
13 Sobic.004G306900 amino acid transporter, putative, expressed -
14 Sobic.001G438200 expressed protein -
15 Sobic.004G106100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
16 Sobic.002G255000 AIR12, putative, expressed -
17 Sobic.002G118801 - -
18 Sobic.003G319400 receptor protein kinase, putative, expressed -
19 Sobic.007G206800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@lectin-like protein kinase, putative, expressed -
20 Sobic.001G414800 dirigent, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic008G034900--Sobic007G086300 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic008G034900--Sobic002G392100 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic008G034900--Sobic009G065800 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic008G034900--Sobic001G319300 Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic008G034900--Sobic008G020000 Sobic008G022100 Sobic008G022100 Sobic008G034900--Sobic008G022100 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic008G034900--Sobic003G064800 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic008G034900--Sobic003G167300 Sobic002G068000 Sobic002G068000 Sobic008G034900--Sobic002G068000 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic007G086300--Sobic004G106100 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic007G086300--Sobic004G306900 Sobic007G086300--Sobic003G064800 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic007G086300--Sobic006G205700 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic007G086300--Sobic003G000100 Sobic007G086300--Sobic002G392100 Sobic007G086300--Sobic001G319300 Sobic007G086300--Sobic008G034900 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic007G086300--Sobic003G319400 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic002G392100--Sobic002G391400 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic002G392100--Sobic007G206800 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic002G392100--Sobic002G334000 Sobic002G392100--Sobic007G086300 Sobic002G392100--Sobic006G205700 Sobic002G392100--Sobic008G034900 Sobic002G392100--Sobic003G167300 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic002G392100--Sobic010G241900 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic002G392100--Sobic001G499900 Sobic003G282200 Sobic003G282200 Sobic009G065800--Sobic003G282200 Sobic009G065800--Sobic008G034900 Sobic009G065800--Sobic007G086300 Sobic009G065800--Sobic003G319400 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic009G065800--Sobic001G438200 Sobic002G118801 Sobic002G118801 Sobic009G065800--Sobic002G118801 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic009G065800--Sobic006G079300 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic009G065800--Sobic010G128400 Sobic004G029400 Sobic004G029400 Sobic009G065800--Sobic004G029400 Sobic009G186500 Sobic009G186500 Sobic001G319300--Sobic009G186500 Sobic001G319300--Sobic007G086300 Sobic002G255000 Sobic002G255000 Sobic001G319300--Sobic002G255000 Sobic001G319300--Sobic008G034900 Sobic004G110200 Sobic004G110200 Sobic001G319300--Sobic004G110200 Sobic001G319300--Sobic003G064800 Sobic001G319300--Sobic002G392100 Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic001G319300--Sobic003G400900 Sobic001G182200 Sobic001G182200 Sobic001G319300--Sobic001G182200 Sobic003G095100 Sobic003G095100 Sobic008G020000--Sobic003G095100 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic008G020000--Sobic003G441800 Sobic007G073100 Sobic007G073100 Sobic008G020000--Sobic007G073100 Sobic008G020000--Sobic006G205700 Sobic008G020000--Sobic003G167300 Sobic008G020000--Sobic008G034900 Sobic008G020000--Sobic002G118801 Sobic008G020000--Sobic004G029400 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic008G020000--Sobic003G053200 Sobic008G022100--Sobic003G167300 Sobic008G022100--Sobic001G499900 Sobic001G414800 Sobic001G414800 Sobic008G022100--Sobic001G414800 Sobic008G022100--Sobic006G205700 Sobic008G022100--Sobic007G206800 Sobic007G220400 Sobic007G220400 Sobic008G022100--Sobic007G220400 Sobic008G022100--Sobic002G391400 Sobic005G097400 Sobic005G097400 Sobic008G022100--Sobic005G097400 Sobic008G022100--Sobic010G241900 Sobic005G127400 Sobic005G127400 Sobic003G064800--Sobic005G127400 Sobic003G064800--Sobic002G255000 Sobic003G064800--Sobic004G306900 Sobic003G064800--Sobic001G438200 Sobic006G106900 Sobic006G106900 Sobic003G064800--Sobic006G106900 Sobic001G238200 Sobic001G238200 Sobic003G064800--Sobic001G238200 Sobic003G140700 Sobic003G140700 Sobic003G064800--Sobic003G140700 Sobic003G064800--Sobic007G086300 Sobic010G234500 Sobic010G234500 Sobic003G064800--Sobic010G234500 Sobic003G167300--Sobic001G499900 Sobic003G167300--Sobic006G205700 Sobic003G167300--Sobic008G022100 Sobic009G065700 Sobic009G065700 Sobic003G167300--Sobic009G065700 Sobic003G167300--Sobic003G441800 Sobic003G167300--Sobic002G391400 Sobic003G167300--Sobic010G241900 Sobic001G348400 Sobic001G348400 Sobic003G167300--Sobic001G348400 Sobic003G167300--Sobic003G095100 Sobic009G032900 Sobic009G032900 Sobic002G068000--Sobic009G032900 Sobic003G349400 Sobic003G349400 Sobic002G068000--Sobic003G349400 Sobic010G158400 Sobic010G158400 Sobic002G068000--Sobic010G158400 Sobic002G068000--Sobic010G234500 Sobic005G080600 Sobic005G080600 Sobic002G068000--Sobic005G080600 Sobic009G259800 Sobic009G259800 Sobic002G068000--Sobic009G259800 Sobic003G426500 Sobic003G426500 Sobic002G068000--Sobic003G426500 Sobic005G216700 Sobic005G216700 Sobic002G068000--Sobic005G216700 Sobic010G066800 Sobic010G066800 Sobic002G068000--Sobic010G066800
Octagon: transcription factors


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