Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G118801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W3E2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g47850.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G539200 expressed protein -
2 Sobic.005G097400 cell death associated protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G348400 expressed protein -
4 Sobic.003G167300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
5 Sobic.006G205700 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
6 Sobic.008G020000 - -
7 Sobic.007G086300 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
8 Sobic.003G053200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
9 Sobic.003G441800 RCLEA2 - Root cap and Late embryogenesis related family protein precursor, putative, expressed -
10 Sobic.004G029400 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
11 Sobic.004G106100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
12 Sobic.003G095100 glycosyltransferase protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G065800 - -
14 Sobic.002G392100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.010G031700 thaumatin, putative, expressed -
16 Sobic.010G191600 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.002G063600 disease resistance protein RPM1, putative -
18 Sobic.002G391400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
19 Sobic.003G206400 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
20 Sobic.005G217766 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G118801 Sobic002G118801 Sobic001G539200 Sobic001G539200 Sobic002G118801--Sobic001G539200 Sobic005G097400 Sobic005G097400 Sobic002G118801--Sobic005G097400 Sobic001G348400 Sobic001G348400 Sobic002G118801--Sobic001G348400 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic002G118801--Sobic003G167300 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic002G118801--Sobic006G205700 Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic002G118801--Sobic008G020000 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic002G118801--Sobic007G086300 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic002G118801--Sobic003G053200 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic002G118801--Sobic003G441800 Sobic001G539200--Sobic002G118801 Sobic005G119900 Sobic005G119900 Sobic001G539200--Sobic005G119900 Sobic010G087900 Sobic010G087900 Sobic001G539200--Sobic010G087900 Sobic001G539200--Sobic005G097400 Sobic001G539200--Sobic003G053200 Sobic004G029400 Sobic004G029400 Sobic001G539200--Sobic004G029400 Sobic001G539200--Sobic003G441800 Sobic008G109400 Sobic008G109400 Sobic001G539200--Sobic008G109400 Sobic003G441700 Sobic003G441700 Sobic001G539200--Sobic003G441700 Sobic010G191600 Sobic010G191600 Sobic005G097400--Sobic010G191600 Sobic005G097400--Sobic002G118801 Sobic005G097400--Sobic006G205700 Sobic005G097400--Sobic001G539200 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic005G097400--Sobic004G106100 Sobic001G414800 Sobic001G414800 Sobic005G097400--Sobic001G414800 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic005G097400--Sobic002G391400 Sobic005G097400--Sobic003G167300 Sobic005G097400--Sobic007G086300 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic001G348400--Sobic002G392000 Sobic001G153100 Sobic001G153100 Sobic001G348400--Sobic001G153100 Sobic002G063700 Sobic002G063700 Sobic001G348400--Sobic002G063700 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic001G348400--Sobic005G046400 Sobic009G055300 Sobic009G055300 Sobic001G348400--Sobic009G055300 Sobic006G230200 Sobic006G230200 Sobic001G348400--Sobic006G230200 Sobic009G065700 Sobic009G065700 Sobic001G348400--Sobic009G065700 Sobic001G348400--Sobic003G167300 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic001G348400--Sobic010G128300 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic003G167300--Sobic001G499900 Sobic003G167300--Sobic006G205700 Sobic008G022100 Sobic008G022100 Sobic003G167300--Sobic008G022100 Sobic003G167300--Sobic009G065700 Sobic003G167300--Sobic003G441800 Sobic003G167300--Sobic002G391400 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic003G167300--Sobic010G241900 Sobic003G167300--Sobic001G348400 Sobic003G095100 Sobic003G095100 Sobic003G167300--Sobic003G095100 Sobic006G205700--Sobic002G391400 Sobic006G205700--Sobic003G441800 Sobic006G205700--Sobic004G106100 Sobic006G205700--Sobic003G167300 Sobic006G205700--Sobic010G241900 Sobic006G205700--Sobic005G046400 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic006G205700--Sobic007G206800 Sobic003G441601 Sobic003G441601 Sobic006G205700--Sobic003G441601 Sobic006G205700--Sobic003G095100 Sobic008G020000--Sobic003G095100 Sobic008G020000--Sobic003G441800 Sobic007G073100 Sobic007G073100 Sobic008G020000--Sobic007G073100 Sobic008G020000--Sobic006G205700 Sobic008G020000--Sobic003G167300 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic008G020000--Sobic008G034900 Sobic008G020000--Sobic002G118801 Sobic008G020000--Sobic004G029400 Sobic008G020000--Sobic003G053200 Sobic007G086300--Sobic004G106100 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic007G086300--Sobic004G306900 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic007G086300--Sobic003G064800 Sobic007G086300--Sobic006G205700 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic007G086300--Sobic003G000100 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic007G086300--Sobic002G392100 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic007G086300--Sobic001G319300 Sobic007G086300--Sobic008G034900 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic007G086300--Sobic003G319400 Sobic003G053200--Sobic003G441800 Sobic003G053200--Sobic003G441700 Sobic001G301000 Sobic001G301000 Sobic003G053200--Sobic001G301000 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic003G053200--Sobic004G121600 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic003G053200--Sobic010G031700 Sobic003G053200--Sobic005G119900 Sobic003G053200--Sobic004G029400 Sobic001G231800 Sobic001G231800 Sobic003G053200--Sobic001G231800 Sobic007G037600 Sobic007G037600 Sobic003G053200--Sobic007G037600 Sobic003G441800--Sobic003G053200 Sobic003G441800--Sobic003G441700 Sobic003G441800--Sobic003G441601 Sobic003G441800--Sobic005G046400 Sobic003G441800--Sobic006G205700 Sobic003G441800--Sobic004G121600 Sobic003G441800--Sobic005G119900 Sobic003G441800--Sobic007G037600 Sobic003G441800--Sobic009G065700
Octagon: transcription factors


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