Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G063600.2,Sobic.002G063600.4,Sobic.002G063600.3
Synonym Sb02g005310
Functional annotation disease resistance protein RPM1, putative
UniProt A0A1W0W2K9 , A0A1W0W2H9 , A0A1W0W2M3
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF528
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G58410 : Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g46200.1 : Leucine Rich Repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G206400 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
2 Sobic.002G118801 - -
3 Sobic.002G377600 patatin, putative, expressed -
4 Sobic.001G539200 expressed protein -
5 Sobic.006G079300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.010G087900 similar to Aquaporin PIP1-6(PubMedID : 29862293)@-(PubMedID : 24879770)@Up-regulated by osmotic stress.(PubMedID : 24879770)@aquaporin protein, putative, expressed K09872: aquaporin PIP
7 Sobic.010G128400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
8 Sobic.010G031700 thaumatin, putative, expressed -
9 Sobic.006G277700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.003G337600 WRKY116, expressed -
11 Sobic.009G065800 - -
12 Sobic.003G095100 glycosyltransferase protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G233200 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G053200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
15 Sobic.008G020000 - -
16 Sobic.003G317900 lysM domain containing protein, putative -
17 Sobic.004G029400 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
18 Sobic.001G379400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
19 Sobic.003G167300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.001G232700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G063600 Sobic002G063600 Sobic003G206400 Sobic003G206400 Sobic002G063600--Sobic003G206400 Sobic002G118801 Sobic002G118801 Sobic002G063600--Sobic002G118801 Sobic002G377600 Sobic002G377600 Sobic002G063600--Sobic002G377600 Sobic001G539200 Sobic001G539200 Sobic002G063600--Sobic001G539200 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic002G063600--Sobic006G079300 Sobic010G087900 Sobic010G087900 Sobic002G063600--Sobic010G087900 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic002G063600--Sobic010G128400 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic002G063600--Sobic010G031700 Sobic006G277700 Sobic006G277700 Sobic002G063600--Sobic006G277700 Sobic003G206400--Sobic002G063600 Sobic003G206400--Sobic010G087900 Sobic003G206400--Sobic002G118801 Sobic003G206400--Sobic001G539200 Sobic006G018100 Sobic006G018100 Sobic003G206400--Sobic006G018100 Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic003G206400--Sobic008G020000 Sobic001G232700 Sobic001G232700 Sobic003G206400--Sobic001G232700 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic003G206400--Sobic009G065800 Sobic003G317900 Sobic003G317900 Sobic003G206400--Sobic003G317900 Sobic002G118801--Sobic001G539200 Sobic005G097400 Sobic005G097400 Sobic002G118801--Sobic005G097400 Sobic001G348400 Sobic001G348400 Sobic002G118801--Sobic001G348400 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic002G118801--Sobic003G167300 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic002G118801--Sobic006G205700 Sobic002G118801--Sobic008G020000 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic002G118801--Sobic007G086300 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic002G118801--Sobic003G053200 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic002G118801--Sobic003G441800 Sobic002G377600--Sobic002G063600 Sobic002G377600--Sobic006G277700 Sobic002G377600--Sobic003G206400 Sobic002G391800 Sobic002G391800 Sobic002G377600--Sobic002G391800 Sobic002G377600--Sobic006G079300 Sobic002G377600--Sobic010G087900 Sobic005G066432 Sobic005G066432 Sobic002G377600--Sobic005G066432 Sobic005G160700 Sobic005G160700 Sobic002G377600--Sobic005G160700 Sobic001G379400 Sobic001G379400 Sobic002G377600--Sobic001G379400 Sobic001G539200--Sobic002G118801 Sobic005G119900 Sobic005G119900 Sobic001G539200--Sobic005G119900 Sobic001G539200--Sobic010G087900 Sobic001G539200--Sobic005G097400 Sobic001G539200--Sobic003G053200 Sobic004G029400 Sobic004G029400 Sobic001G539200--Sobic004G029400 Sobic001G539200--Sobic003G441800 Sobic008G109400 Sobic008G109400 Sobic001G539200--Sobic008G109400 Sobic003G441700 Sobic003G441700 Sobic001G539200--Sobic003G441700 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic006G079300--Sobic001G438200 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic006G079300--Sobic001G242100 Sobic009G219200 Sobic009G219200 Sobic006G079300--Sobic009G219200 Sobic006G079300--Sobic005G160700 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic006G079300--Sobic001G229000 Sobic006G079300--Sobic001G379400 Sobic006G079300--Sobic009G065800 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic006G079300--Sobic004G322800 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic006G079300--Sobic010G148800 Sobic010G087900--Sobic001G539200 Sobic010G087900--Sobic003G206400 Sobic010G087900--Sobic008G020000 Sobic010G087900--Sobic003G053200 Sobic010G087900--Sobic002G063600 Sobic010G087900--Sobic003G317900 Sobic003G095100 Sobic003G095100 Sobic010G087900--Sobic003G095100 Sobic010G087900--Sobic004G029400 Sobic010G087900--Sobic010G031700 Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic010G128400--Sobic003G400900 Sobic010G128400--Sobic009G065800 Sobic010G128400--Sobic006G079300 Sobic010G128400--Sobic002G118801 Sobic010G128400--Sobic007G086300 Sobic010G128400--Sobic001G229000 Sobic010G128400--Sobic001G242100 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic010G128400--Sobic001G319300 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic010G128400--Sobic005G222500 Sobic010G031700--Sobic003G053200 Sobic007G037600 Sobic007G037600 Sobic010G031700--Sobic007G037600 Sobic010G031700--Sobic003G441800 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic010G031700--Sobic004G106100 Sobic010G031700--Sobic004G029400 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic010G031700--Sobic006G003100 Sobic010G031700--Sobic006G205700 Sobic002G233200 Sobic002G233200 Sobic010G031700--Sobic002G233200 Sobic003G353200 Sobic003G353200 Sobic010G031700--Sobic003G353200 Sobic006G174300 Sobic006G174300 Sobic006G277700--Sobic006G174300 Sobic002G053700 Sobic002G053700 Sobic006G277700--Sobic002G053700 Sobic006G277700--Sobic001G379400 Sobic003G053600 Sobic003G053600 Sobic006G277700--Sobic003G053600 Sobic003G337600 Sobic003G337600 Sobic006G277700--Sobic003G337600 Sobic006G277700--Sobic010G031700 Sobic006G277700--Sobic002G377600 Sobic003G020200 Sobic003G020200 Sobic006G277700--Sobic003G020200 Sobic010G147200 Sobic010G147200 Sobic006G277700--Sobic010G147200
Octagon: transcription factors


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