Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G020000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YQQ6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028993
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G095100 glycosyltransferase protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G441800 RCLEA2 - Root cap and Late embryogenesis related family protein precursor, putative, expressed -
3 Sobic.007G073100 amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed K13366: MPAO, polyamine oxidase
4 Sobic.006G205700 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
5 Sobic.003G167300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.008G034900 PAN domain-containing protein At5g03700 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.002G118801 - -
8 Sobic.004G029400 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
9 Sobic.003G053200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
10 Sobic.003G441601 - -
11 Sobic.009G065700 - -
12 Sobic.001G539200 expressed protein -
13 Sobic.002G391400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
14 Sobic.008G109400 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G046400 - -
16 Sobic.007G086300 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
17 Sobic.010G191700 cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.004G106100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
19 Sobic.005G217766 - -
20 Sobic.008G022100 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K14641: apyrase


Gene co-expression network
sample Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic003G095100 Sobic003G095100 Sobic008G020000--Sobic003G095100 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic008G020000--Sobic003G441800 Sobic007G073100 Sobic007G073100 Sobic008G020000--Sobic007G073100 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic008G020000--Sobic006G205700 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic008G020000--Sobic003G167300 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic008G020000--Sobic008G034900 Sobic002G118801 Sobic002G118801 Sobic008G020000--Sobic002G118801 Sobic004G029400 Sobic004G029400 Sobic008G020000--Sobic004G029400 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic008G020000--Sobic003G053200 Sobic003G095100--Sobic006G205700 Sobic003G095100--Sobic003G441800 Sobic003G095100--Sobic008G020000 Sobic003G095100--Sobic003G167300 Sobic003G282300 Sobic003G282300 Sobic003G095100--Sobic003G282300 Sobic003G441601 Sobic003G441601 Sobic003G095100--Sobic003G441601 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic003G095100--Sobic007G090600 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic003G095100--Sobic004G106100 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic003G095100--Sobic005G046400 Sobic003G441800--Sobic003G053200 Sobic003G441700 Sobic003G441700 Sobic003G441800--Sobic003G441700 Sobic003G441800--Sobic003G441601 Sobic003G441800--Sobic005G046400 Sobic003G441800--Sobic006G205700 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic003G441800--Sobic004G121600 Sobic005G119900 Sobic005G119900 Sobic003G441800--Sobic005G119900 Sobic007G037600 Sobic007G037600 Sobic003G441800--Sobic007G037600 Sobic009G065700 Sobic009G065700 Sobic003G441800--Sobic009G065700 Sobic007G073100--Sobic008G020000 Sobic008G022100 Sobic008G022100 Sobic007G073100--Sobic008G022100 Sobic007G073100--Sobic003G441800 Sobic008G109400 Sobic008G109400 Sobic007G073100--Sobic008G109400 Sobic007G073100--Sobic003G095100 Sobic007G073100--Sobic005G046400 Sobic007G073100--Sobic003G167300 Sobic007G073100--Sobic003G441601 Sobic007G073100--Sobic004G029400 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic006G205700--Sobic002G391400 Sobic006G205700--Sobic003G441800 Sobic006G205700--Sobic004G106100 Sobic006G205700--Sobic003G167300 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic006G205700--Sobic010G241900 Sobic006G205700--Sobic005G046400 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic006G205700--Sobic007G206800 Sobic006G205700--Sobic003G441601 Sobic006G205700--Sobic003G095100 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic003G167300--Sobic001G499900 Sobic003G167300--Sobic006G205700 Sobic003G167300--Sobic008G022100 Sobic003G167300--Sobic009G065700 Sobic003G167300--Sobic003G441800 Sobic003G167300--Sobic002G391400 Sobic003G167300--Sobic010G241900 Sobic001G348400 Sobic001G348400 Sobic003G167300--Sobic001G348400 Sobic003G167300--Sobic003G095100 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic008G034900--Sobic007G086300 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic008G034900--Sobic002G392100 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic008G034900--Sobic009G065800 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic008G034900--Sobic001G319300 Sobic008G034900--Sobic008G020000 Sobic008G034900--Sobic008G022100 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic008G034900--Sobic003G064800 Sobic008G034900--Sobic003G167300 Sobic002G068000 Sobic002G068000 Sobic008G034900--Sobic002G068000 Sobic001G539200 Sobic001G539200 Sobic002G118801--Sobic001G539200 Sobic005G097400 Sobic005G097400 Sobic002G118801--Sobic005G097400 Sobic002G118801--Sobic001G348400 Sobic002G118801--Sobic003G167300 Sobic002G118801--Sobic006G205700 Sobic002G118801--Sobic008G020000 Sobic002G118801--Sobic007G086300 Sobic002G118801--Sobic003G053200 Sobic002G118801--Sobic003G441800 Sobic004G029400--Sobic003G441800 Sobic004G029400--Sobic003G053200 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic004G029400--Sobic010G031700 Sobic004G029400--Sobic004G121600 Sobic004G029400--Sobic007G037600 Sobic004G029400--Sobic001G539200 Sobic009G181600 Sobic009G181600 Sobic004G029400--Sobic009G181600 Sobic004G029400--Sobic003G282300 Sobic004G029400--Sobic005G119900 Sobic003G053200--Sobic003G441800 Sobic003G053200--Sobic003G441700 Sobic001G301000 Sobic001G301000 Sobic003G053200--Sobic001G301000 Sobic003G053200--Sobic004G121600 Sobic003G053200--Sobic010G031700 Sobic003G053200--Sobic005G119900 Sobic003G053200--Sobic004G029400 Sobic001G231800 Sobic001G231800 Sobic003G053200--Sobic001G231800 Sobic003G053200--Sobic007G037600
Octagon: transcription factors


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