Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G377600.1
Synonym Sb02g039470, PLP2, PLA2A, PLAIIA
Functional annotation patatin, putative, expressed
UniProt C5X2F7
Pfam PF01734
Panther DB PTHR32176
NCBI CDD KOG0513; Ca2+-independent phospholipase A2
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006629; lipid metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26560 : phospholipase A 2A
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g27610.1 : patatin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002743
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G074970.1 , HORVU4Hr1G074970.3 , HORVU4Hr1G074970.2 , HORVU4Hr1G074970.4
Wheat TraesCS4D02G284700 , TraesCS4A02G018100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G063600 disease resistance protein RPM1, putative -
2 Sobic.006G277700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.003G206400 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
4 Sobic.002G391800 peroxidase, putative, expressed K00430: peroxidase
5 Sobic.006G079300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.010G087900 similar to Aquaporin PIP1-6(PubMedID : 29862293)@-(PubMedID : 24879770)@Up-regulated by osmotic stress.(PubMedID : 24879770)@aquaporin protein, putative, expressed K09872: aquaporin PIP
7 Sobic.005G066432 - -
8 Sobic.005G160700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G379400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.001G539200 expressed protein -
11 Sobic.003G317900 lysM domain containing protein, putative -
12 Sobic.003G337600 WRKY116, expressed -
13 Sobic.002G118801 - -
14 Sobic.010G031700 thaumatin, putative, expressed -
15 Sobic.006G174300 cis-zeatin O-glucosyltransferase, putative, expressed K13495: cis-zeatin O-glucosyltransferase
16 Sobic.003G053200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
17 Sobic.009G065800 - -
18 Sobic.001G231800 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.002G050300 LTPL100 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.004G029400 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase


Gene co-expression network
sample Sobic002G377600 Sobic002G377600 Sobic002G063600 Sobic002G063600 Sobic002G377600--Sobic002G063600 Sobic006G277700 Sobic006G277700 Sobic002G377600--Sobic006G277700 Sobic003G206400 Sobic003G206400 Sobic002G377600--Sobic003G206400 Sobic002G391800 Sobic002G391800 Sobic002G377600--Sobic002G391800 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic002G377600--Sobic006G079300 Sobic010G087900 Sobic010G087900 Sobic002G377600--Sobic010G087900 Sobic005G066432 Sobic005G066432 Sobic002G377600--Sobic005G066432 Sobic005G160700 Sobic005G160700 Sobic002G377600--Sobic005G160700 Sobic001G379400 Sobic001G379400 Sobic002G377600--Sobic001G379400 Sobic002G063600--Sobic003G206400 Sobic002G118801 Sobic002G118801 Sobic002G063600--Sobic002G118801 Sobic002G063600--Sobic002G377600 Sobic001G539200 Sobic001G539200 Sobic002G063600--Sobic001G539200 Sobic002G063600--Sobic006G079300 Sobic002G063600--Sobic010G087900 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic002G063600--Sobic010G128400 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic002G063600--Sobic010G031700 Sobic002G063600--Sobic006G277700 Sobic006G174300 Sobic006G174300 Sobic006G277700--Sobic006G174300 Sobic002G053700 Sobic002G053700 Sobic006G277700--Sobic002G053700 Sobic006G277700--Sobic001G379400 Sobic003G053600 Sobic003G053600 Sobic006G277700--Sobic003G053600 Sobic003G337600 Sobic003G337600 Sobic006G277700--Sobic003G337600 Sobic006G277700--Sobic010G031700 Sobic006G277700--Sobic002G377600 Sobic003G020200 Sobic003G020200 Sobic006G277700--Sobic003G020200 Sobic010G147200 Sobic010G147200 Sobic006G277700--Sobic010G147200 Sobic003G206400--Sobic002G063600 Sobic003G206400--Sobic010G087900 Sobic003G206400--Sobic002G118801 Sobic003G206400--Sobic001G539200 Sobic006G018100 Sobic006G018100 Sobic003G206400--Sobic006G018100 Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic003G206400--Sobic008G020000 Sobic001G232700 Sobic001G232700 Sobic003G206400--Sobic001G232700 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic003G206400--Sobic009G065800 Sobic003G317900 Sobic003G317900 Sobic003G206400--Sobic003G317900 Sobic001G234900 Sobic001G234900 Sobic002G391800--Sobic001G234900 Sobic002G391800--Sobic005G160700 Sobic001G342400 Sobic001G342400 Sobic002G391800--Sobic001G342400 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic002G391800--Sobic001G242100 Sobic002G391800--Sobic001G379400 Sobic002G391800--Sobic001G232700 Sobic002G391800--Sobic002G377600 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic002G391800--Sobic005G222500 Sobic010G045500 Sobic010G045500 Sobic002G391800--Sobic010G045500 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic006G079300--Sobic001G438200 Sobic006G079300--Sobic001G242100 Sobic009G219200 Sobic009G219200 Sobic006G079300--Sobic009G219200 Sobic006G079300--Sobic005G160700 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic006G079300--Sobic001G229000 Sobic006G079300--Sobic001G379400 Sobic006G079300--Sobic009G065800 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic006G079300--Sobic004G322800 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic006G079300--Sobic010G148800 Sobic010G087900--Sobic001G539200 Sobic010G087900--Sobic003G206400 Sobic010G087900--Sobic008G020000 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic010G087900--Sobic003G053200 Sobic010G087900--Sobic002G063600 Sobic010G087900--Sobic003G317900 Sobic003G095100 Sobic003G095100 Sobic010G087900--Sobic003G095100 Sobic004G029400 Sobic004G029400 Sobic010G087900--Sobic004G029400 Sobic010G087900--Sobic010G031700 Sobic005G065900 Sobic005G065900 Sobic005G066432--Sobic005G065900 Sobic005G066432--Sobic010G148800 Sobic005G066100 Sobic005G066100 Sobic005G066432--Sobic005G066100 Sobic005G066432--Sobic006G079300 Sobic005G066432--Sobic006G277700 Sobic005G066432--Sobic003G020200 Sobic004G009400 Sobic004G009400 Sobic005G066432--Sobic004G009400 Sobic005G066432--Sobic005G160700 Sobic005G066432--Sobic004G322800 Sobic005G160700--Sobic006G079300 Sobic005G160700--Sobic001G379400 Sobic008G019800 Sobic008G019800 Sobic005G160700--Sobic008G019800 Sobic005G160700--Sobic001G242100 Sobic005G160700--Sobic002G391800 Sobic007G158600 Sobic007G158600 Sobic005G160700--Sobic007G158600 Sobic006G089000 Sobic006G089000 Sobic005G160700--Sobic006G089000 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic005G160700--Sobic001G502000 Sobic005G160700--Sobic004G322800 Sobic001G379400--Sobic006G089000 Sobic001G379400--Sobic010G147200 Sobic001G379400--Sobic005G160700 Sobic001G379400--Sobic006G277700 Sobic001G379400--Sobic006G079300 Sobic001G379400--Sobic001G234900 Sobic001G379400--Sobic003G337600 Sobic001G379400--Sobic006G174300 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic001G379400--Sobic006G003100
Octagon: transcription factors


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