Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G066432.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RGZ5
Pfam -
Panther DB PTHR33548 PTHR33548:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g31540.1 : glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012780 , Zm00025a012766 , Zm00025a012779
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G065900 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.010G148800 WRKY31, expressed -
3 Sobic.005G066100 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.006G079300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
5 Sobic.006G277700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.003G020200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
7 Sobic.004G009400 transporter, major facilitator family, putative, expressed K02575: NRT, narK, nrtP, MFS transporter, NNP family, nitrate/nitrite transporter
8 Sobic.005G160700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G322800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
10 Sobic.002G377600 patatin, putative, expressed -
11 Sobic.005G072900 stress responsive protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G322100 polyphenol oxidase, putative, expressed K00422: polyphenol oxidase
13 Sobic.007G154200 aspartic proteinase nepenthesin-1 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.008G019800 - -
15 Sobic.002G404100 annexin, putative, expressed -
16 Sobic.002G053700 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
17 Sobic.003G228700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
18 Sobic.009G199001 - -
19 Sobic.009G065800 - -
20 Sobic.001G379400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase


Gene co-expression network
sample Sobic005G066432 Sobic005G066432 Sobic005G065900 Sobic005G065900 Sobic005G066432--Sobic005G065900 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic005G066432--Sobic010G148800 Sobic005G066100 Sobic005G066100 Sobic005G066432--Sobic005G066100 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic005G066432--Sobic006G079300 Sobic006G277700 Sobic006G277700 Sobic005G066432--Sobic006G277700 Sobic003G020200 Sobic003G020200 Sobic005G066432--Sobic003G020200 Sobic004G009400 Sobic004G009400 Sobic005G066432--Sobic004G009400 Sobic005G160700 Sobic005G160700 Sobic005G066432--Sobic005G160700 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic005G066432--Sobic004G322800 Sobic005G065900--Sobic010G148800 Sobic005G065900--Sobic005G066432 Sobic006G256900 Sobic006G256900 Sobic005G065900--Sobic006G256900 Sobic002G042200 Sobic002G042200 Sobic005G065900--Sobic002G042200 Sobic009G199001 Sobic009G199001 Sobic005G065900--Sobic009G199001 Sobic002G404100 Sobic002G404100 Sobic005G065900--Sobic002G404100 Sobic005G065900--Sobic004G322800 Sobic005G065900--Sobic005G066100 Sobic007G050200 Sobic007G050200 Sobic005G065900--Sobic007G050200 Sobic010G148800--Sobic005G065900 Sobic010G148800--Sobic004G322800 Sobic010G148800--Sobic006G256900 Sobic010G148800--Sobic005G066432 Sobic010G148800--Sobic009G199001 Sobic010G148800--Sobic002G404100 Sobic010G148800--Sobic002G042200 Sobic009G219200 Sobic009G219200 Sobic010G148800--Sobic009G219200 Sobic010G148800--Sobic006G079300 Sobic005G066100--Sobic005G066432 Sobic004G202400 Sobic004G202400 Sobic005G066100--Sobic004G202400 Sobic005G066100--Sobic005G065900 SobicK026900 SobicK026900 Sobic005G066100--SobicK026900 Sobic007G204700 Sobic007G204700 Sobic005G066100--Sobic007G204700 Sobic002G425000 Sobic002G425000 Sobic005G066100--Sobic002G425000 Sobic005G066100--Sobic010G148800 Sobic008G127933 Sobic008G127933 Sobic005G066100--Sobic008G127933 Sobic010G158500 Sobic010G158500 Sobic005G066100--Sobic010G158500 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic006G079300--Sobic001G438200 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic006G079300--Sobic001G242100 Sobic006G079300--Sobic009G219200 Sobic006G079300--Sobic005G160700 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic006G079300--Sobic001G229000 Sobic001G379400 Sobic001G379400 Sobic006G079300--Sobic001G379400 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic006G079300--Sobic009G065800 Sobic006G079300--Sobic004G322800 Sobic006G079300--Sobic010G148800 Sobic006G174300 Sobic006G174300 Sobic006G277700--Sobic006G174300 Sobic002G053700 Sobic002G053700 Sobic006G277700--Sobic002G053700 Sobic006G277700--Sobic001G379400 Sobic003G053600 Sobic003G053600 Sobic006G277700--Sobic003G053600 Sobic003G337600 Sobic003G337600 Sobic006G277700--Sobic003G337600 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic006G277700--Sobic010G031700 Sobic002G377600 Sobic002G377600 Sobic006G277700--Sobic002G377600 Sobic006G277700--Sobic003G020200 Sobic010G147200 Sobic010G147200 Sobic006G277700--Sobic010G147200 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic003G020200--Sobic003G319400 Sobic003G020200--Sobic010G148800 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic003G020200--Sobic004G306900 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic003G020200--Sobic006G003100 Sobic003G020200--Sobic001G438200 Sobic003G020200--Sobic006G174300 Sobic003G020200--Sobic006G079300 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic003G020200--Sobic010G152400 Sobic003G020200--Sobic010G031700 Sobic005G063400 Sobic005G063400 Sobic004G009400--Sobic005G063400 Sobic004G009400--Sobic003G053600 Sobic004G009400--Sobic002G053700 Sobic007G057400 Sobic007G057400 Sobic004G009400--Sobic007G057400 Sobic004G009400--Sobic006G277700 Sobic007G015200 Sobic007G015200 Sobic004G009400--Sobic007G015200 Sobic003G322100 Sobic003G322100 Sobic004G009400--Sobic003G322100 Sobic004G009400--Sobic005G066432 Sobic001G360500 Sobic001G360500 Sobic004G009400--Sobic001G360500 Sobic005G160700--Sobic006G079300 Sobic005G160700--Sobic001G379400 Sobic008G019800 Sobic008G019800 Sobic005G160700--Sobic008G019800 Sobic005G160700--Sobic001G242100 Sobic002G391800 Sobic002G391800 Sobic005G160700--Sobic002G391800 Sobic007G158600 Sobic007G158600 Sobic005G160700--Sobic007G158600 Sobic006G089000 Sobic006G089000 Sobic005G160700--Sobic006G089000 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic005G160700--Sobic001G502000 Sobic005G160700--Sobic004G322800 Sobic004G322800--Sobic010G148800 Sobic004G322800--Sobic006G079300 Sobic009G074500 Sobic009G074500 Sobic004G322800--Sobic009G074500 Sobic004G322800--Sobic001G242100 Sobic004G322800--Sobic001G438200 Sobic004G209400 Sobic004G209400 Sobic004G322800--Sobic004G209400 Sobic004G322800--Sobic009G199001 Sobic003G282200 Sobic003G282200 Sobic004G322800--Sobic003G282200 Sobic004G322800--Sobic002G404100
Octagon: transcription factors


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