Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G232700.1
Synonym Sb01g020390
Functional annotation -
UniProt C5WZJ6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
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Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G242100 expressed protein -
2 Sobic.002G391800 peroxidase, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.005G222500 phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
4 Sobic.003G206400 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
5 Sobic.010G128400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.009G065800 - -
7 Sobic.002G301900 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G063600 disease resistance protein RPM1, putative -
9 Sobic.010G045500 AMP-binding enzyme, putative, expressed K01897: ACSL, long-chain acyl-CoA synthetase
10 Sobic.003G400900 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
11 Sobic.004G299600 - -
12 Sobic.005G038100 sialyltransferase family domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G079300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
14 Sobic.008G002800 fatty acid desaturase, putative, expressed K10257: FAD3, FAD7, FAD8, acyl-lipid omega-3 desaturase
15 Sobic.003G282200 POEI44 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
16 Sobic.006G018100 cupin domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G317900 lysM domain containing protein, putative -
18 Sobic.001G502000 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
19 Sobic.004G322800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
20 Sobic.005G160700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G232700 Sobic001G232700 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic001G232700--Sobic001G242100 Sobic002G391800 Sobic002G391800 Sobic001G232700--Sobic002G391800 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic001G232700--Sobic005G222500 Sobic003G206400 Sobic003G206400 Sobic001G232700--Sobic003G206400 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic001G232700--Sobic010G128400 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic001G232700--Sobic009G065800 Sobic002G301900 Sobic002G301900 Sobic001G232700--Sobic002G301900 Sobic002G063600 Sobic002G063600 Sobic001G232700--Sobic002G063600 Sobic010G045500 Sobic010G045500 Sobic001G232700--Sobic010G045500 Sobic001G242100--Sobic002G301900 Sobic001G242100--Sobic010G045500 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic001G242100--Sobic006G079300 Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic001G242100--Sobic003G400900 Sobic001G242100--Sobic005G222500 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic001G242100--Sobic001G502000 Sobic001G242100--Sobic001G232700 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic001G242100--Sobic004G322800 Sobic005G160700 Sobic005G160700 Sobic001G242100--Sobic005G160700 Sobic001G234900 Sobic001G234900 Sobic002G391800--Sobic001G234900 Sobic002G391800--Sobic005G160700 Sobic001G342400 Sobic001G342400 Sobic002G391800--Sobic001G342400 Sobic002G391800--Sobic001G242100 Sobic001G379400 Sobic001G379400 Sobic002G391800--Sobic001G379400 Sobic002G391800--Sobic001G232700 Sobic002G377600 Sobic002G377600 Sobic002G391800--Sobic002G377600 Sobic002G391800--Sobic005G222500 Sobic002G391800--Sobic010G045500 Sobic005G222500--Sobic001G502000 Sobic007G158800 Sobic007G158800 Sobic005G222500--Sobic007G158800 Sobic001G261509 Sobic001G261509 Sobic005G222500--Sobic001G261509 Sobic004G299600 Sobic004G299600 Sobic005G222500--Sobic004G299600 Sobic005G222500--Sobic003G400900 Sobic005G222500--Sobic001G242100 Sobic005G222500--Sobic002G301900 Sobic005G222500--Sobic009G065800 Sobic007G158600 Sobic007G158600 Sobic005G222500--Sobic007G158600 Sobic003G206400--Sobic002G063600 Sobic010G087900 Sobic010G087900 Sobic003G206400--Sobic010G087900 Sobic002G118801 Sobic002G118801 Sobic003G206400--Sobic002G118801 Sobic001G539200 Sobic001G539200 Sobic003G206400--Sobic001G539200 Sobic006G018100 Sobic006G018100 Sobic003G206400--Sobic006G018100 Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic003G206400--Sobic008G020000 Sobic003G206400--Sobic001G232700 Sobic003G206400--Sobic009G065800 Sobic003G317900 Sobic003G317900 Sobic003G206400--Sobic003G317900 Sobic010G128400--Sobic003G400900 Sobic010G128400--Sobic009G065800 Sobic010G128400--Sobic006G079300 Sobic010G128400--Sobic002G118801 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic010G128400--Sobic007G086300 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic010G128400--Sobic001G229000 Sobic010G128400--Sobic001G242100 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic010G128400--Sobic001G319300 Sobic010G128400--Sobic005G222500 Sobic003G282200 Sobic003G282200 Sobic009G065800--Sobic003G282200 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic009G065800--Sobic008G034900 Sobic009G065800--Sobic007G086300 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic009G065800--Sobic003G319400 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic009G065800--Sobic001G438200 Sobic009G065800--Sobic002G118801 Sobic009G065800--Sobic006G079300 Sobic009G065800--Sobic010G128400 Sobic004G029400 Sobic004G029400 Sobic009G065800--Sobic004G029400 Sobic002G301900--Sobic001G242100 Sobic002G301900--Sobic010G045500 Sobic002G301900--Sobic001G502000 Sobic006G170600 Sobic006G170600 Sobic002G301900--Sobic006G170600 Sobic002G301900--Sobic003G400900 Sobic002G301900--Sobic005G222500 Sobic002G301900--Sobic004G299600 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic002G301900--Sobic002G183700 Sobic004G180700 Sobic004G180700 Sobic002G301900--Sobic004G180700 Sobic002G063600--Sobic003G206400 Sobic002G063600--Sobic002G118801 Sobic002G063600--Sobic002G377600 Sobic002G063600--Sobic001G539200 Sobic002G063600--Sobic006G079300 Sobic002G063600--Sobic010G087900 Sobic002G063600--Sobic010G128400 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic002G063600--Sobic010G031700 Sobic006G277700 Sobic006G277700 Sobic002G063600--Sobic006G277700 Sobic010G045500--Sobic001G242100 Sobic010G045500--Sobic002G301900 Sobic006G234466 Sobic006G234466 Sobic010G045500--Sobic006G234466 Sobic010G045500--Sobic004G180700 Sobic005G215400 Sobic005G215400 Sobic010G045500--Sobic005G215400 Sobic010G045500--Sobic004G322800 Sobic010G270700 Sobic010G270700 Sobic010G045500--Sobic010G270700 Sobic004G301600 Sobic004G301600 Sobic010G045500--Sobic004G301600 Sobic008G128200 Sobic008G128200 Sobic010G045500--Sobic008G128200
Octagon: transcription factors


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