Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G018100.1
Synonym Sb06g001690
Functional annotation cupin domain containing protein, expressed
UniProt C5YC92
Pfam PF07883
Panther DB PTHR31238 PTHR31238:SF38
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G05950 : RmlC-like cupins superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g13440.2 : cupin domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012376 , Zm00025a055675
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G206400 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
2 Sobic.008G034900 PAN domain-containing protein At5g03700 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.008G020000 - -
4 Sobic.002G392100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
5 Sobic.002G118801 - -
6 Sobic.009G065800 - -
7 Sobic.007G085500 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
8 Sobic.001G232700 - -
9 Sobic.002G063600 disease resistance protein RPM1, putative -
10 Sobic.010G128400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
11 Sobic.003G400900 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
12 Sobic.001G319300 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
13 Sobic.007G126800 expressed protein -
14 Sobic.007G073100 amine oxidase, flavin-containing, domain containing protein, expressed K13366: MPAO, polyamine oxidase
15 Sobic.006G079300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
16 Sobic.005G226200 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase
17 Sobic.004G110200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
18 Sobic.007G086300 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
19 Sobic.005G038100 sialyltransferase family domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G182200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G018100 Sobic006G018100 Sobic003G206400 Sobic003G206400 Sobic006G018100--Sobic003G206400 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic006G018100--Sobic008G034900 Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic006G018100--Sobic008G020000 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic006G018100--Sobic002G392100 Sobic002G118801 Sobic002G118801 Sobic006G018100--Sobic002G118801 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic006G018100--Sobic009G065800 Sobic007G085500 Sobic007G085500 Sobic006G018100--Sobic007G085500 Sobic001G232700 Sobic001G232700 Sobic006G018100--Sobic001G232700 Sobic002G063600 Sobic002G063600 Sobic006G018100--Sobic002G063600 Sobic003G206400--Sobic002G063600 Sobic010G087900 Sobic010G087900 Sobic003G206400--Sobic010G087900 Sobic003G206400--Sobic002G118801 Sobic001G539200 Sobic001G539200 Sobic003G206400--Sobic001G539200 Sobic003G206400--Sobic006G018100 Sobic003G206400--Sobic008G020000 Sobic003G206400--Sobic001G232700 Sobic003G206400--Sobic009G065800 Sobic003G317900 Sobic003G317900 Sobic003G206400--Sobic003G317900 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic008G034900--Sobic007G086300 Sobic008G034900--Sobic002G392100 Sobic008G034900--Sobic009G065800 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic008G034900--Sobic001G319300 Sobic008G034900--Sobic008G020000 Sobic008G022100 Sobic008G022100 Sobic008G034900--Sobic008G022100 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic008G034900--Sobic003G064800 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic008G034900--Sobic003G167300 Sobic002G068000 Sobic002G068000 Sobic008G034900--Sobic002G068000 Sobic003G095100 Sobic003G095100 Sobic008G020000--Sobic003G095100 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic008G020000--Sobic003G441800 Sobic007G073100 Sobic007G073100 Sobic008G020000--Sobic007G073100 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic008G020000--Sobic006G205700 Sobic008G020000--Sobic003G167300 Sobic008G020000--Sobic008G034900 Sobic008G020000--Sobic002G118801 Sobic004G029400 Sobic004G029400 Sobic008G020000--Sobic004G029400 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic008G020000--Sobic003G053200 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic002G392100--Sobic002G391400 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic002G392100--Sobic007G206800 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic002G392100--Sobic002G334000 Sobic002G392100--Sobic007G086300 Sobic002G392100--Sobic006G205700 Sobic002G392100--Sobic008G034900 Sobic002G392100--Sobic003G167300 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic002G392100--Sobic010G241900 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic002G392100--Sobic001G499900 Sobic002G118801--Sobic001G539200 Sobic005G097400 Sobic005G097400 Sobic002G118801--Sobic005G097400 Sobic001G348400 Sobic001G348400 Sobic002G118801--Sobic001G348400 Sobic002G118801--Sobic003G167300 Sobic002G118801--Sobic006G205700 Sobic002G118801--Sobic008G020000 Sobic002G118801--Sobic007G086300 Sobic002G118801--Sobic003G053200 Sobic002G118801--Sobic003G441800 Sobic003G282200 Sobic003G282200 Sobic009G065800--Sobic003G282200 Sobic009G065800--Sobic008G034900 Sobic009G065800--Sobic007G086300 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic009G065800--Sobic003G319400 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic009G065800--Sobic001G438200 Sobic009G065800--Sobic002G118801 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic009G065800--Sobic006G079300 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic009G065800--Sobic010G128400 Sobic009G065800--Sobic004G029400 Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic007G085500--Sobic003G400900 Sobic007G085500--Sobic010G128400 Sobic004G066700 Sobic004G066700 Sobic007G085500--Sobic004G066700 Sobic007G126800 Sobic007G126800 Sobic007G085500--Sobic007G126800 Sobic002G003700 Sobic002G003700 Sobic007G085500--Sobic002G003700 Sobic006G170600 Sobic006G170600 Sobic007G085500--Sobic006G170600 Sobic007G085500--Sobic002G392100 Sobic010G128700 Sobic010G128700 Sobic007G085500--Sobic010G128700 Sobic004G299600 Sobic004G299600 Sobic007G085500--Sobic004G299600 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic001G232700--Sobic001G242100 Sobic002G391800 Sobic002G391800 Sobic001G232700--Sobic002G391800 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic001G232700--Sobic005G222500 Sobic001G232700--Sobic003G206400 Sobic001G232700--Sobic010G128400 Sobic001G232700--Sobic009G065800 Sobic002G301900 Sobic002G301900 Sobic001G232700--Sobic002G301900 Sobic001G232700--Sobic002G063600 Sobic010G045500 Sobic010G045500 Sobic001G232700--Sobic010G045500 Sobic002G063600--Sobic003G206400 Sobic002G063600--Sobic002G118801 Sobic002G377600 Sobic002G377600 Sobic002G063600--Sobic002G377600 Sobic002G063600--Sobic001G539200 Sobic002G063600--Sobic006G079300 Sobic002G063600--Sobic010G087900 Sobic002G063600--Sobic010G128400 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic002G063600--Sobic010G031700 Sobic006G277700 Sobic006G277700 Sobic002G063600--Sobic006G277700
Octagon: transcription factors


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