Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G400900.1
Synonym Sb03g043720
Functional annotation keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed
UniProt C5XG74
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g68740.1 : keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039348
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G128400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
2 Sobic.001G319300 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
3 Sobic.001G502000 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
4 Sobic.001G229000 xyloglucan galactosyltransferase KATAMARI1, putative, expressed -
5 Sobic.001G242100 expressed protein -
6 Sobic.005G222500 phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
7 Sobic.004G299600 - -
8 Sobic.007G158800 patatin, putative, expressed -
9 Sobic.007G085500 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
10 Sobic.009G186500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
11 Sobic.006G170600 tonoplast intrinsic protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
12 Sobic.006G079300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
13 Sobic.007G086300 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
14 Sobic.002G301900 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G438200 expressed protein -
16 Sobic.010G128700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
17 Sobic.009G065800 - -
18 Sobic.006G225500 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G255000 AIR12, putative, expressed -
20 Sobic.007G126800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic003G400900--Sobic010G128400 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic003G400900--Sobic001G319300 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic003G400900--Sobic001G502000 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic003G400900--Sobic001G229000 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic003G400900--Sobic001G242100 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic003G400900--Sobic005G222500 Sobic004G299600 Sobic004G299600 Sobic003G400900--Sobic004G299600 Sobic007G158800 Sobic007G158800 Sobic003G400900--Sobic007G158800 Sobic007G085500 Sobic007G085500 Sobic003G400900--Sobic007G085500 Sobic010G128400--Sobic003G400900 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic010G128400--Sobic009G065800 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic010G128400--Sobic006G079300 Sobic002G118801 Sobic002G118801 Sobic010G128400--Sobic002G118801 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic010G128400--Sobic007G086300 Sobic010G128400--Sobic001G229000 Sobic010G128400--Sobic001G242100 Sobic010G128400--Sobic001G319300 Sobic010G128400--Sobic005G222500 Sobic009G186500 Sobic009G186500 Sobic001G319300--Sobic009G186500 Sobic001G319300--Sobic007G086300 Sobic002G255000 Sobic002G255000 Sobic001G319300--Sobic002G255000 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic001G319300--Sobic008G034900 Sobic004G110200 Sobic004G110200 Sobic001G319300--Sobic004G110200 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic001G319300--Sobic003G064800 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic001G319300--Sobic002G392100 Sobic001G319300--Sobic003G400900 Sobic001G182200 Sobic001G182200 Sobic001G319300--Sobic001G182200 Sobic001G502000--Sobic007G158800 Sobic001G502000--Sobic005G222500 Sobic006G089000 Sobic006G089000 Sobic001G502000--Sobic006G089000 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic001G502000--Sobic002G183700 Sobic001G502000--Sobic001G229000 Sobic001G261509 Sobic001G261509 Sobic001G502000--Sobic001G261509 Sobic004G029100 Sobic004G029100 Sobic001G502000--Sobic004G029100 Sobic001G502000--Sobic003G400900 Sobic008G019800 Sobic008G019800 Sobic001G502000--Sobic008G019800 Sobic001G229000--Sobic007G158800 Sobic006G028500 Sobic006G028500 Sobic001G229000--Sobic006G028500 Sobic004G322100 Sobic004G322100 Sobic001G229000--Sobic004G322100 Sobic001G229000--Sobic001G502000 Sobic001G229000--Sobic007G086300 Sobic004G110700 Sobic004G110700 Sobic001G229000--Sobic004G110700 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic001G229000--Sobic010G152400 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic001G229000--Sobic004G306900 Sobic001G229000--Sobic008G019800 Sobic002G301900 Sobic002G301900 Sobic001G242100--Sobic002G301900 Sobic010G045500 Sobic010G045500 Sobic001G242100--Sobic010G045500 Sobic001G242100--Sobic006G079300 Sobic001G242100--Sobic003G400900 Sobic001G242100--Sobic005G222500 Sobic001G242100--Sobic001G502000 Sobic001G232700 Sobic001G232700 Sobic001G242100--Sobic001G232700 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic001G242100--Sobic004G322800 Sobic005G160700 Sobic005G160700 Sobic001G242100--Sobic005G160700 Sobic005G222500--Sobic001G502000 Sobic005G222500--Sobic007G158800 Sobic005G222500--Sobic001G261509 Sobic005G222500--Sobic004G299600 Sobic005G222500--Sobic003G400900 Sobic005G222500--Sobic001G242100 Sobic005G222500--Sobic002G301900 Sobic005G222500--Sobic009G065800 Sobic007G158600 Sobic007G158600 Sobic005G222500--Sobic007G158600 Sobic004G299600--Sobic005G222500 Sobic004G299600--Sobic001G502000 Sobic004G299600--Sobic003G400900 Sobic004G299600--Sobic002G301900 Sobic004G299600--Sobic007G158800 Sobic004G299600--Sobic001G242100 Sobic004G066700 Sobic004G066700 Sobic004G299600--Sobic004G066700 Sobic004G299600--Sobic001G261509 Sobic006G277500 Sobic006G277500 Sobic004G299600--Sobic006G277500 Sobic007G158800--Sobic001G502000 Sobic007G158800--Sobic001G229000 Sobic007G158800--Sobic002G183700 Sobic007G158800--Sobic006G089000 Sobic007G158800--Sobic005G222500 Sobic007G158800--Sobic004G029100 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic007G158800--Sobic003G000100 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic007G158800--Sobic006G003100 Sobic007G158800--Sobic007G086300 Sobic007G085500--Sobic003G400900 Sobic007G085500--Sobic010G128400 Sobic007G085500--Sobic004G066700 Sobic007G126800 Sobic007G126800 Sobic007G085500--Sobic007G126800 Sobic002G003700 Sobic002G003700 Sobic007G085500--Sobic002G003700 Sobic006G170600 Sobic006G170600 Sobic007G085500--Sobic006G170600 Sobic007G085500--Sobic002G392100 Sobic010G128700 Sobic010G128700 Sobic007G085500--Sobic010G128700 Sobic007G085500--Sobic004G299600
Octagon: transcription factors


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