Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G242100.1
Synonym TBL19, Sb01g021430
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X1E7
Pfam PF14416 PF13839
Panther DB PTHR32285 PTHR32285:SF24
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G15900 : TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 19
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g16160.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006859
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G090420.1 , HORVU4Hr1G090420.2 , HORVU5Hr1G113770.1 , HORVU5Hr1G113770.2
Wheat TraesCS5A02G547200 , TraesCSU02G131200 , TraesCS5A02G482100 , TraesCS4B02G380700 , TraesCS5B02G495100 , TraesCS5B02G495100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G301900 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
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7 Sobic.001G232700 - -
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20 Sobic.006G089000 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic002G301900 Sobic002G301900 Sobic001G242100--Sobic002G301900 Sobic010G045500 Sobic010G045500 Sobic001G242100--Sobic010G045500 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic001G242100--Sobic006G079300 Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic001G242100--Sobic003G400900 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic001G242100--Sobic005G222500 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic001G242100--Sobic001G502000 Sobic001G232700 Sobic001G232700 Sobic001G242100--Sobic001G232700 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic001G242100--Sobic004G322800 Sobic005G160700 Sobic005G160700 Sobic001G242100--Sobic005G160700 Sobic002G301900--Sobic001G242100 Sobic002G301900--Sobic010G045500 Sobic002G301900--Sobic001G502000 Sobic006G170600 Sobic006G170600 Sobic002G301900--Sobic006G170600 Sobic002G301900--Sobic003G400900 Sobic002G301900--Sobic005G222500 Sobic004G299600 Sobic004G299600 Sobic002G301900--Sobic004G299600 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic002G301900--Sobic002G183700 Sobic004G180700 Sobic004G180700 Sobic002G301900--Sobic004G180700 Sobic010G045500--Sobic001G242100 Sobic010G045500--Sobic002G301900 Sobic006G234466 Sobic006G234466 Sobic010G045500--Sobic006G234466 Sobic010G045500--Sobic004G180700 Sobic005G215400 Sobic005G215400 Sobic010G045500--Sobic005G215400 Sobic010G045500--Sobic004G322800 Sobic010G270700 Sobic010G270700 Sobic010G045500--Sobic010G270700 Sobic004G301600 Sobic004G301600 Sobic010G045500--Sobic004G301600 Sobic008G128200 Sobic008G128200 Sobic010G045500--Sobic008G128200 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic006G079300--Sobic001G438200 Sobic006G079300--Sobic001G242100 Sobic009G219200 Sobic009G219200 Sobic006G079300--Sobic009G219200 Sobic006G079300--Sobic005G160700 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic006G079300--Sobic001G229000 Sobic001G379400 Sobic001G379400 Sobic006G079300--Sobic001G379400 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic006G079300--Sobic009G065800 Sobic006G079300--Sobic004G322800 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic006G079300--Sobic010G148800 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic003G400900--Sobic010G128400 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic003G400900--Sobic001G319300 Sobic003G400900--Sobic001G502000 Sobic003G400900--Sobic001G229000 Sobic003G400900--Sobic001G242100 Sobic003G400900--Sobic005G222500 Sobic003G400900--Sobic004G299600 Sobic007G158800 Sobic007G158800 Sobic003G400900--Sobic007G158800 Sobic007G085500 Sobic007G085500 Sobic003G400900--Sobic007G085500 Sobic005G222500--Sobic001G502000 Sobic005G222500--Sobic007G158800 Sobic001G261509 Sobic001G261509 Sobic005G222500--Sobic001G261509 Sobic005G222500--Sobic004G299600 Sobic005G222500--Sobic003G400900 Sobic005G222500--Sobic001G242100 Sobic005G222500--Sobic002G301900 Sobic005G222500--Sobic009G065800 Sobic007G158600 Sobic007G158600 Sobic005G222500--Sobic007G158600 Sobic001G502000--Sobic007G158800 Sobic001G502000--Sobic005G222500 Sobic006G089000 Sobic006G089000 Sobic001G502000--Sobic006G089000 Sobic001G502000--Sobic002G183700 Sobic001G502000--Sobic001G229000 Sobic001G502000--Sobic001G261509 Sobic004G029100 Sobic004G029100 Sobic001G502000--Sobic004G029100 Sobic001G502000--Sobic003G400900 Sobic008G019800 Sobic008G019800 Sobic001G502000--Sobic008G019800 Sobic001G232700--Sobic001G242100 Sobic002G391800 Sobic002G391800 Sobic001G232700--Sobic002G391800 Sobic001G232700--Sobic005G222500 Sobic003G206400 Sobic003G206400 Sobic001G232700--Sobic003G206400 Sobic001G232700--Sobic010G128400 Sobic001G232700--Sobic009G065800 Sobic001G232700--Sobic002G301900 Sobic002G063600 Sobic002G063600 Sobic001G232700--Sobic002G063600 Sobic001G232700--Sobic010G045500 Sobic004G322800--Sobic010G148800 Sobic004G322800--Sobic006G079300 Sobic009G074500 Sobic009G074500 Sobic004G322800--Sobic009G074500 Sobic004G322800--Sobic001G242100 Sobic004G322800--Sobic001G438200 Sobic004G209400 Sobic004G209400 Sobic004G322800--Sobic004G209400 Sobic009G199001 Sobic009G199001 Sobic004G322800--Sobic009G199001 Sobic003G282200 Sobic003G282200 Sobic004G322800--Sobic003G282200 Sobic002G404100 Sobic002G404100 Sobic004G322800--Sobic002G404100 Sobic005G160700--Sobic006G079300 Sobic005G160700--Sobic001G379400 Sobic005G160700--Sobic008G019800 Sobic005G160700--Sobic001G242100 Sobic005G160700--Sobic002G391800 Sobic005G160700--Sobic007G158600 Sobic005G160700--Sobic006G089000 Sobic005G160700--Sobic001G502000 Sobic005G160700--Sobic004G322800
Octagon: transcription factors


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