Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G319300.2
Synonym GSTU18, GST29, Sb01g031020, ATGSTU18
Functional annotation glutathione S-transferase, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S8L0
Pfam PF13410 PF02798
Panther DB PTHR11260 PTHR11260:SF243
NCBI CDD KOG0406; Glutathione S-transferase
KEGG Orthology K00799; GST, glutathione S-transferase
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G10360 : glutathione S-transferase TAU 18
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g38160.1 : glutathione S-transferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a003108
Brachypodium KQJ97336
Barley HORVU6Hr1G026810.3 , HORVU6Hr1G026810.2 , HORVU6Hr1G026810.1
Wheat TraesCS1B02G194500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G186500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
2 Sobic.007G086300 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
3 Sobic.002G255000 AIR12, putative, expressed -
4 Sobic.008G034900 PAN domain-containing protein At5g03700 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.004G110200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G064800 dirigent, putative, expressed -
7 Sobic.002G392100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
8 Sobic.003G400900 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
9 Sobic.001G182200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
10 Sobic.001G438200 expressed protein -
11 Sobic.009G219200 expressed protein -
12 Sobic.004G306900 amino acid transporter, putative, expressed -
13 Sobic.005G127400 expressed protein -
14 Sobic.003G319400 receptor protein kinase, putative, expressed -
15 Sobic.006G225500 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G140700 peroxidase precursor, putative, expressed -
17 Sobic.001G229000 xyloglucan galactosyltransferase KATAMARI1, putative, expressed -
18 Sobic.001G216500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@nodulin, putative, expressed K07192: flotillin
19 Sobic.001G414800 dirigent, putative, expressed -
20 Sobic.010G234500 O-methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic009G186500 Sobic009G186500 Sobic001G319300--Sobic009G186500 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic001G319300--Sobic007G086300 Sobic002G255000 Sobic002G255000 Sobic001G319300--Sobic002G255000 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic001G319300--Sobic008G034900 Sobic004G110200 Sobic004G110200 Sobic001G319300--Sobic004G110200 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic001G319300--Sobic003G064800 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic001G319300--Sobic002G392100 Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic001G319300--Sobic003G400900 Sobic001G182200 Sobic001G182200 Sobic001G319300--Sobic001G182200 Sobic006G225500 Sobic006G225500 Sobic009G186500--Sobic006G225500 Sobic009G186500--Sobic002G255000 Sobic009G186500--Sobic001G319300 Sobic005G127400 Sobic005G127400 Sobic009G186500--Sobic005G127400 Sobic010G234500 Sobic010G234500 Sobic009G186500--Sobic010G234500 Sobic009G186500--Sobic003G064800 Sobic003G140700 Sobic003G140700 Sobic009G186500--Sobic003G140700 Sobic001G238200 Sobic001G238200 Sobic009G186500--Sobic001G238200 Sobic003G349400 Sobic003G349400 Sobic009G186500--Sobic003G349400 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic007G086300--Sobic004G106100 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic007G086300--Sobic004G306900 Sobic007G086300--Sobic003G064800 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic007G086300--Sobic006G205700 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic007G086300--Sobic003G000100 Sobic007G086300--Sobic002G392100 Sobic007G086300--Sobic001G319300 Sobic007G086300--Sobic008G034900 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic007G086300--Sobic003G319400 Sobic002G255000--Sobic003G064800 Sobic007G008600 Sobic007G008600 Sobic002G255000--Sobic007G008600 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic002G255000--Sobic001G438200 Sobic002G255000--Sobic003G140700 Sobic002G255000--Sobic005G127400 Sobic002G255000--Sobic009G186500 Sobic002G255000--Sobic006G225500 Sobic002G255000--Sobic001G238200 Sobic007G100700 Sobic007G100700 Sobic002G255000--Sobic007G100700 Sobic008G034900--Sobic007G086300 Sobic008G034900--Sobic002G392100 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic008G034900--Sobic009G065800 Sobic008G034900--Sobic001G319300 Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic008G034900--Sobic008G020000 Sobic008G022100 Sobic008G022100 Sobic008G034900--Sobic008G022100 Sobic008G034900--Sobic003G064800 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic008G034900--Sobic003G167300 Sobic002G068000 Sobic002G068000 Sobic008G034900--Sobic002G068000 Sobic004G110200--Sobic001G319300 Sobic010G162800 Sobic010G162800 Sobic004G110200--Sobic010G162800 Sobic004G110200--Sobic009G186500 Sobic004G110200--Sobic001G182200 Sobic004G110200--Sobic002G392100 Sobic004G110200--Sobic008G034900 Sobic001G216500 Sobic001G216500 Sobic004G110200--Sobic001G216500 Sobic001G237800 Sobic001G237800 Sobic004G110200--Sobic001G237800 Sobic004G110200--Sobic007G086300 Sobic003G064800--Sobic005G127400 Sobic003G064800--Sobic002G255000 Sobic003G064800--Sobic004G306900 Sobic003G064800--Sobic001G438200 Sobic006G106900 Sobic006G106900 Sobic003G064800--Sobic006G106900 Sobic003G064800--Sobic001G238200 Sobic003G064800--Sobic003G140700 Sobic003G064800--Sobic007G086300 Sobic003G064800--Sobic010G234500 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic002G392100--Sobic002G391400 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic002G392100--Sobic007G206800 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic002G392100--Sobic002G334000 Sobic002G392100--Sobic007G086300 Sobic002G392100--Sobic006G205700 Sobic002G392100--Sobic008G034900 Sobic002G392100--Sobic003G167300 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic002G392100--Sobic010G241900 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic002G392100--Sobic001G499900 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic003G400900--Sobic010G128400 Sobic003G400900--Sobic001G319300 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic003G400900--Sobic001G502000 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic003G400900--Sobic001G229000 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic003G400900--Sobic001G242100 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic003G400900--Sobic005G222500 Sobic004G299600 Sobic004G299600 Sobic003G400900--Sobic004G299600 Sobic007G158800 Sobic007G158800 Sobic003G400900--Sobic007G158800 Sobic007G085500 Sobic007G085500 Sobic003G400900--Sobic007G085500 Sobic001G182200--Sobic001G319300 Sobic001G182200--Sobic008G034900 Sobic001G182200--Sobic002G068000 Sobic001G182200--Sobic001G216500 Sobic004G083500 Sobic004G083500 Sobic001G182200--Sobic004G083500 Sobic009G219200 Sobic009G219200 Sobic001G182200--Sobic009G219200 Sobic001G182200--Sobic010G162800 Sobic001G182200--Sobic003G064800 Sobic010G168400 Sobic010G168400 Sobic001G182200--Sobic010G168400
Octagon: transcription factors


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