Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G126800.1
Synonym Sb07g020340
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YKW8
Pfam -
Panther DB PTHR34563 PTHR34563:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g32120.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G400900 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
2 Sobic.002G392100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.008G034900 PAN domain-containing protein At5g03700 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.010G128700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
5 Sobic.002G255000 AIR12, putative, expressed -
6 Sobic.007G086300 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
7 Sobic.001G319300 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
8 Sobic.004G066700 ZOS2-04 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.001G229000 xyloglucan galactosyltransferase KATAMARI1, putative, expressed -
10 Sobic.003G064800 dirigent, putative, expressed -
11 Sobic.009G186500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
12 Sobic.007G085500 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
13 Sobic.006G170600 tonoplast intrinsic protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
14 Sobic.002G003700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.005G127400 expressed protein -
16 Sobic.006G150100 Down-regulated by silicon application(PubMedID : 24879770)@Up-regulated by osmotic stress.(PubMedID : 24879770)@aquaporin protein, putative, expressed K09872: aquaporin PIP
17 Sobic.010G158400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G128400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
19 Sobic.003G349400 expressed protein -
20 Sobic.002G068000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G126800 Sobic007G126800 Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic007G126800--Sobic003G400900 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic007G126800--Sobic002G392100 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic007G126800--Sobic008G034900 Sobic010G128700 Sobic010G128700 Sobic007G126800--Sobic010G128700 Sobic002G255000 Sobic002G255000 Sobic007G126800--Sobic002G255000 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic007G126800--Sobic007G086300 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic007G126800--Sobic001G319300 Sobic004G066700 Sobic004G066700 Sobic007G126800--Sobic004G066700 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic007G126800--Sobic001G229000 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic003G400900--Sobic010G128400 Sobic003G400900--Sobic001G319300 Sobic001G502000 Sobic001G502000 Sobic003G400900--Sobic001G502000 Sobic003G400900--Sobic001G229000 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic003G400900--Sobic001G242100 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic003G400900--Sobic005G222500 Sobic004G299600 Sobic004G299600 Sobic003G400900--Sobic004G299600 Sobic007G158800 Sobic007G158800 Sobic003G400900--Sobic007G158800 Sobic007G085500 Sobic007G085500 Sobic003G400900--Sobic007G085500 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic002G392100--Sobic002G391400 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic002G392100--Sobic007G206800 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic002G392100--Sobic002G334000 Sobic002G392100--Sobic007G086300 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic002G392100--Sobic006G205700 Sobic002G392100--Sobic008G034900 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic002G392100--Sobic003G167300 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic002G392100--Sobic010G241900 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic002G392100--Sobic001G499900 Sobic008G034900--Sobic007G086300 Sobic008G034900--Sobic002G392100 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic008G034900--Sobic009G065800 Sobic008G034900--Sobic001G319300 Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic008G034900--Sobic008G020000 Sobic008G022100 Sobic008G022100 Sobic008G034900--Sobic008G022100 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic008G034900--Sobic003G064800 Sobic008G034900--Sobic003G167300 Sobic002G068000 Sobic002G068000 Sobic008G034900--Sobic002G068000 Sobic010G128700--Sobic003G400900 Sobic010G128700--Sobic001G319300 Sobic010G128700--Sobic007G126800 Sobic010G128700--Sobic010G128400 Sobic009G186500 Sobic009G186500 Sobic010G128700--Sobic009G186500 Sobic010G128700--Sobic007G086300 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic010G128700--Sobic006G079300 Sobic001G237800 Sobic001G237800 Sobic010G128700--Sobic001G237800 Sobic010G128700--Sobic002G392100 Sobic002G255000--Sobic003G064800 Sobic007G008600 Sobic007G008600 Sobic002G255000--Sobic007G008600 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic002G255000--Sobic001G438200 Sobic003G140700 Sobic003G140700 Sobic002G255000--Sobic003G140700 Sobic005G127400 Sobic005G127400 Sobic002G255000--Sobic005G127400 Sobic002G255000--Sobic009G186500 Sobic006G225500 Sobic006G225500 Sobic002G255000--Sobic006G225500 Sobic001G238200 Sobic001G238200 Sobic002G255000--Sobic001G238200 Sobic007G100700 Sobic007G100700 Sobic002G255000--Sobic007G100700 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic007G086300--Sobic004G106100 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic007G086300--Sobic004G306900 Sobic007G086300--Sobic003G064800 Sobic007G086300--Sobic006G205700 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic007G086300--Sobic003G000100 Sobic007G086300--Sobic002G392100 Sobic007G086300--Sobic001G319300 Sobic007G086300--Sobic008G034900 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic007G086300--Sobic003G319400 Sobic001G319300--Sobic009G186500 Sobic001G319300--Sobic007G086300 Sobic001G319300--Sobic002G255000 Sobic001G319300--Sobic008G034900 Sobic004G110200 Sobic004G110200 Sobic001G319300--Sobic004G110200 Sobic001G319300--Sobic003G064800 Sobic001G319300--Sobic002G392100 Sobic001G319300--Sobic003G400900 Sobic001G182200 Sobic001G182200 Sobic001G319300--Sobic001G182200 Sobic005G097400 Sobic005G097400 Sobic004G066700--Sobic005G097400 Sobic004G066700--Sobic002G392100 Sobic004G066700--Sobic003G400900 Sobic004G066700--Sobic007G126800 Sobic004G066700--Sobic007G085500 Sobic004G066700--Sobic008G022100 Sobic004G066700--Sobic004G299600 Sobic002G118801 Sobic002G118801 Sobic004G066700--Sobic002G118801 Sobic004G351200 Sobic004G351200 Sobic004G066700--Sobic004G351200 Sobic001G229000--Sobic007G158800 Sobic006G028500 Sobic006G028500 Sobic001G229000--Sobic006G028500 Sobic004G322100 Sobic004G322100 Sobic001G229000--Sobic004G322100 Sobic001G229000--Sobic001G502000 Sobic001G229000--Sobic007G086300 Sobic004G110700 Sobic004G110700 Sobic001G229000--Sobic004G110700 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic001G229000--Sobic010G152400 Sobic001G229000--Sobic004G306900 Sobic008G019800 Sobic008G019800 Sobic001G229000--Sobic008G019800
Octagon: transcription factors


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