Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G038100.1
Synonym Sb05g003170
Functional annotation sialyltransferase family domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PQ04
Pfam PF00777
Panther DB PTHR13713 PTHR13713:SF58
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008373; sialyltransferase activity GO:0006486protein glycosylation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G08280 : Glycosyltransferase family 29 (sialyltransferase) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g05550.1 : sialyltransferase family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ83461
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G206400 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
2 Sobic.001G232700 - -
3 Sobic.002G391800 peroxidase, putative, expressed K00430: peroxidase
4 Sobic.002G063600 disease resistance protein RPM1, putative -
5 Sobic.002G377600 patatin, putative, expressed -
6 Sobic.010G128400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
7 Sobic.006G018100 cupin domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G087900 similar to Aquaporin PIP1-6(PubMedID : 29862293)@-(PubMedID : 24879770)@Up-regulated by osmotic stress.(PubMedID : 24879770)@aquaporin protein, putative, expressed K09872: aquaporin PIP
9 Sobic.003G317900 lysM domain containing protein, putative -
10 Sobic.001G242100 expressed protein -
11 Sobic.006G079300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
12 Sobic.002G118801 - -
13 Sobic.009G065800 - -
14 Sobic.008G002800 fatty acid desaturase, putative, expressed K10257: FAD3, FAD7, FAD8, acyl-lipid omega-3 desaturase
15 Sobic.005G160700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G400900 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
17 Sobic.005G222500 phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
18 Sobic.001G539200 expressed protein -
19 Sobic.010G045500 AMP-binding enzyme, putative, expressed K01897: ACSL, long-chain acyl-CoA synthetase
20 Sobic.004G159500 AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor


Gene co-expression network
sample Sobic005G038100 Sobic005G038100 Sobic003G206400 Sobic003G206400 Sobic005G038100--Sobic003G206400 Sobic001G232700 Sobic001G232700 Sobic005G038100--Sobic001G232700 Sobic002G391800 Sobic002G391800 Sobic005G038100--Sobic002G391800 Sobic002G063600 Sobic002G063600 Sobic005G038100--Sobic002G063600 Sobic002G377600 Sobic002G377600 Sobic005G038100--Sobic002G377600 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic005G038100--Sobic010G128400 Sobic006G018100 Sobic006G018100 Sobic005G038100--Sobic006G018100 Sobic010G087900 Sobic010G087900 Sobic005G038100--Sobic010G087900 Sobic003G317900 Sobic003G317900 Sobic005G038100--Sobic003G317900 Sobic003G206400--Sobic002G063600 Sobic003G206400--Sobic010G087900 Sobic002G118801 Sobic002G118801 Sobic003G206400--Sobic002G118801 Sobic001G539200 Sobic001G539200 Sobic003G206400--Sobic001G539200 Sobic003G206400--Sobic006G018100 Sobic008G020000 Sobic008G020000 Sobic003G206400--Sobic008G020000 Sobic003G206400--Sobic001G232700 Sobic009G065800 Sobic009G065800 Sobic003G206400--Sobic009G065800 Sobic003G206400--Sobic003G317900 Sobic001G242100 Sobic001G242100 Sobic001G232700--Sobic001G242100 Sobic001G232700--Sobic002G391800 Sobic005G222500 Sobic005G222500 Sobic001G232700--Sobic005G222500 Sobic001G232700--Sobic003G206400 Sobic001G232700--Sobic010G128400 Sobic001G232700--Sobic009G065800 Sobic002G301900 Sobic002G301900 Sobic001G232700--Sobic002G301900 Sobic001G232700--Sobic002G063600 Sobic010G045500 Sobic010G045500 Sobic001G232700--Sobic010G045500 Sobic001G234900 Sobic001G234900 Sobic002G391800--Sobic001G234900 Sobic005G160700 Sobic005G160700 Sobic002G391800--Sobic005G160700 Sobic001G342400 Sobic001G342400 Sobic002G391800--Sobic001G342400 Sobic002G391800--Sobic001G242100 Sobic001G379400 Sobic001G379400 Sobic002G391800--Sobic001G379400 Sobic002G391800--Sobic001G232700 Sobic002G391800--Sobic002G377600 Sobic002G391800--Sobic005G222500 Sobic002G391800--Sobic010G045500 Sobic002G063600--Sobic003G206400 Sobic002G063600--Sobic002G118801 Sobic002G063600--Sobic002G377600 Sobic002G063600--Sobic001G539200 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic002G063600--Sobic006G079300 Sobic002G063600--Sobic010G087900 Sobic002G063600--Sobic010G128400 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic002G063600--Sobic010G031700 Sobic006G277700 Sobic006G277700 Sobic002G063600--Sobic006G277700 Sobic002G377600--Sobic002G063600 Sobic002G377600--Sobic006G277700 Sobic002G377600--Sobic003G206400 Sobic002G377600--Sobic002G391800 Sobic002G377600--Sobic006G079300 Sobic002G377600--Sobic010G087900 Sobic005G066432 Sobic005G066432 Sobic002G377600--Sobic005G066432 Sobic002G377600--Sobic005G160700 Sobic002G377600--Sobic001G379400 Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic010G128400--Sobic003G400900 Sobic010G128400--Sobic009G065800 Sobic010G128400--Sobic006G079300 Sobic010G128400--Sobic002G118801 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic010G128400--Sobic007G086300 Sobic001G229000 Sobic001G229000 Sobic010G128400--Sobic001G229000 Sobic010G128400--Sobic001G242100 Sobic001G319300 Sobic001G319300 Sobic010G128400--Sobic001G319300 Sobic010G128400--Sobic005G222500 Sobic006G018100--Sobic003G206400 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic006G018100--Sobic008G034900 Sobic006G018100--Sobic008G020000 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic006G018100--Sobic002G392100 Sobic006G018100--Sobic002G118801 Sobic006G018100--Sobic009G065800 Sobic007G085500 Sobic007G085500 Sobic006G018100--Sobic007G085500 Sobic006G018100--Sobic001G232700 Sobic006G018100--Sobic002G063600 Sobic010G087900--Sobic001G539200 Sobic010G087900--Sobic003G206400 Sobic010G087900--Sobic008G020000 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic010G087900--Sobic003G053200 Sobic010G087900--Sobic002G063600 Sobic010G087900--Sobic003G317900 Sobic003G095100 Sobic003G095100 Sobic010G087900--Sobic003G095100 Sobic004G029400 Sobic004G029400 Sobic010G087900--Sobic004G029400 Sobic010G087900--Sobic010G031700 Sobic003G317900--Sobic010G087900 Sobic003G317900--Sobic001G539200 Sobic003G317900--Sobic003G206400 Sobic003G317900--Sobic002G063600 Sobic003G317900--Sobic002G377600 Sobic003G317900--Sobic001G232700 Sobic010G147200 Sobic010G147200 Sobic003G317900--Sobic010G147200 Sobic003G317900--Sobic002G118801 Sobic006G048100 Sobic006G048100 Sobic003G317900--Sobic006G048100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.