Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G060666.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S4K2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G150150 - -
2 Sobic.003G335800 - -
3 Sobic.001G019100 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G106800 - -
5 Sobic.004G351866 - -
6 Sobic.002G037000 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.010G275550 - -
8 Sobic.005G037500 expressed protein -
9 Sobic.005G008301 - -
10 Sobic.007G152200 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -
11 Sobic.010G074960 - -
12 Sobic.004G325766 - -
13 Sobic.003G299400 - -
14 Sobic.010G231400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G045800 - -
16 Sobic.003G343100 expressed protein -
17 Sobic.002G205201 - -
18 Sobic.010G058650 - -
19 Sobic.004G330500 expressed protein -
20 Sobic.006G185400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G060666 Sobic001G060666 Sobic008G150150 Sobic008G150150 Sobic001G060666--Sobic008G150150 Sobic003G335800 Sobic003G335800 Sobic001G060666--Sobic003G335800 Sobic001G019100 Sobic001G019100 Sobic001G060666--Sobic001G019100 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic001G060666--Sobic005G106800 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic001G060666--Sobic004G351866 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic001G060666--Sobic002G037000 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic001G060666--Sobic010G275550 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic001G060666--Sobic005G037500 Sobic005G008301 Sobic005G008301 Sobic001G060666--Sobic005G008301 Sobic008G150150--Sobic001G019100 Sobic008G150150--Sobic003G335800 Sobic008G150150--Sobic002G037000 Sobic008G150150--Sobic010G275550 Sobic008G150150--Sobic005G037500 Sobic008G150150--Sobic001G060666 Sobic009G004000 Sobic009G004000 Sobic008G150150--Sobic009G004000 Sobic001G172900 Sobic001G172900 Sobic008G150150--Sobic001G172900 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic008G150150--Sobic002G205201 Sobic003G335800--Sobic001G019100 Sobic003G335800--Sobic008G150150 Sobic003G335800--Sobic002G037000 Sobic003G335800--Sobic005G037500 Sobic003G335800--Sobic001G060666 Sobic003G335800--Sobic001G172900 Sobic003G335800--Sobic010G275550 Sobic004G324900 Sobic004G324900 Sobic003G335800--Sobic004G324900 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic003G335800--Sobic006G185400 Sobic001G019100--Sobic008G150150 Sobic001G019100--Sobic003G335800 Sobic001G019100--Sobic002G037000 Sobic001G019100--Sobic005G037500 Sobic001G019100--Sobic010G275550 Sobic001G019100--Sobic001G172900 Sobic001G019100--Sobic006G185400 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic001G019100--Sobic008G023500 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic001G019100--Sobic004G330500 Sobic003G299400 Sobic003G299400 Sobic005G106800--Sobic003G299400 Sobic009G165050 Sobic009G165050 Sobic005G106800--Sobic009G165050 Sobic005G106800--Sobic004G351866 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic005G106800--Sobic004G325766 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic005G106800--Sobic003G357000 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic005G106800--Sobic003G045800 Sobic005G106800--Sobic010G275550 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic005G106800--Sobic010G014600 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic005G106800--Sobic006G214101 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic004G351866--Sobic007G072901 Sobic004G351866--Sobic008G023500 Sobic004G351866--Sobic003G357000 Sobic004G351866--Sobic004G330500 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic004G351866--Sobic005G189400 Sobic004G351866--Sobic006G185400 Sobic004G351866--Sobic002G037000 Sobic004G351866--Sobic005G037500 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic004G351866--Sobic007G152200 Sobic002G037000--Sobic005G037500 Sobic002G037000--Sobic006G185400 Sobic002G037000--Sobic004G330500 Sobic002G037000--Sobic005G189400 Sobic002G037000--Sobic008G023500 Sobic002G037000--Sobic002G205201 Sobic002G037000--Sobic010G275550 Sobic002G037000--Sobic007G152200 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic002G037000--Sobic001G361500 Sobic010G275550--Sobic002G205201 Sobic010G275550--Sobic004G330500 Sobic010G275550--Sobic006G185400 Sobic010G275550--Sobic005G189400 Sobic010G275550--Sobic002G037000 Sobic010G275550--Sobic005G037500 Sobic010G275550--Sobic008G023500 Sobic010G275550--Sobic007G152200 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic010G275550--Sobic006G209100 Sobic005G037500--Sobic002G037000 Sobic005G037500--Sobic006G185400 Sobic005G037500--Sobic004G330500 Sobic005G037500--Sobic005G189400 Sobic005G037500--Sobic002G205201 Sobic005G037500--Sobic007G152200 Sobic005G037500--Sobic006G209100 Sobic005G037500--Sobic001G361500 Sobic005G037500--Sobic008G023500 Sobic005G008301--Sobic004G325766 Sobic005G008301--Sobic007G152200 Sobic005G008301--Sobic001G060666 Sobic010G231400 Sobic010G231400 Sobic005G008301--Sobic010G231400 Sobic005G008301--Sobic002G205201 Sobic005G008301--Sobic006G185400 Sobic010G173550 Sobic010G173550 Sobic005G008301--Sobic010G173550 Sobic005G008301--Sobic004G330500 Sobic005G008301--Sobic010G275550
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.