Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G335800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q6R8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G019100 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G150150 - -
3 Sobic.002G037000 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
4 Sobic.005G037500 expressed protein -
5 Sobic.001G060666 - -
6 Sobic.001G172900 - -
7 Sobic.010G275550 - -
8 Sobic.004G324900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
9 Sobic.006G185400 - -
10 Sobic.008G023500 expressed protein -
11 Sobic.007G152200 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -
12 Sobic.004G330500 expressed protein -
13 Sobic.005G189400 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.009G164200 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11252: histone H2B
15 Sobic.006G209100 - -
16 Sobic.004G351866 - -
17 Sobic.002G205201 - -
18 Sobic.001G361500 expressed protein -
19 Sobic.003G045800 - -
20 Sobic.009G004000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G335800 Sobic003G335800 Sobic001G019100 Sobic001G019100 Sobic003G335800--Sobic001G019100 Sobic008G150150 Sobic008G150150 Sobic003G335800--Sobic008G150150 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic003G335800--Sobic002G037000 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic003G335800--Sobic005G037500 Sobic001G060666 Sobic001G060666 Sobic003G335800--Sobic001G060666 Sobic001G172900 Sobic001G172900 Sobic003G335800--Sobic001G172900 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic003G335800--Sobic010G275550 Sobic004G324900 Sobic004G324900 Sobic003G335800--Sobic004G324900 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic003G335800--Sobic006G185400 Sobic001G019100--Sobic008G150150 Sobic001G019100--Sobic003G335800 Sobic001G019100--Sobic002G037000 Sobic001G019100--Sobic005G037500 Sobic001G019100--Sobic010G275550 Sobic001G019100--Sobic001G172900 Sobic001G019100--Sobic006G185400 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic001G019100--Sobic008G023500 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic001G019100--Sobic004G330500 Sobic008G150150--Sobic001G019100 Sobic008G150150--Sobic003G335800 Sobic008G150150--Sobic002G037000 Sobic008G150150--Sobic010G275550 Sobic008G150150--Sobic005G037500 Sobic008G150150--Sobic001G060666 Sobic009G004000 Sobic009G004000 Sobic008G150150--Sobic009G004000 Sobic008G150150--Sobic001G172900 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic008G150150--Sobic002G205201 Sobic002G037000--Sobic005G037500 Sobic002G037000--Sobic006G185400 Sobic002G037000--Sobic004G330500 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic002G037000--Sobic005G189400 Sobic002G037000--Sobic008G023500 Sobic002G037000--Sobic002G205201 Sobic002G037000--Sobic010G275550 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic002G037000--Sobic007G152200 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic002G037000--Sobic001G361500 Sobic005G037500--Sobic002G037000 Sobic005G037500--Sobic006G185400 Sobic005G037500--Sobic004G330500 Sobic005G037500--Sobic005G189400 Sobic005G037500--Sobic002G205201 Sobic005G037500--Sobic007G152200 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic005G037500--Sobic006G209100 Sobic005G037500--Sobic001G361500 Sobic005G037500--Sobic008G023500 Sobic001G060666--Sobic008G150150 Sobic001G060666--Sobic003G335800 Sobic001G060666--Sobic001G019100 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic001G060666--Sobic005G106800 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic001G060666--Sobic004G351866 Sobic001G060666--Sobic002G037000 Sobic001G060666--Sobic010G275550 Sobic001G060666--Sobic005G037500 Sobic005G008301 Sobic005G008301 Sobic001G060666--Sobic005G008301 Sobic001G172900--Sobic008G023500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic001G172900--Sobic009G164200 Sobic001G172900--Sobic002G037000 Sobic001G172900--Sobic006G209100 Sobic001G172900--Sobic006G185400 Sobic001G172900--Sobic004G330500 Sobic001G172900--Sobic005G189400 Sobic001G172900--Sobic001G361500 Sobic001G172900--Sobic005G037500 Sobic010G275550--Sobic002G205201 Sobic010G275550--Sobic004G330500 Sobic010G275550--Sobic006G185400 Sobic010G275550--Sobic005G189400 Sobic010G275550--Sobic002G037000 Sobic010G275550--Sobic005G037500 Sobic010G275550--Sobic008G023500 Sobic010G275550--Sobic007G152200 Sobic010G275550--Sobic006G209100 Sobic004G324900--Sobic002G037000 Sobic004G324900--Sobic005G037500 Sobic004G324900--Sobic006G209100 Sobic004G324900--Sobic004G351866 Sobic004G324900--Sobic001G361500 Sobic004G324900--Sobic006G185400 Sobic004G324900--Sobic004G330500 Sobic004G324900--Sobic005G189400 Sobic004G324900--Sobic008G023500 Sobic006G185400--Sobic004G330500 Sobic006G185400--Sobic005G189400 Sobic006G185400--Sobic001G361500 Sobic006G185400--Sobic007G152200 Sobic006G185400--Sobic002G205201 Sobic006G185400--Sobic006G209100 Sobic006G185400--Sobic008G023500 Sobic006G185400--Sobic005G037500 Sobic006G185400--Sobic009G164200
Octagon: transcription factors


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