Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G122700.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S5C1
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g49680.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS6D02G109200 , TraesCS6B02G147500 , TraesCS6B02G147300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G127600 ZOS3-15 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.005G102600 - -
3 Sobic.002G089300 LTPL54 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -
4 Sobic.004G196900 - -
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11 Sobic.003G372950 - -
12 Sobic.003G064000 expressed protein -
13 Sobic.004G286450 - -
14 Sobic.006G262001 - -
15 Sobic.005G057600 expressed protein -
16 Sobic.006G167850 - -
17 Sobic.006G223700 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G126700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G269800 - -
20 Sobic.001G379800 OsFBX72 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G122700 Sobic001G122700 Sobic001G127600 Sobic001G127600 Sobic001G122700--Sobic001G127600 Sobic005G102600 Sobic005G102600 Sobic001G122700--Sobic005G102600 Sobic002G089300 Sobic002G089300 Sobic001G122700--Sobic002G089300 Sobic004G196900 Sobic004G196900 Sobic001G122700--Sobic004G196900 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic001G122700--Sobic004G295200 Sobic003G244401 Sobic003G244401 Sobic001G122700--Sobic003G244401 Sobic010G248150 Sobic010G248150 Sobic001G122700--Sobic010G248150 Sobic006G229400 Sobic006G229400 Sobic001G122700--Sobic006G229400 Sobic009G185000 Sobic009G185000 Sobic001G122700--Sobic009G185000 Sobic001G127600--Sobic001G122700 Sobic001G127600--Sobic005G102600 Sobic001G127600--Sobic002G089300 Sobic001G127600--Sobic004G196900 Sobic001G127600--Sobic006G229400 Sobic001G127600--Sobic009G185000 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic001G127600--Sobic009G244450 Sobic002G341400 Sobic002G341400 Sobic001G127600--Sobic002G341400 Sobic005G029300 Sobic005G029300 Sobic001G127600--Sobic005G029300 Sobic005G102600--Sobic001G122700 Sobic005G102600--Sobic001G127600 Sobic005G102600--Sobic009G185000 Sobic002G282800 Sobic002G282800 Sobic005G102600--Sobic002G282800 Sobic002G018250 Sobic002G018250 Sobic005G102600--Sobic002G018250 Sobic010G207450 Sobic010G207450 Sobic005G102600--Sobic010G207450 Sobic005G102600--Sobic002G089300 Sobic001G090900 Sobic001G090900 Sobic005G102600--Sobic001G090900 Sobic005G102600--Sobic010G248150 Sobic002G089300--Sobic004G196900 Sobic002G089300--Sobic006G229400 Sobic001G379800 Sobic001G379800 Sobic002G089300--Sobic001G379800 Sobic004G196000 Sobic004G196000 Sobic002G089300--Sobic004G196000 Sobic001G450100 Sobic001G450100 Sobic002G089300--Sobic001G450100 Sobic003G389500 Sobic003G389500 Sobic002G089300--Sobic003G389500 Sobic003G063600 Sobic003G063600 Sobic002G089300--Sobic003G063600 Sobic002G089300--Sobic005G029300 Sobic006G236100 Sobic006G236100 Sobic002G089300--Sobic006G236100 Sobic004G196900--Sobic002G089300 Sobic002G243100 Sobic002G243100 Sobic004G196900--Sobic002G243100 Sobic004G196900--Sobic006G229400 Sobic003G241400 Sobic003G241400 Sobic004G196900--Sobic003G241400 Sobic004G196900--Sobic001G379800 Sobic004G196900--Sobic004G196000 Sobic001G495850 Sobic001G495850 Sobic004G196900--Sobic001G495850 Sobic004G196900--Sobic006G236100 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic004G196900--Sobic006G261000 Sobic006G262001 Sobic006G262001 Sobic004G295200--Sobic006G262001 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic004G295200--Sobic001G025201 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic004G295200--Sobic007G059800 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic004G295200--Sobic002G069601 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic004G295200--Sobic003G318400 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic004G295200--Sobic003G353050 Sobic002G323800 Sobic002G323800 Sobic004G295200--Sobic002G323800 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic004G295200--Sobic005G181700 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic004G295200--Sobic004G201200 Sobic007G191150 Sobic007G191150 Sobic003G244401--Sobic007G191150 Sobic007G121800 Sobic007G121800 Sobic003G244401--Sobic007G121800 Sobic008G110151 Sobic008G110151 Sobic003G244401--Sobic008G110151 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic003G244401--Sobic003G254400 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic003G244401--Sobic003G008400 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic003G244401--Sobic003G318600 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic003G244401--Sobic005G080075 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic003G244401--Sobic001G100650 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic003G244401--Sobic010G064050 Sobic010G248150--Sobic005G102600 Sobic010G248150--Sobic001G122700 Sobic010G248150--Sobic009G185000 Sobic010G248150--Sobic010G207450 Sobic004G083250 Sobic004G083250 Sobic010G248150--Sobic004G083250 Sobic010G248150--Sobic001G127600 Sobic010G248150--Sobic002G282800 Sobic001G222100 Sobic001G222100 Sobic010G248150--Sobic001G222100 Sobic010G248150--Sobic001G090900 Sobic006G229400--Sobic002G089300 Sobic006G229400--Sobic004G196900 Sobic006G229400--Sobic009G185000 Sobic006G229400--Sobic001G379800 Sobic006G229400--Sobic003G063600 Sobic006G229400--Sobic004G196000 Sobic006G229400--Sobic003G389500 Sobic006G229400--Sobic005G029300 Sobic006G178200 Sobic006G178200 Sobic006G229400--Sobic006G178200 Sobic009G185000--Sobic002G282800 Sobic009G185000--Sobic001G090900 Sobic009G185000--Sobic006G229400 Sobic009G185000--Sobic002G089300 Sobic009G185000--Sobic005G102600 Sobic009G185000--Sobic004G196900 Sobic009G185000--Sobic005G029300 Sobic009G185000--Sobic001G122700 Sobic002G141050 Sobic002G141050 Sobic009G185000--Sobic002G141050
Octagon: transcription factors


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