Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G188500.2
Synonym DML3
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S6X4
Pfam PF15628
Panther DB PTHR10359 PTHR10359:SF30
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G04560 : HhH-GPD base excision DNA repair family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g29380.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G101200 paired amphipathic helix repeat-containing protein, putative, expressed -
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17 Sobic.009G231500 expressed protein -
18 Sobic.010G107300 - -
19 Sobic.005G083160 - -
20 Sobic.009G073700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G188500 Sobic001G188500 Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic001G188500--Sobic003G101200 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic001G188500--Sobic002G016250 Sobic003G342000 Sobic003G342000 Sobic001G188500--Sobic003G342000 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic001G188500--Sobic005G165632 Sobic001G394100 Sobic001G394100 Sobic001G188500--Sobic001G394100 Sobic004G354600 Sobic004G354600 Sobic001G188500--Sobic004G354600 Sobic010G066500 Sobic010G066500 Sobic001G188500--Sobic010G066500 Sobic008G186700 Sobic008G186700 Sobic001G188500--Sobic008G186700 Sobic009G227201 Sobic009G227201 Sobic001G188500--Sobic009G227201 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic003G101200--Sobic005G083160 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic003G101200--Sobic010G107300 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic003G101200--Sobic009G218100 Sobic002G015800 Sobic002G015800 Sobic003G101200--Sobic002G015800 Sobic001G509100 Sobic001G509100 Sobic003G101200--Sobic001G509100 Sobic002G099866 Sobic002G099866 Sobic003G101200--Sobic002G099866 Sobic004G262100 Sobic004G262100 Sobic003G101200--Sobic004G262100 Sobic002G360900 Sobic002G360900 Sobic003G101200--Sobic002G360900 Sobic010G022600 Sobic010G022600 Sobic003G101200--Sobic010G022600 Sobic002G016250--Sobic005G165632 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic002G016250--Sobic008G064250 Sobic002G016250--Sobic003G342000 Sobic008G113350 Sobic008G113350 Sobic002G016250--Sobic008G113350 Sobic002G016250--Sobic009G218100 Sobic004G037300 Sobic004G037300 Sobic002G016250--Sobic004G037300 Sobic003G389400 Sobic003G389400 Sobic002G016250--Sobic003G389400 Sobic002G016250--Sobic005G083160 Sobic003G027700 Sobic003G027700 Sobic002G016250--Sobic003G027700 Sobic003G342000--Sobic002G016250 Sobic003G342000--Sobic003G389400 Sobic009G231500 Sobic009G231500 Sobic003G342000--Sobic009G231500 Sobic003G342000--Sobic008G064250 Sobic002G274900 Sobic002G274900 Sobic003G342000--Sobic002G274900 Sobic001G203100 Sobic001G203100 Sobic003G342000--Sobic001G203100 Sobic007G036600 Sobic007G036600 Sobic003G342000--Sobic007G036600 Sobic003G226000 Sobic003G226000 Sobic003G342000--Sobic003G226000 Sobic006G154300 Sobic006G154300 Sobic003G342000--Sobic006G154300 Sobic005G165632--Sobic008G113350 Sobic005G165632--Sobic002G016250 Sobic005G165632--Sobic008G064250 Sobic005G165632--Sobic009G218100 Sobic005G165632--Sobic003G342000 Sobic002G254250 Sobic002G254250 Sobic005G165632--Sobic002G254250 Sobic005G165632--Sobic003G027700 Sobic005G165632--Sobic005G083160 Sobic005G165632--Sobic003G101200 Sobic002G143700 Sobic002G143700 Sobic001G394100--Sobic002G143700 Sobic010G142300 Sobic010G142300 Sobic001G394100--Sobic010G142300 Sobic006G034275 Sobic006G034275 Sobic001G394100--Sobic006G034275 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic001G394100--Sobic002G344900 Sobic003G392500 Sobic003G392500 Sobic001G394100--Sobic003G392500 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic001G394100--Sobic005G223200 Sobic005G140300 Sobic005G140300 Sobic001G394100--Sobic005G140300 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic001G394100--Sobic009G010000 Sobic006G031600 Sobic006G031600 Sobic001G394100--Sobic006G031600 Sobic004G354600--Sobic009G227201 Sobic001G394900 Sobic001G394900 Sobic004G354600--Sobic001G394900 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic004G354600--Sobic003G402100 Sobic001G150300 Sobic001G150300 Sobic004G354600--Sobic001G150300 Sobic004G354600--Sobic001G394100 Sobic004G354600--Sobic003G101200 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic004G354600--Sobic008G088881 Sobic002G123100 Sobic002G123100 Sobic004G354600--Sobic002G123100 Sobic001G053700 Sobic001G053700 Sobic004G354600--Sobic001G053700 Sobic010G066500--Sobic008G186700 Sobic009G071900 Sobic009G071900 Sobic010G066500--Sobic009G071900 Sobic005G085700 Sobic005G085700 Sobic010G066500--Sobic005G085700 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic010G066500--Sobic010G237100 Sobic001G381250 Sobic001G381250 Sobic010G066500--Sobic001G381250 Sobic008G186700--Sobic001G381250 Sobic009G227201--Sobic001G394100 Sobic008G013100 Sobic008G013100 Sobic009G227201--Sobic008G013100 Sobic009G227201--Sobic004G354600 Sobic006G059900 Sobic006G059900 Sobic009G227201--Sobic006G059900 Sobic009G227201--Sobic002G143700 Sobic003G438700 Sobic003G438700 Sobic009G227201--Sobic003G438700 Sobic001G166500 Sobic001G166500 Sobic009G227201--Sobic001G166500 Sobic004G313800 Sobic004G313800 Sobic009G227201--Sobic004G313800 Sobic009G227201--Sobic002G344900
Octagon: transcription factors


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