Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G354600.2
Synonym Sb04g038130
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RRI9
Pfam -
Panther DB PTHR37391 PTHR37391:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19990 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g58150.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022661
Brachypodium PNT76016
Barley HORVU4Hr1G076610.2 , HORVU4Hr1G076610.1
Wheat TraesCS4D02G293700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G354600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G227201 - -
2 Sobic.001G394900 expressed protein -
3 Sobic.003G402100 leucine-rich repeat receptor protein kinase EXS precursor, putative, expressed -
4 Sobic.001G150300 2-aminoethanethiol dioxygenase, putative, expressed K10712: cysteamine dioxygenase
5 Sobic.001G394100 - -
6 Sobic.003G101200 paired amphipathic helix repeat-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.008G088881 - -
8 Sobic.002G123100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed K07407: E3.2.1.22B, galA, alpha-galactosidase
9 Sobic.001G053700 PAZ domain containing protein, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
10 Sobic.010G180200 transcription factor S-II, central domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G360900 GASR9 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
12 Sobic.001G233900 expressed protein -
13 Sobic.009G227000 expressed protein -
14 Sobic.004G037300 cycloartenol synthase, putative, expressed -
15 Sobic.004G274500 OsFBD8 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G143700 alpha-soluble NSF attachment protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G242200 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@protein phosphatase 2C, putative, expressed K14497: protein phosphatase 2C
18 Sobic.010G107300 - -
19 Sobic.004G294500 expansin precursor, putative, expressed -
20 Sobic.001G324800 cysteine proteinase inhibitor 8 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G354600 Sobic004G354600 Sobic009G227201 Sobic009G227201 Sobic004G354600--Sobic009G227201 Sobic001G394900 Sobic001G394900 Sobic004G354600--Sobic001G394900 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic004G354600--Sobic003G402100 Sobic001G150300 Sobic001G150300 Sobic004G354600--Sobic001G150300 Sobic001G394100 Sobic001G394100 Sobic004G354600--Sobic001G394100 Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic004G354600--Sobic003G101200 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic004G354600--Sobic008G088881 Sobic002G123100 Sobic002G123100 Sobic004G354600--Sobic002G123100 Sobic001G053700 Sobic001G053700 Sobic004G354600--Sobic001G053700 Sobic009G227201--Sobic001G394100 Sobic008G013100 Sobic008G013100 Sobic009G227201--Sobic008G013100 Sobic009G227201--Sobic004G354600 Sobic006G059900 Sobic006G059900 Sobic009G227201--Sobic006G059900 Sobic002G143700 Sobic002G143700 Sobic009G227201--Sobic002G143700 Sobic003G438700 Sobic003G438700 Sobic009G227201--Sobic003G438700 Sobic001G166500 Sobic001G166500 Sobic009G227201--Sobic001G166500 Sobic004G313800 Sobic004G313800 Sobic009G227201--Sobic004G313800 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic009G227201--Sobic002G344900 Sobic001G324800 Sobic001G324800 Sobic001G394900--Sobic001G324800 Sobic004G294100 Sobic004G294100 Sobic001G394900--Sobic004G294100 Sobic010G022600 Sobic010G022600 Sobic001G394900--Sobic010G022600 Sobic004G099750 Sobic004G099750 Sobic001G394900--Sobic004G099750 Sobic001G394900--Sobic003G402100 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic001G394900--Sobic010G107300 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic001G394900--Sobic005G226150 Sobic001G175501 Sobic001G175501 Sobic001G394900--Sobic001G175501 Sobic001G394900--Sobic008G088881 Sobic003G402100--Sobic001G394900 Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic003G402100--Sobic001G170500 Sobic007G023600 Sobic007G023600 Sobic003G402100--Sobic007G023600 Sobic004G254400 Sobic004G254400 Sobic003G402100--Sobic004G254400 Sobic003G402100--Sobic001G053700 Sobic010G180200 Sobic010G180200 Sobic003G402100--Sobic010G180200 Sobic009G227000 Sobic009G227000 Sobic003G402100--Sobic009G227000 Sobic004G274500 Sobic004G274500 Sobic003G402100--Sobic004G274500 Sobic008G176300 Sobic008G176300 Sobic003G402100--Sobic008G176300 Sobic001G150300--Sobic002G123100 Sobic001G150300--Sobic001G394900 Sobic001G150300--Sobic003G101200 Sobic001G150300--Sobic001G324800 Sobic001G150300--Sobic004G354600 Sobic001G150300--Sobic004G294100 Sobic001G401975 Sobic001G401975 Sobic001G150300--Sobic001G401975 Sobic009G017000 Sobic009G017000 Sobic001G150300--Sobic009G017000 Sobic006G178400 Sobic006G178400 Sobic001G150300--Sobic006G178400 Sobic001G394100--Sobic002G143700 Sobic010G142300 Sobic010G142300 Sobic001G394100--Sobic010G142300 Sobic006G034275 Sobic006G034275 Sobic001G394100--Sobic006G034275 Sobic001G394100--Sobic002G344900 Sobic003G392500 Sobic003G392500 Sobic001G394100--Sobic003G392500 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic001G394100--Sobic005G223200 Sobic005G140300 Sobic005G140300 Sobic001G394100--Sobic005G140300 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic001G394100--Sobic009G010000 Sobic006G031600 Sobic006G031600 Sobic001G394100--Sobic006G031600 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic003G101200--Sobic005G083160 Sobic003G101200--Sobic010G107300 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic003G101200--Sobic009G218100 Sobic002G015800 Sobic002G015800 Sobic003G101200--Sobic002G015800 Sobic001G509100 Sobic001G509100 Sobic003G101200--Sobic001G509100 Sobic002G099866 Sobic002G099866 Sobic003G101200--Sobic002G099866 Sobic004G262100 Sobic004G262100 Sobic003G101200--Sobic004G262100 Sobic002G360900 Sobic002G360900 Sobic003G101200--Sobic002G360900 Sobic003G101200--Sobic010G022600 Sobic008G088881--Sobic005G226150 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic008G088881--Sobic009G007500 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic008G088881--Sobic006G062700 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic008G088881--Sobic008G088450 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic008G088881--Sobic001G112250 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic008G088881--Sobic008G103066 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic008G088881--Sobic007G070700 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic008G088881--Sobic005G174900 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic008G088881--Sobic001G249233 Sobic002G123100--Sobic001G150300 Sobic002G123100--Sobic004G354600 Sobic007G167300 Sobic007G167300 Sobic002G123100--Sobic007G167300 Sobic002G123100--Sobic001G401975 Sobic002G123100--Sobic001G394900 Sobic002G123100--Sobic003G101200 Sobic003G331100 Sobic003G331100 Sobic002G123100--Sobic003G331100 Sobic001G359700 Sobic001G359700 Sobic002G123100--Sobic001G359700 Sobic002G123100--Sobic001G324800 Sobic001G053700--Sobic003G402100 Sobic001G053700--Sobic002G360900 Sobic002G381750 Sobic002G381750 Sobic001G053700--Sobic002G381750 Sobic001G053700--Sobic010G180200 Sobic001G053700--Sobic001G394900 Sobic001G053700--Sobic004G254400 Sobic001G053700--Sobic001G324800 Sobic001G259300 Sobic001G259300 Sobic001G053700--Sobic001G259300 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic001G053700--Sobic003G323000
Octagon: transcription factors


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