Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G197901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S713
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G048000 - -
2 Sobic.007G152701 - -
3 Sobic.006G115532 - -
4 Sobic.004G233100 - -
5 Sobic.003G267400 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
6 Sobic.006G212300 - -
7 Sobic.004G079400 FAR1 family protein, expressed -
8 Sobic.010G227600 - -
9 Sobic.001G519500 - -
10 Sobic.001G369701 - -
11 Sobic.001G115200 - -
12 Sobic.010G263051 - -
13 Sobic.008G135401 - -
14 Sobic.006G007700 CAS1 domain-containing protein 1 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.009G248200 - -
16 Sobic.007G043050 - -
17 Sobic.010G165925 - -
18 Sobic.003G025500 ZOS8-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.007G052100 - -
20 Sobic.010G236950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G197901 Sobic001G197901 Sobic007G048000 Sobic007G048000 Sobic001G197901--Sobic007G048000 Sobic007G152701 Sobic007G152701 Sobic001G197901--Sobic007G152701 Sobic006G115532 Sobic006G115532 Sobic001G197901--Sobic006G115532 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic001G197901--Sobic004G233100 Sobic003G267400 Sobic003G267400 Sobic001G197901--Sobic003G267400 Sobic006G212300 Sobic006G212300 Sobic001G197901--Sobic006G212300 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic001G197901--Sobic004G079400 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic001G197901--Sobic010G227600 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic001G197901--Sobic001G519500 Sobic007G048000--Sobic007G152701 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic007G048000--Sobic010G263051 SobicK044420 SobicK044420 Sobic007G048000--SobicK044420 Sobic003G033400 Sobic003G033400 Sobic007G048000--Sobic003G033400 Sobic010G236950 Sobic010G236950 Sobic007G048000--Sobic010G236950 Sobic007G048000--Sobic004G233100 Sobic009G220400 Sobic009G220400 Sobic007G048000--Sobic009G220400 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic007G048000--Sobic001G115200 Sobic007G048000--Sobic010G227600 Sobic007G152701--Sobic010G236950 Sobic007G152701--Sobic010G263051 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic007G152701--Sobic010G165925 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic007G152701--Sobic007G003250 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic007G152701--Sobic001G369701 Sobic003G199650 Sobic003G199650 Sobic007G152701--Sobic003G199650 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic007G152701--Sobic005G107250 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic007G152701--Sobic002G142550 Sobic001G355850 Sobic001G355850 Sobic007G152701--Sobic001G355850 Sobic006G115532--Sobic004G233100 Sobic003G373700 Sobic003G373700 Sobic006G115532--Sobic003G373700 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic006G115532--Sobic008G157400 Sobic002G307700 Sobic002G307700 Sobic006G115532--Sobic002G307700 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic006G115532--Sobic004G115950 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic006G115532--Sobic010G263151 Sobic006G115532--Sobic010G165925 Sobic006G115532--Sobic006G212300 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic006G115532--Sobic006G196800 Sobic004G233100--Sobic010G227600 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic004G233100--Sobic001G509901 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic004G233100--Sobic009G248200 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G233100--Sobic003G030100 Sobic004G233100--Sobic001G115200 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic004G233100--Sobic004G061100 Sobic004G233100--Sobic004G079400 Sobic004G233100--Sobic006G115532 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic004G233100--Sobic009G206900 Sobic003G267400--Sobic010G263151 Sobic003G267400--Sobic006G196800 Sobic001G209000 Sobic001G209000 Sobic003G267400--Sobic001G209000 Sobic003G188700 Sobic003G188700 Sobic003G267400--Sobic003G188700 Sobic003G267400--Sobic010G165925 Sobic003G419100 Sobic003G419100 Sobic003G267400--Sobic003G419100 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic003G267400--Sobic007G203600 Sobic003G267400--Sobic007G003250 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic003G267400--Sobic006G007700 Sobic006G212300--Sobic006G115532 Sobic006G212300--Sobic003G267400 Sobic006G212300--Sobic010G165925 Sobic006G212300--Sobic001G369701 Sobic006G212300--Sobic010G263151 Sobic006G212300--Sobic007G003250 Sobic006G212300--Sobic001G519500 Sobic006G212300--Sobic002G142550 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic006G212300--Sobic003G025500 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic004G079400--Sobic003G311300 Sobic004G079400--Sobic004G061100 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic004G079400--Sobic003G031300 Sobic004G079400--Sobic003G030100 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic004G079400--Sobic001G208133 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic004G079400--Sobic006G239200 Sobic004G079400--Sobic010G227600 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic004G079400--Sobic001G175200 Sobic004G079400--Sobic004G233100 Sobic010G227600--Sobic004G233100 Sobic010G227600--Sobic003G030100 Sobic010G227600--Sobic009G206900 Sobic010G227600--Sobic004G079400 Sobic006G090450 Sobic006G090450 Sobic010G227600--Sobic006G090450 Sobic010G227600--Sobic001G519500 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic010G227600--Sobic007G043050 Sobic001G372400 Sobic001G372400 Sobic010G227600--Sobic001G372400 Sobic001G257600 Sobic001G257600 Sobic010G227600--Sobic001G257600 Sobic001G519500--Sobic007G043050 Sobic001G519500--Sobic006G007700 Sobic001G519500--Sobic001G369701 Sobic001G519500--Sobic010G165925 Sobic001G519500--Sobic007G003250 Sobic001G519500--Sobic005G107250 Sobic001G519500--Sobic002G142550 Sobic001G519500--Sobic001G115200 Sobic001G519500--Sobic006G196800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.