Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G226200.1,Sobic.001G226200.4,Sobic.001G226200.3,Sobic.001G226200.2,Sobic.001G226200.5,Sobic.001G226200.6
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S6X1 , A0A1B6QKE5 , A0A1B6QKF6 , A0A1B6QKG1 , A0A1Z5S767 , A0A1Z5S6V8
Pfam -
Panther DB PTHR12181 PTHR12181:SF35
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G23255 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g32860.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017675
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G226200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.005G110350 - -
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19 Sobic.009G195100 NLI interacting factor-like phosphatase, putative, expressed K17496: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50
20 Sobic.008G138850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G226200 Sobic001G226200 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic001G226200--Sobic010G045966 Sobic001G491500 Sobic001G491500 Sobic001G226200--Sobic001G491500 Sobic009G210800 Sobic009G210800 Sobic001G226200--Sobic009G210800 Sobic009G255400 Sobic009G255400 Sobic001G226200--Sobic009G255400 Sobic003G202700 Sobic003G202700 Sobic001G226200--Sobic003G202700 Sobic002G316400 Sobic002G316400 Sobic001G226200--Sobic002G316400 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic001G226200--Sobic002G325000 Sobic007G182700 Sobic007G182700 Sobic001G226200--Sobic007G182700 Sobic007G183500 Sobic007G183500 Sobic001G226200--Sobic007G183500 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic010G045966--Sobic010G252301 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic010G045966--Sobic002G025900 Sobic001G325500 Sobic001G325500 Sobic010G045966--Sobic001G325500 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic010G045966--Sobic008G053500 Sobic005G183900 Sobic005G183900 Sobic010G045966--Sobic005G183900 Sobic005G110350 Sobic005G110350 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Octagon: transcription factors


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