Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G249200.1
Synonym FLK, Sb01g022040
Functional annotation KH domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5WM46
Pfam PF00013
Panther DB PTHR10288:SF152 PTHR10288
NCBI CDD -
KEGG Orthology K13162; poly(rC)-binding protein 2
Gene Ontology GO:0003723; RNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G04610 : RNA-binding KH domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g27470.1 : KH domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017789
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G036280.1 , HORVU1Hr1G036280.2
Wheat TraesCS1A02G136600 , TraesCS1D02G134700 , TraesCS1B02G155000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G249200 Sobic001G249200 Sobic005G071300 Sobic005G071300 Sobic001G249200--Sobic005G071300 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic001G249200--Sobic010G031400 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic001G249200--Sobic001G297700 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic001G249200--Sobic005G185400 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic001G249200--Sobic009G057100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic001G249200--Sobic010G035000 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic001G249200--Sobic005G184500 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic001G249200--Sobic006G105300 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic001G249200--Sobic002G300900 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic005G071300--Sobic005G184400 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic005G071300--Sobic005G184600 Sobic005G071300--Sobic006G105300 Sobic005G071300--Sobic010G035000 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic005G071300--Sobic007G049000 Sobic005G071300--Sobic005G184500 Sobic005G071300--Sobic005G185400 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic005G071300--Sobic006G142850 Sobic005G071300--Sobic001G297700 Sobic010G031400--Sobic005G185400 Sobic010G031400--Sobic005G184500 Sobic010G031400--Sobic001G297700 Sobic010G031400--Sobic009G057100 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic010G031400--Sobic006G081400 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic010G031400--Sobic005G033400 Sobic010G031400--Sobic006G105300 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic010G031400--Sobic004G071100 Sobic010G031400--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic005G184400 Sobic005G185400--Sobic005G184500 Sobic005G185400--Sobic006G105300 Sobic005G185400--Sobic006G081400 Sobic005G185400--Sobic001G297700 Sobic005G185400--Sobic005G184600 Sobic005G185400--Sobic005G033400 Sobic005G185400--Sobic005G184400 Sobic005G185400--Sobic010G031400 Sobic005G185400--Sobic010G035000 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic006G081400 Sobic009G057100--Sobic004G071100 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G033400 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic001G284700 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic009G057100--Sobic002G015500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic004G029800 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic009G057100--Sobic003G294800 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic010G035000--Sobic005G185400 Sobic005G184500--Sobic005G185400 Sobic005G184500--Sobic006G105300 Sobic005G184500--Sobic005G184600 Sobic005G184500--Sobic005G184400 Sobic005G184500--Sobic007G049000 Sobic005G184500--Sobic010G035000 Sobic005G184500--Sobic001G297700 Sobic005G184500--Sobic006G142850 Sobic005G184500--Sobic010G031400 Sobic006G105300--Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic005G184400 Sobic006G105300--Sobic005G184600 Sobic006G105300--Sobic005G184500 Sobic006G105300--Sobic007G049000 Sobic006G105300--Sobic006G142850 Sobic006G105300--Sobic001G297700 Sobic006G105300--Sobic005G185400 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic006G105300--Sobic009G007100 Sobic002G300900--Sobic007G025100 Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic002G300900--Sobic006G040101 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic002G300900--Sobic002G059500 Sobic002G300900--Sobic001G297700 Sobic002G300900--Sobic007G131100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G300900--Sobic001G511400 Sobic002G300900--Sobic010G035000 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic002G300900--Sobic002G172200 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G300900--Sobic003G266100
Octagon: transcription factors


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