Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G455300.1
Synonym Sb01g042780, ZFP8
Functional annotation ZOS3-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt C5WSR9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G41940 : zinc finger protein 8
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g11680.1 : ZOS3-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001320
Brachypodium KQK22874 , KQJ95902
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G149600 - -
2 Sobic.004G072600 - -
3 Sobic.002G163400 - -
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5 Sobic.002G074700 receptor kinase, putative, expressed -
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9 Sobic.002G168750 - -
10 Sobic.007G134700 formin, putative, expressed -
11 Sobic.005G176300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.001G154450 - -
13 Sobic.002G121050 - -
14 Sobic.003G172000 - -
15 Sobic.009G094100 - -
16 Sobic.004G260250 - -
17 Sobic.010G052100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.002G168700 carotenoid cleavage dioxygenase, putative, expressed -
19 Sobic.006G037800 - -
20 Sobic.007G083700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G455300 Sobic001G455300 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic001G455300--Sobic002G149600 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic001G455300--Sobic004G072600 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic001G455300--Sobic002G163400 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic001G455300--Sobic003G263450 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic001G455300--Sobic002G074700 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic001G455300--Sobic003G251000 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic001G455300--Sobic006G094900 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic001G455300--Sobic008G056000 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic001G455300--Sobic002G168750 Sobic002G149600--Sobic002G074700 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic002G149600--Sobic002G121050 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic002G149600--Sobic003G172000 Sobic002G149600--Sobic003G263450 Sobic002G149600--Sobic004G072600 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic002G149600--Sobic009G094100 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic002G149600--Sobic001G154450 Sobic002G149600--Sobic006G094900 Sobic002G149600--Sobic002G163400 Sobic004G072600--Sobic002G149600 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic004G072600--Sobic005G176300 Sobic004G072600--Sobic009G094100 Sobic004G072600--Sobic002G074700 Sobic004G072600--Sobic002G163400 Sobic004G072600--Sobic002G121050 Sobic004G072600--Sobic003G251000 Sobic004G072600--Sobic003G172000 Sobic004G072600--Sobic003G263450 Sobic002G163400--Sobic004G072600 Sobic002G163400--Sobic002G149600 Sobic002G163400--Sobic002G074700 Sobic002G163400--Sobic009G094100 Sobic002G163400--Sobic003G263450 Sobic002G163400--Sobic003G251000 Sobic002G163400--Sobic001G154450 Sobic002G163500 Sobic002G163500 Sobic002G163400--Sobic002G163500 Sobic010G174000 Sobic010G174000 Sobic002G163400--Sobic010G174000 Sobic003G263450--Sobic002G149600 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic003G263450--Sobic002G018200 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic003G263450--Sobic004G334501 Sobic003G263450--Sobic002G121050 Sobic003G263450--Sobic002G074700 Sobic003G263450--Sobic003G172000 Sobic003G263450--Sobic004G072600 Sobic003G263450--Sobic006G094900 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic003G263450--Sobic004G159866 Sobic002G074700--Sobic002G149600 Sobic002G074700--Sobic002G121050 Sobic002G074700--Sobic003G172000 Sobic002G074700--Sobic003G263450 Sobic002G074700--Sobic001G154450 Sobic002G074700--Sobic004G072600 Sobic002G074700--Sobic002G163400 Sobic002G074700--Sobic009G094100 Sobic002G074700--Sobic006G094900 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic003G251000--Sobic006G149900 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic003G251000--Sobic002G154450 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic003G251000--Sobic010G052100 Sobic003G251000--Sobic009G094100 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic003G251000--Sobic004G127350 Sobic003G251000--Sobic005G176300 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic003G251000--Sobic006G037800 Sobic003G251000--Sobic004G072600 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic003G251000--Sobic007G103200 Sobic006G094900--Sobic002G121050 Sobic006G094900--Sobic003G172000 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic006G094900--Sobic002G094000 Sobic006G094900--Sobic002G149600 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic006G094900--Sobic009G213150 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic006G094900--Sobic005G024500 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic006G094900--Sobic007G179266 Sobic006G094900--Sobic001G154450 Sobic006G094900--Sobic009G094100 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic008G056000--Sobic001G440401 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic008G056000--Sobic007G134700 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic008G056000--Sobic010G149000 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic008G056000--Sobic003G288700 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic008G056000--Sobic002G025900 Sobic008G056000--Sobic003G251000 Sobic008G056000--Sobic002G168750 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic008G056000--Sobic006G065000 Sobic008G056000--Sobic006G037800 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic002G168750--Sobic007G083700 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic002G168750--Sobic002G168700 Sobic002G168750--Sobic001G440401 Sobic006G233900 Sobic006G233900 Sobic002G168750--Sobic006G233900 Sobic002G168750--Sobic004G159866 Sobic002G168750--Sobic003G288700 Sobic002G168750--Sobic008G056000 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic002G168750--Sobic008G167900 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic002G168750--Sobic001G072100
Octagon: transcription factors


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