Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G002400.1
Synonym Sb02g000390
Functional annotation Protein kinase domain containing protein, expressed
UniProt C5X736
Pfam PF01657 PF00069
Panther DB PTHR27009 PTHR27009:SF14
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology K04730; interleukin-1 receptor-associated kinase 1
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G70250 : receptor serine/threonine kinase, putative
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g49580.1 : Protein kinase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017146
Brachypodium KQK18098
Barley HORVU3Hr1G002270.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.006G272450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G002400 Sobic002G002400 Sobic009G249301 Sobic009G249301 Sobic002G002400--Sobic009G249301 Sobic005G097700 Sobic005G097700 Sobic002G002400--Sobic005G097700 Sobic002G175550 Sobic002G175550 Sobic002G002400--Sobic002G175550 Sobic002G040500 Sobic002G040500 Sobic002G002400--Sobic002G040500 Sobic005G208500 Sobic005G208500 Sobic002G002400--Sobic005G208500 Sobic003G174850 Sobic003G174850 Sobic002G002400--Sobic003G174850 Sobic001G378550 Sobic001G378550 Sobic002G002400--Sobic001G378550 Sobic003G325300 Sobic003G325300 Sobic002G002400--Sobic003G325300 Sobic006G019000 Sobic006G019000 Sobic002G002400--Sobic006G019000 Sobic008G150150 Sobic008G150150 Sobic009G249301--Sobic008G150150 Sobic010G074960 Sobic010G074960 Sobic009G249301--Sobic010G074960 Sobic001G019100 Sobic001G019100 Sobic009G249301--Sobic001G019100 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic009G249301--Sobic010G275550 Sobic010G058650 Sobic010G058650 Sobic009G249301--Sobic010G058650 Sobic003G288900 Sobic003G288900 Sobic009G249301--Sobic003G288900 Sobic009G194600 Sobic009G194600 Sobic009G249301--Sobic009G194600 Sobic009G004000 Sobic009G004000 Sobic009G249301--Sobic009G004000 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic009G249301--Sobic003G343100 Sobic005G097700--Sobic002G175550 Sobic004G356600 Sobic004G356600 Sobic005G097700--Sobic004G356600 Sobic002G004400 Sobic002G004400 Sobic005G097700--Sobic002G004400 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic005G097700--Sobic006G090201 Sobic007G210400 Sobic007G210400 Sobic005G097700--Sobic007G210400 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic005G097700--Sobic007G072901 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic005G097700--Sobic003G357000 Sobic002G034400 Sobic002G034400 Sobic005G097700--Sobic002G034400 Sobic006G228400 Sobic006G228400 Sobic005G097700--Sobic006G228400 Sobic002G175550--Sobic005G097700 Sobic002G175550--Sobic007G210400 Sobic002G175550--Sobic002G004400 Sobic002G175550--Sobic001G378550 Sobic002G175550--Sobic006G090201 Sobic003G221300 Sobic003G221300 Sobic002G175550--Sobic003G221300 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic002G175550--Sobic005G037500 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic002G175550--Sobic004G330500 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic002G175550--Sobic005G189400 Sobic002G040500--Sobic005G208500 Sobic006G165650 Sobic006G165650 Sobic002G040500--Sobic006G165650 Sobic002G040500--Sobic002G002400 Sobic009G206400 Sobic009G206400 Sobic002G040500--Sobic009G206400 Sobic002G040500--Sobic003G325300 Sobic009G070900 Sobic009G070900 Sobic002G040500--Sobic009G070900 Sobic002G040500--Sobic002G175550 Sobic002G040500--Sobic001G378550 Sobic003G423100 Sobic003G423100 Sobic002G040500--Sobic003G423100 Sobic003G309600 Sobic003G309600 Sobic005G208500--Sobic003G309600 Sobic006G204000 Sobic006G204000 Sobic005G208500--Sobic006G204000 Sobic005G208500--Sobic001G378550 Sobic010G244600 Sobic010G244600 Sobic005G208500--Sobic010G244600 Sobic002G218200 Sobic002G218200 Sobic005G208500--Sobic002G218200 Sobic009G125500 Sobic009G125500 Sobic005G208500--Sobic009G125500 Sobic004G124800 Sobic004G124800 Sobic005G208500--Sobic004G124800 Sobic001G139600 Sobic001G139600 Sobic005G208500--Sobic001G139600 Sobic010G206700 Sobic010G206700 Sobic005G208500--Sobic010G206700 Sobic003G174850--Sobic009G249301 Sobic003G174850--Sobic003G343100 Sobic003G174850--Sobic009G194600 Sobic003G174850--Sobic010G058650 Sobic004G072950 Sobic004G072950 Sobic003G174850--Sobic004G072950 Sobic003G174850--Sobic003G288900 Sobic003G174850--Sobic010G275550 Sobic006G201200 Sobic006G201200 Sobic003G174850--Sobic006G201200 Sobic003G174850--Sobic010G074960 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic001G378550--Sobic006G185400 Sobic001G378550--Sobic004G330500 Sobic001G378550--Sobic003G343100 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic001G378550--Sobic007G152200 Sobic001G378550--Sobic005G189400 Sobic001G378550--Sobic005G037500 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic001G378550--Sobic002G205201 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic001G378550--Sobic001G361500 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic001G378550--Sobic006G209100 Sobic003G325300--Sobic002G002400 Sobic003G325300--Sobic002G175550 Sobic003G325300--Sobic001G378550 Sobic003G325300--Sobic009G249301 Sobic003G325300--Sobic002G040500 Sobic003G325300--Sobic005G097700 Sobic001G419900 Sobic001G419900 Sobic003G325300--Sobic001G419900 Sobic001G172900 Sobic001G172900 Sobic003G325300--Sobic001G172900 Sobic007G051501 Sobic007G051501 Sobic003G325300--Sobic007G051501 Sobic010G251800 Sobic010G251800 Sobic006G019000--Sobic010G251800 Sobic003G232200 Sobic003G232200 Sobic006G019000--Sobic003G232200 Sobic006G153550 Sobic006G153550 Sobic006G019000--Sobic006G153550 Sobic006G019000--Sobic007G051501 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic006G019000--Sobic003G045800 Sobic006G019000--Sobic001G172900 Sobic006G019000--Sobic003G288900 Sobic002G295550 Sobic002G295550 Sobic006G019000--Sobic002G295550 Sobic004G098200 Sobic004G098200 Sobic006G019000--Sobic004G098200
Octagon: transcription factors


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