Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G019000.2
Synonym Sb06g001776
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RBK9
Pfam PF04195
Panther DB PTHR31099
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g06950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G251800 DUF617 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G232200 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
3 Sobic.006G153550 - -
4 Sobic.007G051501 - -
5 Sobic.003G045800 - -
6 Sobic.001G172900 - -
7 Sobic.003G288900 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G295550 - -
9 Sobic.004G098200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
10 Sobic.010G014600 aspartic protease, putative, expressed -
11 Sobic.006G214101 - -
12 Sobic.009G004000 - -
13 Sobic.002G004400 expressed protein -
14 Sobic.004G072950 - -
15 Sobic.003G192801 - -
16 Sobic.001G128900 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.001G261553 - -
18 Sobic.004G199000 expressed protein -
19 Sobic.007G072901 - -
20 Sobic.008G023500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G019000 Sobic006G019000 Sobic010G251800 Sobic010G251800 Sobic006G019000--Sobic010G251800 Sobic003G232200 Sobic003G232200 Sobic006G019000--Sobic003G232200 Sobic006G153550 Sobic006G153550 Sobic006G019000--Sobic006G153550 Sobic007G051501 Sobic007G051501 Sobic006G019000--Sobic007G051501 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic006G019000--Sobic003G045800 Sobic001G172900 Sobic001G172900 Sobic006G019000--Sobic001G172900 Sobic003G288900 Sobic003G288900 Sobic006G019000--Sobic003G288900 Sobic002G295550 Sobic002G295550 Sobic006G019000--Sobic002G295550 Sobic004G098200 Sobic004G098200 Sobic006G019000--Sobic004G098200 Sobic010G251800--Sobic006G019000 Sobic010G251800--Sobic003G232200 Sobic010G251800--Sobic006G153550 Sobic010G251800--Sobic002G295550 Sobic010G251800--Sobic007G051501 Sobic010G251800--Sobic004G098200 Sobic010G251800--Sobic003G045800 Sobic009G004000 Sobic009G004000 Sobic010G251800--Sobic009G004000 Sobic010G251800--Sobic001G172900 Sobic003G232200--Sobic010G251800 Sobic003G232200--Sobic006G153550 Sobic003G232200--Sobic006G019000 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic003G232200--Sobic006G214101 Sobic003G232200--Sobic003G045800 Sobic003G232200--Sobic004G098200 Sobic010G149900 Sobic010G149900 Sobic003G232200--Sobic010G149900 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic003G232200--Sobic010G014600 Sobic004G072950 Sobic004G072950 Sobic003G232200--Sobic004G072950 Sobic006G153550--Sobic003G232200 Sobic001G229401 Sobic001G229401 Sobic006G153550--Sobic001G229401 Sobic006G153550--Sobic006G019000 Sobic006G153550--Sobic010G149900 Sobic006G153550--Sobic006G214101 Sobic006G153550--Sobic010G251800 Sobic006G153550--Sobic010G014600 Sobic006G153550--Sobic004G072950 Sobic006G153550--Sobic003G045800 Sobic007G051501--Sobic001G172900 Sobic007G051501--Sobic006G019000 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic007G051501--Sobic008G023500 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic007G051501--Sobic003G245700 Sobic007G051501--Sobic003G288900 Sobic005G022400 Sobic005G022400 Sobic007G051501--Sobic005G022400 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic007G051501--Sobic009G164200 Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic007G051501--Sobic003G178200 Sobic007G051501--Sobic010G251800 Sobic003G045800--Sobic008G023500 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic003G045800--Sobic007G072901 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic003G045800--Sobic007G152200 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic003G045800--Sobic005G189400 Sobic003G045800--Sobic009G164200 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic003G045800--Sobic004G351866 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic003G045800--Sobic004G330500 Sobic003G045800--Sobic010G014600 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic003G045800--Sobic006G185400 Sobic001G172900--Sobic008G023500 Sobic001G172900--Sobic009G164200 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic001G172900--Sobic002G037000 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic001G172900--Sobic006G209100 Sobic001G172900--Sobic006G185400 Sobic001G172900--Sobic004G330500 Sobic001G172900--Sobic005G189400 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic001G172900--Sobic001G361500 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic001G172900--Sobic005G037500 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic003G288900--Sobic010G275550 Sobic003G288900--Sobic001G172900 Sobic008G150150 Sobic008G150150 Sobic003G288900--Sobic008G150150 Sobic003G288900--Sobic008G023500 Sobic010G074960 Sobic010G074960 Sobic003G288900--Sobic010G074960 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic003G288900--Sobic003G343100 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic003G288900--Sobic002G205201 Sobic003G288900--Sobic004G330500 Sobic003G288900--Sobic006G185400 Sobic003G192801 Sobic003G192801 Sobic002G295550--Sobic003G192801 Sobic002G295550--Sobic010G251800 Sobic002G295550--Sobic003G288900 Sobic002G295550--Sobic004G072950 Sobic003G292800 Sobic003G292800 Sobic002G295550--Sobic003G292800 Sobic002G295550--Sobic010G074960 Sobic002G295550--Sobic006G019000 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic002G295550--Sobic005G106800 Sobic002G295550--Sobic009G004000 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic004G098200--Sobic003G357000 Sobic004G098200--Sobic002G037000 Sobic004G098200--Sobic008G023500 Sobic001G019100 Sobic001G019100 Sobic004G098200--Sobic001G019100 Sobic004G098200--Sobic003G045800 Sobic004G098200--Sobic001G172900 Sobic004G098200--Sobic009G164200 Sobic009G010800 Sobic009G010800 Sobic004G098200--Sobic009G010800 Sobic004G098200--Sobic005G037500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.