Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G098200.1
Synonym CNI1, Sb04g008070, ATL31
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RMR2
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF165
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G27420 : carbon/nitrogen insensitive 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g15010.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020123
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.007G152200 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G098200 Sobic004G098200 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic004G098200--Sobic003G357000 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic004G098200--Sobic002G037000 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic004G098200--Sobic008G023500 Sobic001G019100 Sobic001G019100 Sobic004G098200--Sobic001G019100 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic004G098200--Sobic003G045800 Sobic001G172900 Sobic001G172900 Sobic004G098200--Sobic001G172900 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic004G098200--Sobic009G164200 Sobic009G010800 Sobic009G010800 Sobic004G098200--Sobic009G010800 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic004G098200--Sobic005G037500 Sobic003G357000--Sobic008G023500 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic003G357000--Sobic004G351866 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic003G357000--Sobic006G185400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic003G357000--Sobic004G330500 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic003G357000--Sobic005G189400 Sobic003G357000--Sobic009G164200 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic003G357000--Sobic002G205201 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic003G357000--Sobic001G361500 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic003G357000--Sobic006G209100 Sobic002G037000--Sobic005G037500 Sobic002G037000--Sobic006G185400 Sobic002G037000--Sobic004G330500 Sobic002G037000--Sobic005G189400 Sobic002G037000--Sobic008G023500 Sobic002G037000--Sobic002G205201 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic002G037000--Sobic010G275550 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic002G037000--Sobic007G152200 Sobic002G037000--Sobic001G361500 Sobic008G023500--Sobic006G185400 Sobic008G023500--Sobic004G330500 Sobic008G023500--Sobic005G189400 Sobic008G023500--Sobic009G164200 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic003G245700 Sobic008G023500--Sobic002G205201 Sobic008G023500--Sobic007G152200 Sobic008G023500--Sobic006G209100 Sobic008G023500--Sobic001G361500 Sobic008G150150 Sobic008G150150 Sobic001G019100--Sobic008G150150 Sobic003G335800 Sobic003G335800 Sobic001G019100--Sobic003G335800 Sobic001G019100--Sobic002G037000 Sobic001G019100--Sobic005G037500 Sobic001G019100--Sobic010G275550 Sobic001G019100--Sobic001G172900 Sobic001G019100--Sobic006G185400 Sobic001G019100--Sobic008G023500 Sobic001G019100--Sobic004G330500 Sobic003G045800--Sobic008G023500 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic003G045800--Sobic007G072901 Sobic003G045800--Sobic007G152200 Sobic003G045800--Sobic005G189400 Sobic003G045800--Sobic009G164200 Sobic003G045800--Sobic004G351866 Sobic003G045800--Sobic004G330500 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic003G045800--Sobic010G014600 Sobic003G045800--Sobic006G185400 Sobic001G172900--Sobic008G023500 Sobic001G172900--Sobic009G164200 Sobic001G172900--Sobic002G037000 Sobic001G172900--Sobic006G209100 Sobic001G172900--Sobic006G185400 Sobic001G172900--Sobic004G330500 Sobic001G172900--Sobic005G189400 Sobic001G172900--Sobic001G361500 Sobic001G172900--Sobic005G037500 Sobic009G164200--Sobic004G330500 Sobic009G164200--Sobic006G185400 Sobic009G164200--Sobic008G023500 Sobic009G164200--Sobic005G189400 Sobic009G164200--Sobic001G361500 Sobic009G164200--Sobic006G209100 Sobic009G164200--Sobic007G152200 Sobic009G164200--Sobic002G205201 Sobic009G164200--Sobic005G037500 Sobic009G010800--Sobic006G185400 Sobic009G010800--Sobic004G330500 Sobic009G010800--Sobic005G189400 Sobic009G010800--Sobic001G361500 Sobic009G010800--Sobic002G205201 Sobic009G010800--Sobic006G209100 Sobic009G010800--Sobic007G152200 Sobic009G010800--Sobic008G023500 Sobic009G010800--Sobic003G245700 Sobic005G037500--Sobic002G037000 Sobic005G037500--Sobic006G185400 Sobic005G037500--Sobic004G330500 Sobic005G037500--Sobic005G189400 Sobic005G037500--Sobic002G205201 Sobic005G037500--Sobic007G152200 Sobic005G037500--Sobic006G209100 Sobic005G037500--Sobic001G361500 Sobic005G037500--Sobic008G023500
Octagon: transcription factors


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