Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G011200.2
Synonym Sb02g001190
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W1U0
Pfam PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF31
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g24410.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2A02G556600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G048201 - -
2 Sobic.009G174833 - -
3 Sobic.003G387400 - -
4 Sobic.008G139200 - -
5 Sobic.010G057250 - -
6 Sobic.001G437600 - -
7 Sobic.010G025200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G173900 - -
9 Sobic.003G243750 - -
10 Sobic.007G201300 30S ribosomal protein S16, putative, expressed -
11 Sobic.005G061300 - -
12 Sobic.004G200501 - -
13 Sobic.003G333150 - -
14 Sobic.008G045300 citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
15 Sobic.003G118750 - -
16 Sobic.005G059300 ctr copper transporter family protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G141400 expressed protein -
18 Sobic.001G223000 cyclin-dependent kinase G-1, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
19 Sobic.007G180800 - -
20 Sobic.003G201800 coiled-coil domain-containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G011200 Sobic002G011200 Sobic004G048201 Sobic004G048201 Sobic002G011200--Sobic004G048201 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic002G011200--Sobic009G174833 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic002G011200--Sobic003G387400 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic002G011200--Sobic008G139200 Sobic010G057250 Sobic010G057250 Sobic002G011200--Sobic010G057250 Sobic001G437600 Sobic001G437600 Sobic002G011200--Sobic001G437600 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic002G011200--Sobic010G025200 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic002G011200--Sobic004G173900 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic002G011200--Sobic003G243750 Sobic004G048201--Sobic009G174833 Sobic004G048201--Sobic004G173900 Sobic007G201300 Sobic007G201300 Sobic004G048201--Sobic007G201300 Sobic004G048201--Sobic008G139200 Sobic004G048201--Sobic003G387400 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic004G048201--Sobic004G200501 Sobic005G059300 Sobic005G059300 Sobic004G048201--Sobic005G059300 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic004G048201--Sobic003G118750 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic004G048201--Sobic003G141400 Sobic009G174833--Sobic004G173900 Sobic009G174833--Sobic004G048201 Sobic009G174833--Sobic007G201300 Sobic009G174833--Sobic004G200501 Sobic009G174833--Sobic008G139200 Sobic009G174833--Sobic005G059300 Sobic009G174833--Sobic003G387400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic009G174833--Sobic008G045900 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic009G174833--Sobic008G045100 Sobic003G387400--Sobic009G174833 Sobic003G387400--Sobic004G173900 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic003G387400--Sobic006G144900 Sobic003G387400--Sobic007G201300 Sobic003G387400--Sobic003G118750 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic003G387400--Sobic002G260500 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic003G387400--Sobic003G210701 Sobic003G387400--Sobic004G200501 Sobic003G387400--Sobic008G139200 Sobic008G139200--Sobic004G173900 Sobic008G139200--Sobic003G118750 Sobic008G139200--Sobic005G059300 Sobic008G139200--Sobic004G200501 Sobic008G139200--Sobic003G141400 Sobic008G139200--Sobic009G174833 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic008G139200--Sobic010G010100 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic008G139200--Sobic010G091750 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic008G139200--Sobic007G087500 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic010G057250--Sobic005G219800 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic010G057250--Sobic008G008701 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic010G057250--Sobic005G207550 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic010G057250--Sobic004G122700 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic010G057250--Sobic001G138500 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic010G057250--Sobic007G027400 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic010G057250--Sobic001G045300 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic010G057250--Sobic004G090900 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic010G057250--Sobic002G046500 Sobic001G437600--Sobic010G010100 Sobic001G437600--Sobic005G059300 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic001G437600--Sobic003G339400 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic001G437600--Sobic009G142600 Sobic001G437600--Sobic005G219800 Sobic001G437600--Sobic004G173900 Sobic001G437600--Sobic008G045900 Sobic001G437600--Sobic008G139200 Sobic001G437600--Sobic010G091750 Sobic010G025200--Sobic006G144900 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic010G025200--Sobic003G333150 Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic010G025200--Sobic005G114000 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic010G025200--Sobic005G061300 Sobic010G025200--Sobic003G387400 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic010G025200--Sobic003G002800 Sobic010G025200--Sobic002G260500 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic010G025200--Sobic009G160900 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic010G025200--Sobic005G005100 Sobic004G173900--Sobic005G059300 Sobic004G173900--Sobic003G118750 Sobic004G173900--Sobic003G141400 Sobic004G173900--Sobic008G139200 Sobic004G173900--Sobic004G200501 Sobic004G173900--Sobic009G174833 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic004G173900--Sobic002G103400 Sobic004G173900--Sobic007G201300 Sobic004G173900--Sobic007G087500 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic003G243750--Sobic007G185000 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic003G243750--Sobic009G203600 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic003G243750--Sobic002G377400 Sobic003G243750--Sobic003G333150 Sobic003G130650 Sobic003G130650 Sobic003G243750--Sobic003G130650 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic003G243750--Sobic008G045300 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic003G243750--Sobic003G308900 Sobic003G243750--Sobic010G025200 Sobic003G243750--Sobic006G144900
Octagon: transcription factors


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