Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G093800.2,Sobic.002G093800.4,Sobic.002G093800.3,Sobic.002G093800.1
Synonym Sb02g007760
Functional annotation Jacalin-like lectin domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W350 , A0A1B6QA90
Pfam PF03018 PF01419
Panther DB PTHR21495 PTHR21495:SF81
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G19715 : Mannose-binding lectin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g09700.1 : Jacalin-like lectin domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G080500 - -
2 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
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7 Sobic.007G023650 - -
8 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
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10 Sobic.003G242500 expressed protein -
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12 Sobic.009G067700 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
13 Sobic.001G507933 - -
14 Sobic.001G495100 expressed protein -
15 Sobic.002G182601 - -
16 Sobic.004G254200 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
17 Sobic.003G408700 expressed protein -
18 Sobic.010G141700 FAR1 family protein, expressed -
19 Sobic.003G434500 expressed protein -
20 Sobic.007G078400 transketolase, chloroplast precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G093800 Sobic002G093800 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic002G093800--Sobic009G080500 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic002G093800--Sobic002G250700 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic002G093800--Sobic004G204700 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic002G093800--Sobic009G225250 Sobic008G177700 Sobic008G177700 Sobic002G093800--Sobic008G177700 Sobic003G358500 Sobic003G358500 Sobic002G093800--Sobic003G358500 Sobic007G023650 Sobic007G023650 Sobic002G093800--Sobic007G023650 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic002G093800--Sobic008G043000 Sobic006G080050 Sobic006G080050 Sobic002G093800--Sobic006G080050 Sobic009G080500--Sobic009G225250 Sobic009G080500--Sobic008G043000 Sobic009G080500--Sobic002G250700 Sobic009G080500--Sobic004G204700 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic009G080500--Sobic005G002350 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic009G080500--Sobic009G062150 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic009G080500--Sobic003G255000 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic009G080500--Sobic009G067700 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic009G080500--Sobic008G172900 Sobic002G250700--Sobic009G225250 Sobic002G250700--Sobic008G043000 Sobic002G250700--Sobic004G204700 Sobic002G250700--Sobic003G255000 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic002G250700--Sobic002G064100 Sobic002G250700--Sobic009G067700 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic008G172900 Sobic002G250700--Sobic005G002350 Sobic004G204700--Sobic009G225250 Sobic004G204700--Sobic009G067700 Sobic004G204700--Sobic002G291850 Sobic004G204700--Sobic002G250700 Sobic004G204700--Sobic008G043000 Sobic004G204700--Sobic009G062150 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic004G204700--Sobic010G142132 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic004G204700--Sobic001G183900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic004G204700--Sobic009G128901 Sobic009G225250--Sobic008G043000 Sobic009G225250--Sobic002G250700 Sobic009G225250--Sobic004G204700 Sobic009G225250--Sobic003G255000 Sobic009G225250--Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic008G172900 Sobic009G225250--Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic005G002350 Sobic003G242500 Sobic003G242500 Sobic008G177700--Sobic003G242500 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic008G177700--Sobic001G507933 Sobic004G254200 Sobic004G254200 Sobic008G177700--Sobic004G254200 Sobic003G408700 Sobic003G408700 Sobic008G177700--Sobic003G408700 Sobic010G141700 Sobic010G141700 Sobic008G177700--Sobic010G141700 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic008G177700--Sobic001G030800 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic008G177700--Sobic001G018700 Sobic003G358500--Sobic007G023650 Sobic002G069700 Sobic002G069700 Sobic003G358500--Sobic002G069700 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic003G358500--Sobic005G193900 Sobic009G110300 Sobic009G110300 Sobic003G358500--Sobic009G110300 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic003G358500--Sobic009G196500 Sobic010G140300 Sobic010G140300 Sobic003G358500--Sobic010G140300 Sobic008G082450 Sobic008G082450 Sobic003G358500--Sobic008G082450 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic003G358500--Sobic001G218300 Sobic001G040900 Sobic001G040900 Sobic003G358500--Sobic001G040900 Sobic007G023650--Sobic005G193900 Sobic007G023650--Sobic010G140300 Sobic007G023650--Sobic008G082450 Sobic007G023650--Sobic001G040900 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic007G023650--Sobic010G090550 Sobic007G023650--Sobic001G018700 Sobic008G043000--Sobic009G225250 Sobic008G043000--Sobic002G250700 Sobic008G043000--Sobic004G204700 Sobic008G043000--Sobic003G255000 Sobic008G043000--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic008G172900 Sobic008G043000--Sobic002G064100 Sobic008G043000--Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic002G291850 Sobic001G302000 Sobic001G302000 Sobic006G080050--Sobic001G302000 Sobic003G066200 Sobic003G066200 Sobic006G080050--Sobic003G066200 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic006G080050--Sobic010G158300 Sobic006G080050--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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