Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G134900.1
Synonym Sb02g012010
Functional annotation L1P family of ribosomal proteins domain containing protein, expressed
UniProt C5X5Y7
Pfam PF00687
Panther DB PTHR23105 PTHR23105:SF44
NCBI CDD -
KEGG Orthology K02865; RP-L10Ae, large subunit ribosomal protein L10Ae
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G22440 : Ribosomal protein L1p/L10e family
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g44450.3 : L1P family of ribosomal proteins domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ91586
Barley HORVU4Hr1G001350.9 , HORVU4Hr1G001350.8 , HORVU4Hr1G001350.1 , HORVU4Hr1G001350.3 , HORVU4Hr1G001350.2 , HORVU4Hr1G001350.5 , HORVU4Hr1G001350.7 , HORVU4Hr1G001350.6 , HORVU4Hr1G001350.15 , HORVU4Hr1G001350.11 , HORVU4Hr1G001350.10 , HORVU4Hr1G001350.13 , HORVU4Hr1G001350.12
Wheat TraesCS4B02G007300 , TraesCS4D02G007500 , TraesCS4D02G007500 , TraesCS4A02G305300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.009G041100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G134900 Sobic002G134900 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic002G134900--Sobic002G016250 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic002G134900--Sobic008G064250 Sobic004G037300 Sobic004G037300 Sobic002G134900--Sobic004G037300 Sobic003G342000 Sobic003G342000 Sobic002G134900--Sobic003G342000 Sobic010G164100 Sobic010G164100 Sobic002G134900--Sobic010G164100 Sobic007G075301 Sobic007G075301 Sobic002G134900--Sobic007G075301 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic002G134900--Sobic005G165632 Sobic002G021132 Sobic002G021132 Sobic002G134900--Sobic002G021132 Sobic005G175200 Sobic005G175200 Sobic002G134900--Sobic005G175200 Sobic002G016250--Sobic005G165632 Sobic002G016250--Sobic008G064250 Sobic002G016250--Sobic003G342000 Sobic008G113350 Sobic008G113350 Sobic002G016250--Sobic008G113350 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic002G016250--Sobic009G218100 Sobic002G016250--Sobic004G037300 Sobic003G389400 Sobic003G389400 Sobic002G016250--Sobic003G389400 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic002G016250--Sobic005G083160 Sobic003G027700 Sobic003G027700 Sobic002G016250--Sobic003G027700 Sobic008G064250--Sobic002G016250 Sobic008G064250--Sobic005G165632 Sobic008G064250--Sobic003G342000 Sobic008G064250--Sobic009G218100 Sobic008G064250--Sobic008G113350 Sobic008G064250--Sobic004G037300 Sobic008G064250--Sobic005G083160 Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic008G064250--Sobic001G233900 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic008G064250--Sobic010G107300 Sobic004G037300--Sobic003G342000 Sobic004G037300--Sobic010G164100 Sobic004G037300--Sobic007G075301 Sobic004G037300--Sobic003G389400 Sobic004G037300--Sobic008G064250 Sobic004G037300--Sobic002G016250 Sobic004G037300--Sobic001G233900 Sobic003G242200 Sobic003G242200 Sobic004G037300--Sobic003G242200 Sobic005G140300 Sobic005G140300 Sobic004G037300--Sobic005G140300 Sobic003G342000--Sobic002G016250 Sobic003G342000--Sobic003G389400 Sobic009G231500 Sobic009G231500 Sobic003G342000--Sobic009G231500 Sobic003G342000--Sobic008G064250 Sobic002G274900 Sobic002G274900 Sobic003G342000--Sobic002G274900 Sobic001G203100 Sobic001G203100 Sobic003G342000--Sobic001G203100 Sobic007G036600 Sobic007G036600 Sobic003G342000--Sobic007G036600 Sobic003G226000 Sobic003G226000 Sobic003G342000--Sobic003G226000 Sobic006G154300 Sobic006G154300 Sobic003G342000--Sobic006G154300 Sobic010G164100--Sobic007G075301 Sobic005G193260 Sobic005G193260 Sobic010G164100--Sobic005G193260 Sobic005G192700 Sobic005G192700 Sobic010G164100--Sobic005G192700 Sobic005G185600 Sobic005G185600 Sobic010G164100--Sobic005G185600 Sobic005G192900 Sobic005G192900 Sobic010G164100--Sobic005G192900 Sobic005G192901 Sobic005G192901 Sobic010G164100--Sobic005G192901 Sobic010G044600 Sobic010G044600 Sobic010G164100--Sobic010G044600 Sobic005G192801 Sobic005G192801 Sobic010G164100--Sobic005G192801 Sobic002G362400 Sobic002G362400 Sobic010G164100--Sobic002G362400 Sobic007G075301--Sobic010G164100 Sobic007G075301--Sobic005G193260 Sobic007G075301--Sobic005G185600 Sobic007G075301--Sobic005G192700 Sobic007G075301--Sobic005G192900 Sobic007G075301--Sobic005G192901 Sobic007G075301--Sobic005G192801 Sobic007G029800 Sobic007G029800 Sobic007G075301--Sobic007G029800 Sobic007G075301--Sobic010G044600 Sobic005G165632--Sobic008G113350 Sobic005G165632--Sobic002G016250 Sobic005G165632--Sobic008G064250 Sobic005G165632--Sobic009G218100 Sobic005G165632--Sobic003G342000 Sobic002G254250 Sobic002G254250 Sobic005G165632--Sobic002G254250 Sobic005G165632--Sobic003G027700 Sobic005G165632--Sobic005G083160 Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic005G165632--Sobic003G101200 Sobic006G096200 Sobic006G096200 Sobic002G021132--Sobic006G096200 Sobic002G021132--Sobic009G231500 Sobic009G041100 Sobic009G041100 Sobic002G021132--Sobic009G041100 Sobic001G166500 Sobic001G166500 Sobic002G021132--Sobic001G166500 Sobic009G169650 Sobic009G169650 Sobic002G021132--Sobic009G169650 Sobic007G075351 Sobic007G075351 Sobic002G021132--Sobic007G075351 Sobic002G021132--Sobic007G036600 Sobic002G021132--Sobic007G029800 Sobic006G132300 Sobic006G132300 Sobic002G021132--Sobic006G132300 Sobic005G169300 Sobic005G169300 Sobic005G175200--Sobic005G169300 Sobic005G110445 Sobic005G110445 Sobic005G175200--Sobic005G110445 Sobic005G175200--Sobic006G132300 Sobic008G186700 Sobic008G186700 Sobic005G175200--Sobic008G186700 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic005G175200--Sobic010G237100 Sobic001G381250 Sobic001G381250 Sobic005G175200--Sobic001G381250
Octagon: transcription factors


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