Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G147900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QBG0
Pfam PF12776
Panther DB PTHR31704 PTHR31704:SF24
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G11290 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g38960.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G200100 AP2 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G220600 - -
3 Sobic.004G292833 - -
4 Sobic.002G018250 - -
5 Sobic.002G018000 - -
6 Sobic.006G080200 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G214650 - -
8 Sobic.007G209700 - -
9 Sobic.003G159850 - -
10 Sobic.003G414000 OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G037100 expressed protein -
12 Sobic.001G297300 - -
13 Sobic.001G059800 cupin domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G059100 OsFBX239 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.010G207450 - -
16 Sobic.001G319800 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.010G069700 cytochrome P450 72A1, putative, expressed K15639: CYP734A1, PHYB activation tagged suppressor 1
18 Sobic.005G174400 - -
19 Sobic.002G234100 2-aminoethanethiol dioxygenase, putative, expressed K10712: cysteamine dioxygenase
20 Sobic.003G378700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DnaK family protein, putative, expressed K09490: HSPA5, endoplasmic reticulum chaperone BiP


Gene co-expression network
sample Sobic002G147900 Sobic002G147900 Sobic010G200100 Sobic010G200100 Sobic002G147900--Sobic010G200100 Sobic001G220600 Sobic001G220600 Sobic002G147900--Sobic001G220600 Sobic004G292833 Sobic004G292833 Sobic002G147900--Sobic004G292833 Sobic002G018250 Sobic002G018250 Sobic002G147900--Sobic002G018250 Sobic002G018000 Sobic002G018000 Sobic002G147900--Sobic002G018000 Sobic006G080200 Sobic006G080200 Sobic002G147900--Sobic006G080200 Sobic003G214650 Sobic003G214650 Sobic002G147900--Sobic003G214650 Sobic007G209700 Sobic007G209700 Sobic002G147900--Sobic007G209700 Sobic003G159850 Sobic003G159850 Sobic002G147900--Sobic003G159850 Sobic010G200100--Sobic001G220600 Sobic010G200100--Sobic004G292833 Sobic010G200100--Sobic002G018250 Sobic010G200100--Sobic002G018000 Sobic010G200100--Sobic006G080200 Sobic008G037100 Sobic008G037100 Sobic010G200100--Sobic008G037100 Sobic009G117700 Sobic009G117700 Sobic010G200100--Sobic009G117700 Sobic010G200100--Sobic007G209700 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic010G200100--Sobic001G297300 Sobic001G220600--Sobic004G292833 Sobic001G220600--Sobic010G200100 Sobic001G220600--Sobic006G080200 Sobic001G220600--Sobic008G037100 Sobic001G220600--Sobic002G018250 Sobic001G220600--Sobic009G117700 Sobic001G220600--Sobic002G018000 Sobic005G003001 Sobic005G003001 Sobic001G220600--Sobic005G003001 Sobic001G220600--Sobic003G159850 Sobic004G292833--Sobic001G220600 Sobic004G292833--Sobic010G200100 Sobic004G292833--Sobic008G037100 Sobic004G292833--Sobic002G018000 Sobic008G164101 Sobic008G164101 Sobic004G292833--Sobic008G164101 Sobic003G414000 Sobic003G414000 Sobic004G292833--Sobic003G414000 Sobic004G292833--Sobic007G209700 Sobic003G325800 Sobic003G325800 Sobic004G292833--Sobic003G325800 Sobic009G014900 Sobic009G014900 Sobic004G292833--Sobic009G014900 Sobic010G207450 Sobic010G207450 Sobic002G018250--Sobic010G207450 Sobic002G018250--Sobic010G200100 Sobic002G018250--Sobic001G220600 Sobic005G102600 Sobic005G102600 Sobic002G018250--Sobic005G102600 Sobic002G141050 Sobic002G141050 Sobic002G018250--Sobic002G141050 Sobic002G018250--Sobic006G080200 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic002G018250--Sobic002G059100 Sobic010G069700 Sobic010G069700 Sobic002G018250--Sobic010G069700 Sobic002G018250--Sobic002G018000 Sobic002G018000--Sobic004G292833 Sobic002G018000--Sobic010G200100 Sobic002G018000--Sobic001G220600 Sobic002G018000--Sobic002G018250 Sobic001G445300 Sobic001G445300 Sobic002G018000--Sobic001G445300 Sobic005G150200 Sobic005G150200 Sobic002G018000--Sobic005G150200 Sobic001G197700 Sobic001G197700 Sobic002G018000--Sobic001G197700 Sobic004G326700 Sobic004G326700 Sobic002G018000--Sobic004G326700 Sobic002G018000--Sobic008G037100 Sobic006G080200--Sobic001G220600 Sobic006G080200--Sobic005G003001 Sobic006G080200--Sobic010G069700 Sobic006G080200--Sobic009G117700 Sobic006G080200--Sobic010G200100 Sobic001G059800 Sobic001G059800 Sobic006G080200--Sobic001G059800 Sobic006G080200--Sobic004G292833 Sobic006G080200--Sobic002G018250 Sobic006G080200--Sobic003G159850 Sobic010G060100 Sobic010G060100 Sobic003G214650--Sobic010G060100 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic003G214650--Sobic007G205400 Sobic003G214650--Sobic003G414000 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic003G214650--Sobic002G192600 Sobic004G133600 Sobic004G133600 Sobic003G214650--Sobic004G133600 Sobic003G214650--Sobic009G014900 Sobic003G214650--Sobic003G159850 Sobic004G139700 Sobic004G139700 Sobic003G214650--Sobic004G139700 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic003G214650--Sobic005G186300 Sobic003G307600 Sobic003G307600 Sobic007G209700--Sobic003G307600 Sobic002G234100 Sobic002G234100 Sobic007G209700--Sobic002G234100 Sobic009G051201 Sobic009G051201 Sobic007G209700--Sobic009G051201 Sobic007G123000 Sobic007G123000 Sobic007G209700--Sobic007G123000 Sobic010G181900 Sobic010G181900 Sobic007G209700--Sobic010G181900 Sobic002G101200 Sobic002G101200 Sobic007G209700--Sobic002G101200 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic007G209700--Sobic002G217000 Sobic007G209700--Sobic001G297300 Sobic005G089101 Sobic005G089101 Sobic007G209700--Sobic005G089101 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic003G159850--Sobic009G040000 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic003G159850--Sobic001G253400 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic003G159850--Sobic001G158600 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic003G159850--Sobic010G085700 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic003G159850--Sobic004G261000 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic003G159850--Sobic002G409250 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic003G159850--Sobic005G173800 Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic003G159850--Sobic005G193700 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic003G159850--Sobic006G051750
Octagon: transcription factors


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