Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G220600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QK95
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.001G220600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G292833 - -
2 Sobic.010G200100 AP2 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G080200 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G037100 expressed protein -
5 Sobic.002G018250 - -
6 Sobic.009G117700 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
7 Sobic.002G018000 - -
8 Sobic.005G003001 - -
9 Sobic.003G159850 - -
10 Sobic.007G209700 - -
11 Sobic.001G297300 - -
12 Sobic.010G069700 cytochrome P450 72A1, putative, expressed K15639: CYP734A1, PHYB activation tagged suppressor 1
13 Sobic.003G414000 OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G059800 cupin domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G059100 OsFBX239 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.008G164101 - -
17 Sobic.010G010600 - -
18 Sobic.009G014900 expressed protein -
19 Sobic.006G082200 CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed K16075: MRS2, magnesium transporter
20 Sobic.003G214650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G220600 Sobic001G220600 Sobic004G292833 Sobic004G292833 Sobic001G220600--Sobic004G292833 Sobic010G200100 Sobic010G200100 Sobic001G220600--Sobic010G200100 Sobic006G080200 Sobic006G080200 Sobic001G220600--Sobic006G080200 Sobic008G037100 Sobic008G037100 Sobic001G220600--Sobic008G037100 Sobic002G018250 Sobic002G018250 Sobic001G220600--Sobic002G018250 Sobic009G117700 Sobic009G117700 Sobic001G220600--Sobic009G117700 Sobic002G018000 Sobic002G018000 Sobic001G220600--Sobic002G018000 Sobic005G003001 Sobic005G003001 Sobic001G220600--Sobic005G003001 Sobic003G159850 Sobic003G159850 Sobic001G220600--Sobic003G159850 Sobic004G292833--Sobic001G220600 Sobic004G292833--Sobic010G200100 Sobic004G292833--Sobic008G037100 Sobic004G292833--Sobic002G018000 Sobic008G164101 Sobic008G164101 Sobic004G292833--Sobic008G164101 Sobic003G414000 Sobic003G414000 Sobic004G292833--Sobic003G414000 Sobic007G209700 Sobic007G209700 Sobic004G292833--Sobic007G209700 Sobic003G325800 Sobic003G325800 Sobic004G292833--Sobic003G325800 Sobic009G014900 Sobic009G014900 Sobic004G292833--Sobic009G014900 Sobic010G200100--Sobic001G220600 Sobic010G200100--Sobic004G292833 Sobic010G200100--Sobic002G018250 Sobic010G200100--Sobic002G018000 Sobic010G200100--Sobic006G080200 Sobic010G200100--Sobic008G037100 Sobic010G200100--Sobic009G117700 Sobic010G200100--Sobic007G209700 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic010G200100--Sobic001G297300 Sobic006G080200--Sobic001G220600 Sobic006G080200--Sobic005G003001 Sobic010G069700 Sobic010G069700 Sobic006G080200--Sobic010G069700 Sobic006G080200--Sobic009G117700 Sobic006G080200--Sobic010G200100 Sobic001G059800 Sobic001G059800 Sobic006G080200--Sobic001G059800 Sobic006G080200--Sobic004G292833 Sobic006G080200--Sobic002G018250 Sobic006G080200--Sobic003G159850 Sobic008G037100--Sobic008G164101 Sobic008G037100--Sobic004G292833 Sobic008G037100--Sobic003G414000 Sobic008G037100--Sobic001G220600 Sobic008G037100--Sobic003G159850 Sobic002G302200 Sobic002G302200 Sobic008G037100--Sobic002G302200 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic008G037100--Sobic008G184100 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic008G037100--Sobic003G091500 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic008G037100--Sobic005G174500 Sobic010G207450 Sobic010G207450 Sobic002G018250--Sobic010G207450 Sobic002G018250--Sobic010G200100 Sobic002G018250--Sobic001G220600 Sobic005G102600 Sobic005G102600 Sobic002G018250--Sobic005G102600 Sobic002G141050 Sobic002G141050 Sobic002G018250--Sobic002G141050 Sobic002G018250--Sobic006G080200 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic002G018250--Sobic002G059100 Sobic002G018250--Sobic010G069700 Sobic002G018250--Sobic002G018000 Sobic009G117700--Sobic001G220600 Sobic009G117700--Sobic008G037100 Sobic009G117700--Sobic006G080200 Sobic001G301100 Sobic001G301100 Sobic009G117700--Sobic001G301100 Sobic009G117700--Sobic004G292833 Sobic009G117700--Sobic005G003001 Sobic009G117700--Sobic010G200100 Sobic004G274500 Sobic004G274500 Sobic009G117700--Sobic004G274500 Sobic009G117700--Sobic008G164101 Sobic002G018000--Sobic004G292833 Sobic002G018000--Sobic010G200100 Sobic002G018000--Sobic001G220600 Sobic002G018000--Sobic002G018250 Sobic001G445300 Sobic001G445300 Sobic002G018000--Sobic001G445300 Sobic005G150200 Sobic005G150200 Sobic002G018000--Sobic005G150200 Sobic001G197700 Sobic001G197700 Sobic002G018000--Sobic001G197700 Sobic004G326700 Sobic004G326700 Sobic002G018000--Sobic004G326700 Sobic002G018000--Sobic008G037100 Sobic007G108000 Sobic007G108000 Sobic005G003001--Sobic007G108000 Sobic008G154400 Sobic008G154400 Sobic005G003001--Sobic008G154400 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic005G003001--Sobic003G024700 SobicK043500 SobicK043500 Sobic005G003001--SobicK043500 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic005G003001--Sobic010G219300 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic005G003001--Sobic010G148600 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic005G003001--Sobic001G249233 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic005G003001--Sobic005G174900 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic005G003001--Sobic005G140400 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic003G159850--Sobic009G040000 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic003G159850--Sobic001G253400 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic003G159850--Sobic001G158600 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic003G159850--Sobic010G085700 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic003G159850--Sobic004G261000 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic003G159850--Sobic002G409250 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic003G159850--Sobic005G173800 Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic003G159850--Sobic005G193700 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic003G159850--Sobic006G051750
Octagon: transcription factors


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