Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G117700.2
Synonym Sb09g018540, SCL-3, SCL3
Functional annotation GRAS family transcription factor containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R283
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636:SF13 PTHR31636
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0000989; obsolete transcription factor activity, transcription factor binding GO:0005634nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G50420 : scarecrow-like 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g31380.1 : GRAS family transcription factor containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G043310.1
Wheat TraesCS5D02G139500 , TraesCS5A02G135000 , TraesCS5B02G133800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic009G117700 Sobic009G117700 Sobic001G220600 Sobic001G220600 Sobic009G117700--Sobic001G220600 Sobic008G037100 Sobic008G037100 Sobic009G117700--Sobic008G037100 Sobic006G080200 Sobic006G080200 Sobic009G117700--Sobic006G080200 Sobic001G301100 Sobic001G301100 Sobic009G117700--Sobic001G301100 Sobic004G292833 Sobic004G292833 Sobic009G117700--Sobic004G292833 Sobic005G003001 Sobic005G003001 Sobic009G117700--Sobic005G003001 Sobic010G200100 Sobic010G200100 Sobic009G117700--Sobic010G200100 Sobic004G274500 Sobic004G274500 Sobic009G117700--Sobic004G274500 Sobic008G164101 Sobic008G164101 Sobic009G117700--Sobic008G164101 Sobic001G220600--Sobic004G292833 Sobic001G220600--Sobic010G200100 Sobic001G220600--Sobic006G080200 Sobic001G220600--Sobic008G037100 Sobic002G018250 Sobic002G018250 Sobic001G220600--Sobic002G018250 Sobic001G220600--Sobic009G117700 Sobic002G018000 Sobic002G018000 Sobic001G220600--Sobic002G018000 Sobic001G220600--Sobic005G003001 Sobic003G159850 Sobic003G159850 Sobic001G220600--Sobic003G159850 Sobic008G037100--Sobic008G164101 Sobic008G037100--Sobic004G292833 Sobic003G414000 Sobic003G414000 Sobic008G037100--Sobic003G414000 Sobic008G037100--Sobic001G220600 Sobic008G037100--Sobic003G159850 Sobic002G302200 Sobic002G302200 Sobic008G037100--Sobic002G302200 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic008G037100--Sobic008G184100 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic008G037100--Sobic003G091500 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic008G037100--Sobic005G174500 Sobic006G080200--Sobic001G220600 Sobic006G080200--Sobic005G003001 Sobic010G069700 Sobic010G069700 Sobic006G080200--Sobic010G069700 Sobic006G080200--Sobic009G117700 Sobic006G080200--Sobic010G200100 Sobic001G059800 Sobic001G059800 Sobic006G080200--Sobic001G059800 Sobic006G080200--Sobic004G292833 Sobic006G080200--Sobic002G018250 Sobic006G080200--Sobic003G159850 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic001G301100--Sobic009G006800 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic001G301100--Sobic003G415800 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic001G301100--Sobic009G039700 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic001G301100--Sobic005G109800 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic001G301100--Sobic005G174600 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic001G301100--Sobic005G109900 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic001G301100--Sobic010G137700 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic001G301100--Sobic005G141500 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic001G301100--Sobic001G270600 Sobic004G292833--Sobic001G220600 Sobic004G292833--Sobic010G200100 Sobic004G292833--Sobic008G037100 Sobic004G292833--Sobic002G018000 Sobic004G292833--Sobic008G164101 Sobic004G292833--Sobic003G414000 Sobic007G209700 Sobic007G209700 Sobic004G292833--Sobic007G209700 Sobic003G325800 Sobic003G325800 Sobic004G292833--Sobic003G325800 Sobic009G014900 Sobic009G014900 Sobic004G292833--Sobic009G014900 Sobic007G108000 Sobic007G108000 Sobic005G003001--Sobic007G108000 Sobic008G154400 Sobic008G154400 Sobic005G003001--Sobic008G154400 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic005G003001--Sobic003G024700 SobicK043500 SobicK043500 Sobic005G003001--SobicK043500 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic005G003001--Sobic010G219300 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic005G003001--Sobic010G148600 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic005G003001--Sobic001G249233 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic005G003001--Sobic005G174900 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic005G003001--Sobic005G140400 Sobic010G200100--Sobic001G220600 Sobic010G200100--Sobic004G292833 Sobic010G200100--Sobic002G018250 Sobic010G200100--Sobic002G018000 Sobic010G200100--Sobic006G080200 Sobic010G200100--Sobic008G037100 Sobic010G200100--Sobic009G117700 Sobic010G200100--Sobic007G209700 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic010G200100--Sobic001G297300 Sobic010G037200 Sobic010G037200 Sobic004G274500--Sobic010G037200 Sobic009G025100 Sobic009G025100 Sobic004G274500--Sobic009G025100 Sobic001G394900 Sobic001G394900 Sobic004G274500--Sobic001G394900 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic004G274500--Sobic003G402100 Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic004G274500--Sobic001G170500 Sobic003G304500 Sobic003G304500 Sobic004G274500--Sobic003G304500 Sobic008G039700 Sobic008G039700 Sobic004G274500--Sobic008G039700 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic004G274500--Sobic003G303500 Sobic004G274500--Sobic008G037100 Sobic008G164101--Sobic002G302200 Sobic003G211600 Sobic003G211600 Sobic008G164101--Sobic003G211600 Sobic007G066200 Sobic007G066200 Sobic008G164101--Sobic007G066200 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic008G164101--Sobic005G226800 Sobic005G033600 Sobic005G033600 Sobic008G164101--Sobic005G033600 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic008G164101--Sobic005G173900 Sobic001G374600 Sobic001G374600 Sobic008G164101--Sobic001G374600 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic008G164101--Sobic005G174200 Sobic005G198400 Sobic005G198400 Sobic008G164101--Sobic005G198400
Octagon: transcription factors


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