Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G055300.2
Synonym MYB118, PGA37, ATMYB118, Sb07g004460
Functional annotation MYB family transcription factor, putative, expressed
UniProt C5YHH6
Pfam PF00249
Panther DB PTHR10641 PTHR10641:SF528
NCBI CDD KOG0048; Transcription factor, Myb superfamily
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G18770 : myb domain protein 98
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g12130.1 : MYB family transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055051
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G321500 Homeobox domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G415800 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
3 Sobic.007G040000 - -
4 Sobic.009G090250 - -
5 Sobic.001G270600 - -
6 Sobic.002G302200 expressed protein -
7 Sobic.005G173900 - -
8 Sobic.005G174500 - -
9 Sobic.003G207100 expressed protein -
10 Sobic.001G246400 MBTB43 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
11 Sobic.003G207600 OsFBD5 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G058800 - -
13 Sobic.006G117300 Os4bglu12 - beta-glucosidase, exo-beta-glucanase, expressed K01188: beta-glucosidase
14 Sobic.001G445300 - -
15 Sobic.006G070830 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase
16 Sobic.005G198400 FHA domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G184100 aspartic proteinase, putative, expressed -
18 Sobic.003G091500 expressed protein -
19 Sobic.002G267700 bZIP family transcription factor, putative, expressed -
20 Sobic.009G006800 eukaryotic initiation factor iso-4F subunit p82-34, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G055300 Sobic007G055300 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic007G055300--Sobic003G321500 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic007G055300--Sobic003G415800 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic007G055300--Sobic007G040000 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic007G055300--Sobic009G090250 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic007G055300--Sobic001G270600 Sobic002G302200 Sobic002G302200 Sobic007G055300--Sobic002G302200 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic007G055300--Sobic005G173900 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic007G055300--Sobic005G174500 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic007G055300--Sobic003G207100 Sobic003G321500--Sobic009G090250 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic003G321500--Sobic006G117300 Sobic003G321500--Sobic007G040000 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic003G321500--Sobic001G246400 Sobic003G321500--Sobic001G270600 Sobic003G321500--Sobic005G174500 Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic003G321500--Sobic003G207600 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic003G321500--Sobic006G064700 Sobic003G321500--Sobic005G173900 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic003G415800--Sobic009G006800 Sobic003G415800--Sobic001G270600 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic003G415800--Sobic005G109800 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic003G415800--Sobic005G174600 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic003G415800--Sobic010G137700 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic003G415800--Sobic005G109900 Sobic001G301100 Sobic001G301100 Sobic003G415800--Sobic001G301100 Sobic003G415800--Sobic003G321500 Sobic003G415800--Sobic007G040000 Sobic007G040000--Sobic009G090250 Sobic007G040000--Sobic006G117300 Sobic007G040000--Sobic005G174500 Sobic007G040000--Sobic005G173900 Sobic007G040000--Sobic003G321500 Sobic007G040000--Sobic001G246400 Sobic007G040000--Sobic001G270600 Sobic006G070830 Sobic006G070830 Sobic007G040000--Sobic006G070830 Sobic002G267700 Sobic002G267700 Sobic007G040000--Sobic002G267700 Sobic009G090250--Sobic001G246400 Sobic009G090250--Sobic005G174500 Sobic009G090250--Sobic007G040000 Sobic009G090250--Sobic003G321500 Sobic009G090250--Sobic001G270600 Sobic009G090250--Sobic006G117300 Sobic009G090250--Sobic005G173900 Sobic009G090250--Sobic003G207600 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic009G090250--Sobic002G007700 Sobic001G270600--Sobic009G090250 Sobic001G270600--Sobic007G040000 Sobic001G270600--Sobic003G321500 Sobic001G270600--Sobic003G415800 Sobic001G270600--Sobic001G246400 Sobic001G270600--Sobic005G173900 Sobic001G270600--Sobic006G117300 Sobic001G270600--Sobic005G174500 Sobic001G270600--Sobic009G006800 Sobic005G198400 Sobic005G198400 Sobic002G302200--Sobic005G198400 Sobic002G302200--Sobic005G173900 Sobic002G302200--Sobic007G040000 Sobic002G302200--Sobic005G174500 Sobic002G302200--Sobic009G090250 Sobic002G302200--Sobic001G270600 Sobic008G164101 Sobic008G164101 Sobic002G302200--Sobic008G164101 Sobic002G302200--Sobic001G246400 Sobic002G302200--Sobic003G321500 Sobic005G173900--Sobic007G040000 Sobic005G173900--Sobic005G174500 Sobic005G173900--Sobic009G090250 Sobic005G173900--Sobic001G246400 Sobic003G211600 Sobic003G211600 Sobic005G173900--Sobic003G211600 Sobic001G374600 Sobic001G374600 Sobic005G173900--Sobic001G374600 Sobic005G173900--Sobic002G302200 Sobic005G173900--Sobic001G270600 Sobic005G173900--Sobic006G070830 Sobic005G174500--Sobic009G090250 Sobic005G174500--Sobic001G246400 Sobic005G174500--Sobic007G040000 Sobic005G174500--Sobic005G173900 Sobic005G174500--Sobic002G007700 Sobic005G174500--Sobic006G117300 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic005G174500--Sobic003G091500 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic005G174500--Sobic002G089500 Sobic005G174500--Sobic003G207100 Sobic003G207100--Sobic002G007700 Sobic003G207100--Sobic003G091500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic003G207100--Sobic008G184100 Sobic003G207100--Sobic002G089500 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic003G207100--Sobic001G233600 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic003G207100--Sobic004G171600 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic003G207100--Sobic005G077900 Sobic003G207100--Sobic005G174500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic003G207100--Sobic008G088900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.