Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G058800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YN02
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G445300 - -
2 Sobic.003G207100 expressed protein -
3 Sobic.007G055300 MYB family transcription factor, putative, expressed -
4 Sobic.005G173800 DEFL12 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
5 Sobic.005G176800 expressed protein -
6 Sobic.008G043800 expressed protein -
7 Sobic.003G207600 OsFBD5 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G204350 - -
9 Sobic.003G321500 Homeobox domain containing protein, expressed -
10 Sobic.010G058000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
11 Sobic.009G040000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
12 Sobic.002G007700 nodulin family protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G089500 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
14 Sobic.006G104800 dnaJ domain containing protein, expressed -
15 Sobic.008G184100 aspartic proteinase, putative, expressed -
16 Sobic.001G233600 expressed protein -
17 Sobic.003G091500 expressed protein -
18 Sobic.002G381600 uncharacterized glycosyl hydrolase Rv2006/MT2062, putative, expressed K01087: trehalose 6-phosphate phosphatase
19 Sobic.005G021100 - -
20 Sobic.010G085700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G058800 Sobic004G058800 Sobic001G445300 Sobic001G445300 Sobic004G058800--Sobic001G445300 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic004G058800--Sobic003G207100 Sobic007G055300 Sobic007G055300 Sobic004G058800--Sobic007G055300 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic004G058800--Sobic005G173800 Sobic005G176800 Sobic005G176800 Sobic004G058800--Sobic005G176800 Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic004G058800--Sobic008G043800 Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic004G058800--Sobic003G207600 Sobic007G204350 Sobic007G204350 Sobic004G058800--Sobic007G204350 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic004G058800--Sobic003G321500 Sobic001G445300--Sobic004G058800 Sobic001G445300--Sobic007G055300 Sobic001G445300--Sobic003G207100 Sobic001G445300--Sobic008G043800 Sobic001G445300--Sobic005G176800 Sobic001G445300--Sobic003G321500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic001G445300--Sobic008G184100 Sobic003G325800 Sobic003G325800 Sobic001G445300--Sobic003G325800 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic001G445300--Sobic003G091500 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic003G207100--Sobic002G007700 Sobic003G207100--Sobic003G091500 Sobic003G207100--Sobic008G184100 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic003G207100--Sobic002G089500 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic003G207100--Sobic001G233600 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic003G207100--Sobic004G171600 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic003G207100--Sobic005G077900 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic003G207100--Sobic005G174500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic003G207100--Sobic008G088900 Sobic007G055300--Sobic003G321500 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic007G055300--Sobic003G415800 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic007G055300--Sobic007G040000 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic007G055300--Sobic009G090250 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic007G055300--Sobic001G270600 Sobic002G302200 Sobic002G302200 Sobic007G055300--Sobic002G302200 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic007G055300--Sobic005G173900 Sobic007G055300--Sobic005G174500 Sobic007G055300--Sobic003G207100 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic005G173800--Sobic010G085700 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic005G173800--Sobic009G040000 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic005G173800--Sobic001G253400 Sobic005G173800--Sobic003G207600 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic005G173800--Sobic006G051750 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic005G173800--Sobic001G158600 Sobic006G104800 Sobic006G104800 Sobic005G173800--Sobic006G104800 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic005G173800--Sobic001G068200 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic005G173800--Sobic004G261000 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic005G176800--Sobic002G409300 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic005G176800--Sobic005G186300 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic005G176800--Sobic001G200900 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic005G176800--Sobic001G489075 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic005G176800--Sobic009G061900 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic005G176800--Sobic005G174000 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic005G176800--Sobic001G274025 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic005G176800--Sobic007G187100 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic005G176800--Sobic007G205400 Sobic008G043800--Sobic004G058800 Sobic008G043800--Sobic001G445300 Sobic008G043800--Sobic007G055300 Sobic010G058000 Sobic010G058000 Sobic008G043800--Sobic010G058000 Sobic008G043800--Sobic003G207100 Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic008G043800--Sobic004G196600 Sobic008G043800--Sobic003G207600 Sobic008G043800--Sobic003G321500 Sobic002G028000 Sobic002G028000 Sobic008G043800--Sobic002G028000 Sobic003G207600--Sobic005G173800 Sobic003G207600--Sobic003G321500 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic003G207600--Sobic001G246400 Sobic003G207600--Sobic010G085700 Sobic003G207600--Sobic009G090250 Sobic003G207600--Sobic003G207100 Sobic003G207600--Sobic009G040000 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic003G207600--Sobic008G081000 Sobic003G207600--Sobic005G174500 Sobic007G204350--Sobic005G176800 Sobic006G015750 Sobic006G015750 Sobic007G204350--Sobic006G015750 Sobic003G091400 Sobic003G091400 Sobic007G204350--Sobic003G091400 Sobic002G078800 Sobic002G078800 Sobic007G204350--Sobic002G078800 Sobic007G204350--Sobic005G186300 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic007G204350--Sobic002G409250 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic007G204350--Sobic002G192600 Sobic004G139700 Sobic004G139700 Sobic007G204350--Sobic004G139700 Sobic007G204350--Sobic007G205400 Sobic003G321500--Sobic009G090250 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic003G321500--Sobic006G117300 Sobic003G321500--Sobic007G040000 Sobic003G321500--Sobic001G246400 Sobic003G321500--Sobic001G270600 Sobic003G321500--Sobic005G174500 Sobic003G321500--Sobic003G207600 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic003G321500--Sobic006G064700 Sobic003G321500--Sobic005G173900
Octagon: transcription factors


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