Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G043800.1
Synonym Sb08g003750
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YS74
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g06290.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053956
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G058800 - -
2 Sobic.001G445300 - -
3 Sobic.007G055300 MYB family transcription factor, putative, expressed -
4 Sobic.010G058000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
5 Sobic.003G207100 expressed protein -
6 Sobic.004G196600 expressed protein -
7 Sobic.003G207600 OsFBD5 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.003G321500 Homeobox domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G028000 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.005G173800 DEFL12 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
11 Sobic.005G176800 expressed protein -
12 Sobic.007G204350 - -
13 Sobic.001G069100 - -
14 Sobic.002G097601 - -
15 Sobic.001G185100 expressed protein -
16 Sobic.003G415800 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.004G135600 - -
18 Sobic.009G244800 cell division control protein 2 homolog 3, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
19 Sobic.001G261700 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G246400 MBTB43 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic004G058800 Sobic004G058800 Sobic008G043800--Sobic004G058800 Sobic001G445300 Sobic001G445300 Sobic008G043800--Sobic001G445300 Sobic007G055300 Sobic007G055300 Sobic008G043800--Sobic007G055300 Sobic010G058000 Sobic010G058000 Sobic008G043800--Sobic010G058000 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic008G043800--Sobic003G207100 Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic008G043800--Sobic004G196600 Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic008G043800--Sobic003G207600 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic008G043800--Sobic003G321500 Sobic002G028000 Sobic002G028000 Sobic008G043800--Sobic002G028000 Sobic004G058800--Sobic001G445300 Sobic004G058800--Sobic003G207100 Sobic004G058800--Sobic007G055300 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic004G058800--Sobic005G173800 Sobic005G176800 Sobic005G176800 Sobic004G058800--Sobic005G176800 Sobic004G058800--Sobic008G043800 Sobic004G058800--Sobic003G207600 Sobic007G204350 Sobic007G204350 Sobic004G058800--Sobic007G204350 Sobic004G058800--Sobic003G321500 Sobic001G445300--Sobic004G058800 Sobic001G445300--Sobic007G055300 Sobic001G445300--Sobic003G207100 Sobic001G445300--Sobic008G043800 Sobic001G445300--Sobic005G176800 Sobic001G445300--Sobic003G321500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic001G445300--Sobic008G184100 Sobic003G325800 Sobic003G325800 Sobic001G445300--Sobic003G325800 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic001G445300--Sobic003G091500 Sobic007G055300--Sobic003G321500 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic007G055300--Sobic003G415800 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic007G055300--Sobic007G040000 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic007G055300--Sobic009G090250 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic007G055300--Sobic001G270600 Sobic002G302200 Sobic002G302200 Sobic007G055300--Sobic002G302200 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic007G055300--Sobic005G173900 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic007G055300--Sobic005G174500 Sobic007G055300--Sobic003G207100 Sobic010G209300 Sobic010G209300 Sobic010G058000--Sobic010G209300 Sobic006G271400 Sobic006G271400 Sobic010G058000--Sobic006G271400 Sobic006G031000 Sobic006G031000 Sobic010G058000--Sobic006G031000 Sobic002G408700 Sobic002G408700 Sobic010G058000--Sobic002G408700 Sobic001G142600 Sobic001G142600 Sobic010G058000--Sobic001G142600 Sobic005G090500 Sobic005G090500 Sobic010G058000--Sobic005G090500 Sobic003G291100 Sobic003G291100 Sobic010G058000--Sobic003G291100 Sobic002G053100 Sobic002G053100 Sobic010G058000--Sobic002G053100 Sobic002G166800 Sobic002G166800 Sobic010G058000--Sobic002G166800 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic003G207100--Sobic002G007700 Sobic003G207100--Sobic003G091500 Sobic003G207100--Sobic008G184100 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic003G207100--Sobic002G089500 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic003G207100--Sobic001G233600 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic003G207100--Sobic004G171600 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic003G207100--Sobic005G077900 Sobic003G207100--Sobic005G174500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic003G207100--Sobic008G088900 Sobic005G116250 Sobic005G116250 Sobic004G196600--Sobic005G116250 Sobic004G196600--Sobic002G028000 Sobic001G185100 Sobic001G185100 Sobic004G196600--Sobic001G185100 Sobic005G088600 Sobic005G088600 Sobic004G196600--Sobic005G088600 Sobic004G196600--Sobic008G043800 Sobic001G396050 Sobic001G396050 Sobic004G196600--Sobic001G396050 Sobic002G170740 Sobic002G170740 Sobic004G196600--Sobic002G170740 Sobic004G196600--Sobic004G058800 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic004G196600--Sobic010G133100 Sobic003G207600--Sobic005G173800 Sobic003G207600--Sobic003G321500 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic003G207600--Sobic001G246400 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic003G207600--Sobic010G085700 Sobic003G207600--Sobic009G090250 Sobic003G207600--Sobic003G207100 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic003G207600--Sobic009G040000 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic003G207600--Sobic008G081000 Sobic003G207600--Sobic005G174500 Sobic003G321500--Sobic009G090250 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic003G321500--Sobic006G117300 Sobic003G321500--Sobic007G040000 Sobic003G321500--Sobic001G246400 Sobic003G321500--Sobic001G270600 Sobic003G321500--Sobic005G174500 Sobic003G321500--Sobic003G207600 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic003G321500--Sobic006G064700 Sobic003G321500--Sobic005G173900 Sobic002G028000--Sobic004G196600 Sobic002G028000--Sobic005G116250 Sobic008G181050 Sobic008G181050 Sobic002G028000--Sobic008G181050 Sobic002G028000--Sobic001G185100 Sobic002G028000--Sobic002G170740 Sobic002G028000--Sobic008G043800 Sobic005G215100 Sobic005G215100 Sobic002G028000--Sobic005G215100 Sobic002G028000--Sobic010G133100 Sobic002G028000--Sobic001G396050
Octagon: transcription factors


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