Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G196600.1
Synonym Sb04g024350
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XWD4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g38980.1 : bromodomain domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021367
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G196600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G116250 - -
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10 Sobic.009G041200 expressed protein -
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16 Sobic.007G108000 - -
17 Sobic.007G084800 expressed protein -
18 Sobic.003G189466 - -
19 Sobic.003G331800 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G002350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic005G116250 Sobic005G116250 Sobic004G196600--Sobic005G116250 Sobic002G028000 Sobic002G028000 Sobic004G196600--Sobic002G028000 Sobic001G185100 Sobic001G185100 Sobic004G196600--Sobic001G185100 Sobic005G088600 Sobic005G088600 Sobic004G196600--Sobic005G088600 Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic004G196600--Sobic008G043800 Sobic001G396050 Sobic001G396050 Sobic004G196600--Sobic001G396050 Sobic002G170740 Sobic002G170740 Sobic004G196600--Sobic002G170740 Sobic004G058800 Sobic004G058800 Sobic004G196600--Sobic004G058800 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic004G196600--Sobic010G133100 Sobic005G116250--Sobic004G196600 Sobic005G116250--Sobic005G088600 Sobic005G116250--Sobic002G028000 Sobic005G116250--Sobic001G185100 Sobic005G116250--Sobic001G396050 Sobic009G041200 Sobic009G041200 Sobic005G116250--Sobic009G041200 Sobic008G181050 Sobic008G181050 Sobic005G116250--Sobic008G181050 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic005G116250--Sobic003G255000 Sobic005G116250--Sobic002G170740 Sobic002G028000--Sobic004G196600 Sobic002G028000--Sobic005G116250 Sobic002G028000--Sobic008G181050 Sobic002G028000--Sobic001G185100 Sobic002G028000--Sobic002G170740 Sobic002G028000--Sobic008G043800 Sobic005G215100 Sobic005G215100 Sobic002G028000--Sobic005G215100 Sobic002G028000--Sobic010G133100 Sobic002G028000--Sobic001G396050 Sobic001G185100--Sobic004G196600 Sobic001G185100--Sobic005G116250 Sobic001G185100--Sobic002G028000 Sobic001G185100--Sobic001G396050 Sobic001G185100--Sobic008G043800 Sobic001G185100--Sobic005G088600 Sobic001G185100--Sobic010G133100 Sobic003G029350 Sobic003G029350 Sobic001G185100--Sobic003G029350 Sobic001G185100--Sobic003G255000 Sobic005G088600--Sobic005G116250 Sobic005G088600--Sobic009G041200 Sobic005G088600--Sobic004G196600 Sobic001G413850 Sobic001G413850 Sobic005G088600--Sobic001G413850 Sobic005G088600--Sobic001G396050 Sobic007G084800 Sobic007G084800 Sobic005G088600--Sobic007G084800 Sobic005G088600--Sobic002G028000 Sobic008G161601 Sobic008G161601 Sobic005G088600--Sobic008G161601 Sobic005G088600--Sobic008G181050 Sobic008G043800--Sobic004G058800 Sobic001G445300 Sobic001G445300 Sobic008G043800--Sobic001G445300 Sobic007G055300 Sobic007G055300 Sobic008G043800--Sobic007G055300 Sobic010G058000 Sobic010G058000 Sobic008G043800--Sobic010G058000 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic008G043800--Sobic003G207100 Sobic008G043800--Sobic004G196600 Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic008G043800--Sobic003G207600 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic008G043800--Sobic003G321500 Sobic008G043800--Sobic002G028000 Sobic001G396050--Sobic005G116250 Sobic001G396050--Sobic004G196600 Sobic001G396050--Sobic001G185100 Sobic001G396050--Sobic005G088600 Sobic001G396050--Sobic002G028000 Sobic001G396050--Sobic003G255000 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic001G396050--Sobic005G002350 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic001G396050--Sobic002G392550 Sobic001G396050--Sobic010G133100 Sobic002G170740--Sobic008G181050 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic002G170740--Sobic005G083160 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic002G170740--Sobic008G088881 Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic002G170740--Sobic001G233900 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic002G170740--Sobic010G107300 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic002G170740--Sobic005G226150 Sobic002G360900 Sobic002G360900 Sobic002G170740--Sobic002G360900 Sobic007G108000 Sobic007G108000 Sobic002G170740--Sobic007G108000 Sobic010G022600 Sobic010G022600 Sobic002G170740--Sobic010G022600 Sobic004G058800--Sobic001G445300 Sobic004G058800--Sobic003G207100 Sobic004G058800--Sobic007G055300 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic004G058800--Sobic005G173800 Sobic005G176800 Sobic005G176800 Sobic004G058800--Sobic005G176800 Sobic004G058800--Sobic008G043800 Sobic004G058800--Sobic003G207600 Sobic007G204350 Sobic007G204350 Sobic004G058800--Sobic007G204350 Sobic004G058800--Sobic003G321500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic010G133100--Sobic003G063801 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic010G133100--Sobic002G064100 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic010G133100--Sobic008G043000 Sobic004G135600 Sobic004G135600 Sobic010G133100--Sobic004G135600 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic010G133100--Sobic009G225250 Sobic010G133100--Sobic004G196600 Sobic010G133100--Sobic003G255000 Sobic010G133100--Sobic002G392550 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic010G133100--Sobic002G250700
Octagon: transcription factors


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