Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G088600.1,Sobic.005G088600.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PR35
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G116250 - -
2 Sobic.009G041200 expressed protein -
3 Sobic.004G196600 expressed protein -
4 Sobic.001G413850 - -
5 Sobic.001G396050 - -
6 Sobic.007G084800 expressed protein -
7 Sobic.002G028000 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
8 Sobic.008G161601 - -
9 Sobic.008G181050 - -
10 Sobic.001G185100 expressed protein -
11 Sobic.002G170740 - -
12 Sobic.003G331800 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G087100 DNA-binding storekeeper protein-related, putative, expressed -
14 Sobic.008G186700 - -
15 Sobic.002G029200 - -
16 Sobic.007G172800 ZOS8-13 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.010G044600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
18 Sobic.006G059900 "ZmIPT2(Ortholog in maize:Weng et al., 2013)"(PubMedID : 31659896)@IPP transferase, putative, expressed K10760: adenylate dimethylallyltransferase (cytokinin synthase)
19 Sobic.001G381250 - -
20 Sobic.001G381250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G088600 Sobic005G088600 Sobic005G116250 Sobic005G116250 Sobic005G088600--Sobic005G116250 Sobic009G041200 Sobic009G041200 Sobic005G088600--Sobic009G041200 Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic005G088600--Sobic004G196600 Sobic001G413850 Sobic001G413850 Sobic005G088600--Sobic001G413850 Sobic001G396050 Sobic001G396050 Sobic005G088600--Sobic001G396050 Sobic007G084800 Sobic007G084800 Sobic005G088600--Sobic007G084800 Sobic002G028000 Sobic002G028000 Sobic005G088600--Sobic002G028000 Sobic008G161601 Sobic008G161601 Sobic005G088600--Sobic008G161601 Sobic008G181050 Sobic008G181050 Sobic005G088600--Sobic008G181050 Sobic005G116250--Sobic004G196600 Sobic005G116250--Sobic005G088600 Sobic005G116250--Sobic002G028000 Sobic001G185100 Sobic001G185100 Sobic005G116250--Sobic001G185100 Sobic005G116250--Sobic001G396050 Sobic005G116250--Sobic009G041200 Sobic005G116250--Sobic008G181050 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic005G116250--Sobic003G255000 Sobic002G170740 Sobic002G170740 Sobic005G116250--Sobic002G170740 Sobic009G041200--Sobic007G084800 Sobic009G041200--Sobic001G413850 Sobic009G041200--Sobic005G088600 Sobic009G041100 Sobic009G041100 Sobic009G041200--Sobic009G041100 Sobic008G186700 Sobic008G186700 Sobic009G041200--Sobic008G186700 Sobic005G087666 Sobic005G087666 Sobic009G041200--Sobic005G087666 Sobic009G041200--Sobic008G161601 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic009G041200--Sobic010G237100 Sobic002G370300 Sobic002G370300 Sobic009G041200--Sobic002G370300 Sobic004G196600--Sobic005G116250 Sobic004G196600--Sobic002G028000 Sobic004G196600--Sobic001G185100 Sobic004G196600--Sobic005G088600 Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic004G196600--Sobic008G043800 Sobic004G196600--Sobic001G396050 Sobic004G196600--Sobic002G170740 Sobic004G058800 Sobic004G058800 Sobic004G196600--Sobic004G058800 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic004G196600--Sobic010G133100 Sobic001G413850--Sobic008G186700 Sobic005G110000 Sobic005G110000 Sobic001G413850--Sobic005G110000 Sobic002G362400 Sobic002G362400 Sobic001G413850--Sobic002G362400 Sobic001G413850--Sobic005G087666 Sobic001G413850--Sobic007G084800 Sobic001G381250 Sobic001G381250 Sobic001G413850--Sobic001G381250 Sobic001G396050--Sobic005G116250 Sobic001G396050--Sobic004G196600 Sobic001G396050--Sobic001G185100 Sobic001G396050--Sobic005G088600 Sobic001G396050--Sobic002G028000 Sobic001G396050--Sobic003G255000 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic001G396050--Sobic005G002350 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic001G396050--Sobic002G392550 Sobic001G396050--Sobic010G133100 Sobic007G084800--Sobic001G413850 Sobic007G084800--Sobic005G087666 Sobic009G009900 Sobic009G009900 Sobic007G084800--Sobic009G009900 Sobic007G084800--Sobic002G362400 Sobic010G044600 Sobic010G044600 Sobic007G084800--Sobic010G044600 Sobic007G084800--Sobic002G370300 Sobic003G226000 Sobic003G226000 Sobic007G084800--Sobic003G226000 Sobic007G084800--Sobic005G110000 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic007G084800--Sobic009G010000 Sobic002G028000--Sobic004G196600 Sobic002G028000--Sobic005G116250 Sobic002G028000--Sobic008G181050 Sobic002G028000--Sobic001G185100 Sobic002G028000--Sobic002G170740 Sobic002G028000--Sobic008G043800 Sobic005G215100 Sobic005G215100 Sobic002G028000--Sobic005G215100 Sobic002G028000--Sobic010G133100 Sobic002G028000--Sobic001G396050 Sobic006G132300 Sobic006G132300 Sobic008G161601--Sobic006G132300 Sobic008G161601--Sobic001G413850 Sobic008G161601--Sobic008G186700 Sobic008G161601--Sobic001G381250 Sobic008G181050--Sobic002G170740 Sobic008G181050--Sobic002G028000 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic008G181050--Sobic008G064250 Sobic008G181050--Sobic005G116250 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic008G181050--Sobic002G016250 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic008G181050--Sobic005G165632 Sobic008G181050--Sobic005G215100 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic008G181050--Sobic009G218100 Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic008G181050--Sobic003G101200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.