Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G331800.1
Synonym
Functional annotation harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0W023
Pfam -
Panther DB PTHR31415 PTHR31415:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g14740.1 : harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G116250 - -
2 Sobic.005G088600 - -
3 Sobic.004G196600 expressed protein -
4 Sobic.002G028000 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
5 Sobic.003G255000 no apical meristem protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G396050 - -
7 Sobic.009G041200 expressed protein -
8 Sobic.001G185100 expressed protein -
9 Sobic.005G002350 - -
10 Sobic.005G175200 TKL_IRAK_DUF26-lc.25 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
11 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
12 Sobic.008G181050 - -
13 Sobic.001G413850 - -
14 Sobic.009G225250 - -
15 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G161601 - -
17 Sobic.002G170740 - -
18 Sobic.007G084800 expressed protein -
19 Sobic.005G181900 MBTB37 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.010G133100 expressed protein K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4


Gene co-expression network
sample Sobic003G331800 Sobic003G331800 Sobic005G116250 Sobic005G116250 Sobic003G331800--Sobic005G116250 Sobic005G088600 Sobic005G088600 Sobic003G331800--Sobic005G088600 Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic003G331800--Sobic004G196600 Sobic002G028000 Sobic002G028000 Sobic003G331800--Sobic002G028000 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic003G331800--Sobic003G255000 Sobic001G396050 Sobic001G396050 Sobic003G331800--Sobic001G396050 Sobic009G041200 Sobic009G041200 Sobic003G331800--Sobic009G041200 Sobic001G185100 Sobic001G185100 Sobic003G331800--Sobic001G185100 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic003G331800--Sobic005G002350 Sobic005G116250--Sobic004G196600 Sobic005G116250--Sobic005G088600 Sobic005G116250--Sobic002G028000 Sobic005G116250--Sobic001G185100 Sobic005G116250--Sobic001G396050 Sobic005G116250--Sobic009G041200 Sobic008G181050 Sobic008G181050 Sobic005G116250--Sobic008G181050 Sobic005G116250--Sobic003G255000 Sobic002G170740 Sobic002G170740 Sobic005G116250--Sobic002G170740 Sobic005G088600--Sobic005G116250 Sobic005G088600--Sobic009G041200 Sobic005G088600--Sobic004G196600 Sobic001G413850 Sobic001G413850 Sobic005G088600--Sobic001G413850 Sobic005G088600--Sobic001G396050 Sobic007G084800 Sobic007G084800 Sobic005G088600--Sobic007G084800 Sobic005G088600--Sobic002G028000 Sobic008G161601 Sobic008G161601 Sobic005G088600--Sobic008G161601 Sobic005G088600--Sobic008G181050 Sobic004G196600--Sobic005G116250 Sobic004G196600--Sobic002G028000 Sobic004G196600--Sobic001G185100 Sobic004G196600--Sobic005G088600 Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic004G196600--Sobic008G043800 Sobic004G196600--Sobic001G396050 Sobic004G196600--Sobic002G170740 Sobic004G058800 Sobic004G058800 Sobic004G196600--Sobic004G058800 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic004G196600--Sobic010G133100 Sobic002G028000--Sobic004G196600 Sobic002G028000--Sobic005G116250 Sobic002G028000--Sobic008G181050 Sobic002G028000--Sobic001G185100 Sobic002G028000--Sobic002G170740 Sobic002G028000--Sobic008G043800 Sobic005G215100 Sobic005G215100 Sobic002G028000--Sobic005G215100 Sobic002G028000--Sobic010G133100 Sobic002G028000--Sobic001G396050 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic003G255000--Sobic008G043000 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic003G255000--Sobic009G225250 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic003G255000--Sobic002G250700 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic005G002350 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic004G204700 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic003G255000--Sobic008G172900 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic003G255000--Sobic009G080500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic003G255000--Sobic003G063801 Sobic001G396050--Sobic005G116250 Sobic001G396050--Sobic004G196600 Sobic001G396050--Sobic001G185100 Sobic001G396050--Sobic005G088600 Sobic001G396050--Sobic002G028000 Sobic001G396050--Sobic003G255000 Sobic001G396050--Sobic005G002350 Sobic001G396050--Sobic002G392550 Sobic001G396050--Sobic010G133100 Sobic009G041200--Sobic007G084800 Sobic009G041200--Sobic001G413850 Sobic009G041200--Sobic005G088600 Sobic009G041100 Sobic009G041100 Sobic009G041200--Sobic009G041100 Sobic008G186700 Sobic008G186700 Sobic009G041200--Sobic008G186700 Sobic005G087666 Sobic005G087666 Sobic009G041200--Sobic005G087666 Sobic009G041200--Sobic008G161601 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic009G041200--Sobic010G237100 Sobic002G370300 Sobic002G370300 Sobic009G041200--Sobic002G370300 Sobic001G185100--Sobic004G196600 Sobic001G185100--Sobic005G116250 Sobic001G185100--Sobic002G028000 Sobic001G185100--Sobic001G396050 Sobic001G185100--Sobic008G043800 Sobic001G185100--Sobic005G088600 Sobic001G185100--Sobic010G133100 Sobic003G029350 Sobic003G029350 Sobic001G185100--Sobic003G029350 Sobic001G185100--Sobic003G255000 Sobic005G002350--Sobic008G043000 Sobic005G002350--Sobic009G225250 Sobic005G002350--Sobic003G255000 Sobic005G002350--Sobic002G250700 Sobic005G002350--Sobic009G080500 Sobic005G002350--Sobic002G392550 Sobic005G002350--Sobic004G204700 Sobic005G002350--Sobic008G172900 Sobic002G369100 Sobic002G369100 Sobic005G002350--Sobic002G369100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.