Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G244800.1
Synonym Sb09g029590
Functional annotation cell division control protein 2 homolog 3, putative, expressed
UniProt C5YWF0
Pfam PF07714
Panther DB PTHR24056 PTHR24056:SF190
NCBI CDD KOG0663; Protein kinase PITSLRE and related kinases
KEGG Orthology K08818; cell division cycle 2-like
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G63370 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g47880.1 : cell division control protein 2 homolog 3, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044696
Brachypodium KQK07268 , KQJ81950
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G300800 - -
2 Sobic.002G007300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14962: WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2
3 Sobic.001G261700 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G319050 - -
6 Sobic.001G284700 - -
7 Sobic.001G069100 - -
8 Sobic.009G169050 - -
9 Sobic.010G225950 - -
10 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G133150 - -
12 Sobic.006G105300 expressed protein -
13 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G495700 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
15 Sobic.007G199500 MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.004G029700 expressed protein -
17 Sobic.008G184500 aspartic proteinase, putative, expressed -
18 Sobic.005G033400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G057100 - -
20 Sobic.008G184000 aspartic proteinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G244800 Sobic009G244800 Sobic002G300800 Sobic002G300800 Sobic009G244800--Sobic002G300800 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic009G244800--Sobic002G007300 Sobic001G261700 Sobic001G261700 Sobic009G244800--Sobic001G261700 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic009G244800--Sobic002G097100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic009G244800--Sobic003G319050 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic009G244800--Sobic001G284700 Sobic001G069100 Sobic001G069100 Sobic009G244800--Sobic001G069100 Sobic009G169050 Sobic009G169050 Sobic009G244800--Sobic009G169050 Sobic010G225950 Sobic010G225950 Sobic009G244800--Sobic010G225950 Sobic001G029700 Sobic001G029700 Sobic002G300800--Sobic001G029700 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic002G300800--Sobic007G025100 Sobic002G300800--Sobic002G007300 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic002G300800--Sobic002G300900 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic002G300800--Sobic007G131100 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic002G300800--Sobic001G297700 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic002G300800--Sobic008G184000 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic002G300800--Sobic010G035000 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic002G300800--Sobic006G105300 Sobic002G007300--Sobic003G319050 Sobic002G007300--Sobic002G097100 Sobic002G007300--Sobic006G105300 Sobic002G007300--Sobic001G297700 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic002G007300--Sobic004G071100 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic002G007300--Sobic002G015500 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic002G007300--Sobic007G199500 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic002G007300--Sobic009G057100 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic002G007300--Sobic005G033400 Sobic001G261700--Sobic001G284700 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic001G261700--Sobic005G147500 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic001G261700--Sobic006G264800 Sobic001G261700--Sobic009G057100 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic001G261700--Sobic005G188800 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic001G261700--Sobic002G172100 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic001G261700--Sobic009G112200 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic001G261700--Sobic001G511400 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic001G261700--Sobic002G172200 Sobic002G097100--Sobic002G015500 Sobic002G097100--Sobic003G319050 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic002G097100--Sobic001G495700 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic002G097100--Sobic010G133150 Sobic002G097100--Sobic009G057100 Sobic002G097100--Sobic007G199500 Sobic002G097100--Sobic004G071100 Sobic002G097100--Sobic002G007300 Sobic002G097100--Sobic005G147500 Sobic003G319050--Sobic002G097100 Sobic003G319050--Sobic002G007300 Sobic003G319050--Sobic001G297700 Sobic003G319050--Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic004G071100 Sobic003G319050--Sobic006G105300 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic008G184500 Sobic003G319050--Sobic002G015500 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic003G319050--Sobic004G029700 Sobic001G284700--Sobic005G147500 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic001G284700--Sobic009G058300 Sobic001G284700--Sobic002G172100 Sobic001G284700--Sobic006G264800 Sobic001G284700--Sobic009G057100 Sobic001G284700--Sobic001G511400 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic001G284700--Sobic003G294800 Sobic001G284700--Sobic009G112200 Sobic001G284700--Sobic005G188800 Sobic001G069100--Sobic001G261700 Sobic001G069100--Sobic001G284700 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic001G069100--Sobic010G047300 Sobic001G069100--Sobic001G511400 Sobic001G069100--Sobic002G015500 Sobic003G325800 Sobic003G325800 Sobic001G069100--Sobic003G325800 Sobic001G069100--Sobic005G147500 Sobic001G069100--Sobic009G057100 Sobic001G069100--Sobic009G058300 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic009G169050--Sobic005G186250 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic009G169050--Sobic004G207500 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic009G169050--Sobic009G007100 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic009G169050--Sobic005G189000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic009G169050--Sobic006G142850 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic009G169050--Sobic005G184600 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic009G169050--Sobic007G049000 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic009G169050--Sobic005G184400 Sobic009G169050--Sobic006G105300 Sobic010G225950--Sobic002G007300 Sobic010G225950--Sobic004G207500 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic010G225950--Sobic005G227151 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic010G225950--Sobic002G358000 Sobic010G225950--Sobic006G105300 Sobic010G225950--Sobic006G142850 Sobic010G225950--Sobic005G186250 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic010G225950--Sobic002G105900 Sobic010G225950--Sobic007G049000
Octagon: transcription factors


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