Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G152000.1
Synonym
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QBI3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g16120.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G325832 - -
2 Sobic.008G045300 citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
3 Sobic.010G196200 OsSub51 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
4 Sobic.002G188200 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G130650 - -
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8 Sobic.003G250340 - K07976: Rab family, other
9 Sobic.008G175933 - -
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11 Sobic.009G029800 endoglucanase, putative, expressed -
12 Sobic.001G213150 - -
13 Sobic.003G118750 - -
14 Sobic.003G141400 expressed protein -
15 Sobic.010G118600 sodium/potassium/calcium exchanger 1, putative, expressed -
16 Sobic.009G203600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@Receptor-like protein kinase HSL1(PubMedID : 31721651)@receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.003G243750 - -
18 Sobic.007G215300 expressed protein -
19 Sobic.004G328800 transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G060900 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G152000 Sobic002G152000 Sobic004G325832 Sobic004G325832 Sobic002G152000--Sobic004G325832 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic002G152000--Sobic008G045300 Sobic010G196200 Sobic010G196200 Sobic002G152000--Sobic010G196200 Sobic002G188200 Sobic002G188200 Sobic002G152000--Sobic002G188200 Sobic003G130650 Sobic003G130650 Sobic002G152000--Sobic003G130650 Sobic006G044466 Sobic006G044466 Sobic002G152000--Sobic006G044466 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic002G152000--Sobic003G333150 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic002G152000--Sobic003G250340 Sobic008G175933 Sobic008G175933 Sobic002G152000--Sobic008G175933 Sobic004G325832--Sobic006G044466 Sobic004G325832--Sobic002G152000 Sobic004G325832--Sobic010G196200 Sobic004G325832--Sobic002G188200 Sobic008G005700 Sobic008G005700 Sobic004G325832--Sobic008G005700 Sobic004G325832--Sobic008G175933 Sobic004G325832--Sobic008G045300 Sobic002G350800 Sobic002G350800 Sobic004G325832--Sobic002G350800 Sobic001G003300 Sobic001G003300 Sobic004G325832--Sobic001G003300 Sobic008G045300--Sobic003G333150 Sobic008G045300--Sobic002G188200 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic008G045300--Sobic004G293600 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic008G045300--Sobic009G203600 Sobic008G045300--Sobic010G196200 Sobic004G328800 Sobic004G328800 Sobic008G045300--Sobic004G328800 Sobic008G045300--Sobic008G175933 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic008G045300--Sobic002G345100 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic008G045300--Sobic006G144900 Sobic010G196200--Sobic002G188200 Sobic010G196200--Sobic003G250340 Sobic010G196200--Sobic008G045300 Sobic010G196200--Sobic004G328800 Sobic010G196200--Sobic006G044466 Sobic010G196200--Sobic004G325832 Sobic010G196200--Sobic001G003300 Sobic010G196200--Sobic008G175933 Sobic010G196200--Sobic002G152000 Sobic002G188200--Sobic004G328800 Sobic002G188200--Sobic008G175933 Sobic002G188200--Sobic001G003300 Sobic002G188200--Sobic010G196200 Sobic002G188200--Sobic006G044466 Sobic002G188200--Sobic008G045300 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic002G188200--Sobic009G142600 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic002G188200--Sobic005G025500 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic002G188200--Sobic008G008601 Sobic003G130650--Sobic003G250340 Sobic003G130650--Sobic008G045300 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic003G130650--Sobic003G243750 Sobic007G165100 Sobic007G165100 Sobic003G130650--Sobic007G165100 Sobic003G130650--Sobic002G152000 Sobic007G114650 Sobic007G114650 Sobic003G130650--Sobic007G114650 Sobic005G038700 Sobic005G038700 Sobic003G130650--Sobic005G038700 Sobic003G130650--Sobic003G333150 Sobic003G130650--Sobic009G203600 Sobic006G044466--Sobic002G188200 Sobic006G044466--Sobic004G325832 Sobic006G044466--Sobic010G196200 Sobic006G044466--Sobic001G003300 Sobic006G044466--Sobic008G175933 Sobic006G044466--Sobic004G328800 Sobic006G044466--Sobic008G005700 Sobic006G044466--Sobic002G152000 Sobic006G044466--Sobic008G045300 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic003G333150--Sobic005G061300 Sobic003G333150--Sobic006G144900 Sobic003G333150--Sobic008G045300 Sobic003G333150--Sobic002G345100 Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic003G333150--Sobic005G114000 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic003G333150--Sobic003G002800 Sobic003G333150--Sobic004G293600 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic003G333150--Sobic010G025200 Sobic003G333150--Sobic009G203600 Sobic003G250340--Sobic010G196200 Sobic003G250340--Sobic008G045300 Sobic003G250340--Sobic005G038700 Sobic003G250340--Sobic003G130650 Sobic003G250340--Sobic009G203600 Sobic010G118600 Sobic010G118600 Sobic003G250340--Sobic010G118600 Sobic003G250340--Sobic007G114650 Sobic009G187900 Sobic009G187900 Sobic003G250340--Sobic009G187900 Sobic003G250340--Sobic003G333150 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic008G175933--Sobic004G090900 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic008G175933--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic008G175933--Sobic008G008701 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G175933--Sobic001G033701 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic008G175933--Sobic002G046500 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic008G175933--Sobic001G045300 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic008G175933--Sobic007G027400 Sobic008G175933--Sobic009G142600 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic008G175933--Sobic002G084100
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