Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G215300.1
Synonym Sb07g028170
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YJ61
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g30462.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G213150 - -
2 Sobic.009G029800 endoglucanase, putative, expressed -
3 Sobic.003G060900 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G204400 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G228300 expressed protein -
6 Sobic.009G142700 - -
7 Sobic.007G095850 - -
8 Sobic.010G273200 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
9 Sobic.005G144101 - -
10 Sobic.010G091750 - -
11 Sobic.001G152240 - -
12 Sobic.003G141400 expressed protein -
13 Sobic.002G103400 - -
14 Sobic.001G121000 - -
15 Sobic.003G118750 - -
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17 Sobic.001G285700 expressed protein -
18 Sobic.003G323750 - -
19 Sobic.004G173800 - -
20 Sobic.010G010100 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G215300 Sobic007G215300 Sobic001G213150 Sobic001G213150 Sobic007G215300--Sobic001G213150 Sobic009G029800 Sobic009G029800 Sobic007G215300--Sobic009G029800 Sobic003G060900 Sobic003G060900 Sobic007G215300--Sobic003G060900 Sobic005G204400 Sobic005G204400 Sobic007G215300--Sobic005G204400 Sobic010G228300 Sobic010G228300 Sobic007G215300--Sobic010G228300 Sobic009G142700 Sobic009G142700 Sobic007G215300--Sobic009G142700 Sobic007G095850 Sobic007G095850 Sobic007G215300--Sobic007G095850 Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic007G215300--Sobic010G273200 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic007G215300--Sobic005G144101 Sobic001G213150--Sobic009G029800 Sobic001G213150--Sobic003G060900 Sobic001G213150--Sobic007G215300 Sobic001G213150--Sobic010G273200 Sobic001G213150--Sobic005G144101 Sobic001G213150--Sobic005G204400 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic001G213150--Sobic010G091750 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic001G213150--Sobic002G103400 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic001G213150--Sobic003G141400 Sobic009G029800--Sobic001G213150 Sobic009G029800--Sobic003G060900 Sobic009G029800--Sobic010G273200 Sobic009G029800--Sobic005G144101 Sobic009G029800--Sobic007G215300 Sobic009G029800--Sobic002G103400 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic009G029800--Sobic001G152240 Sobic009G029800--Sobic010G091750 Sobic009G029800--Sobic003G141400 Sobic003G060900--Sobic001G213150 Sobic003G060900--Sobic010G273200 Sobic003G060900--Sobic009G029800 Sobic003G060900--Sobic005G144101 Sobic003G060900--Sobic010G091750 Sobic003G060900--Sobic007G215300 Sobic003G060900--Sobic002G103400 Sobic003G060900--Sobic001G152240 Sobic003G060900--Sobic005G204400 Sobic005G204400--Sobic007G215300 Sobic005G204400--Sobic001G213150 Sobic005G204400--Sobic009G029800 Sobic005G204400--Sobic003G060900 Sobic005G204400--Sobic010G273200 Sobic005G204400--Sobic005G144101 Sobic005G204400--Sobic001G152240 Sobic005G204400--Sobic002G103400 Sobic005G204400--Sobic010G091750 Sobic010G228300--Sobic007G215300 Sobic001G121000 Sobic001G121000 Sobic010G228300--Sobic001G121000 Sobic010G228300--Sobic007G095850 Sobic010G228300--Sobic009G142700 Sobic010G228300--Sobic001G213150 Sobic001G285700 Sobic001G285700 Sobic010G228300--Sobic001G285700 Sobic010G228300--Sobic005G204400 Sobic010G228300--Sobic003G060900 Sobic010G228300--Sobic009G029800 Sobic009G142700--Sobic007G215300 Sobic009G142700--Sobic001G213150 Sobic009G142700--Sobic010G228300 Sobic009G142700--Sobic009G029800 Sobic009G142700--Sobic003G060900 Sobic009G142700--Sobic005G204400 Sobic009G142700--Sobic007G095850 Sobic009G142700--Sobic010G273200 Sobic009G142700--Sobic001G121000 Sobic007G095850--Sobic007G215300 Sobic007G095850--Sobic010G228300 Sobic007G095850--Sobic001G213150 Sobic007G095850--Sobic001G121000 Sobic007G095850--Sobic009G142700 Sobic007G095850--Sobic003G060900 Sobic007G095850--Sobic009G029800 Sobic007G095850--Sobic005G204400 Sobic007G095850--Sobic001G285700 Sobic010G273200--Sobic005G144101 Sobic010G273200--Sobic001G152240 Sobic010G273200--Sobic002G103400 Sobic010G273200--Sobic010G091750 Sobic010G273200--Sobic003G060900 Sobic010G273200--Sobic009G029800 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic010G273200--Sobic004G173800 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic010G273200--Sobic007G087500 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic010G273200--Sobic006G004700 Sobic005G144101--Sobic010G273200 Sobic005G144101--Sobic002G103400 Sobic005G144101--Sobic001G152240 Sobic005G144101--Sobic010G091750 Sobic005G144101--Sobic004G173800 Sobic005G144101--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic005G144101--Sobic008G053700 Sobic005G144101--Sobic007G087500 Sobic005G144101--Sobic009G029800
Octagon: transcription factors


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