Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G407500.1
Synonym Sb02g042140
Functional annotation sex determination protein tasselseed-2, putative, expressed
UniProt C5X4U4
Pfam PF13561
Panther DB PTHR24322 PTHR24322:SF408
NCBI CDD KOG0725; Reductases with broad range of substrate specificities
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G03140 : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g46830.1 : sex determination protein tasselseed-2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G021540.3 , HORVU2Hr1G021540.8 , HORVU2Hr1G021540.9 , HORVU2Hr1G021540.4 , HORVU2Hr1G021540.5 , HORVU2Hr1G021540.6 , HORVU2Hr1G021540.7 , HORVU2Hr1G021540.2 , HORVU2Hr1G021540.10
Wheat TraesCS2B02G145100 , TraesCS2A02G123000 , TraesCS2A02G122900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G407500 Sobic002G407500 Sobic001G213150 Sobic001G213150 Sobic002G407500--Sobic001G213150 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic002G407500--Sobic005G144101 Sobic009G029800 Sobic009G029800 Sobic002G407500--Sobic009G029800 Sobic005G204400 Sobic005G204400 Sobic002G407500--Sobic005G204400 Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic002G407500--Sobic010G273200 Sobic003G060900 Sobic003G060900 Sobic002G407500--Sobic003G060900 Sobic007G215300 Sobic007G215300 Sobic002G407500--Sobic007G215300 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic002G407500--Sobic001G152240 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic002G407500--Sobic002G103400 Sobic001G213150--Sobic009G029800 Sobic001G213150--Sobic003G060900 Sobic001G213150--Sobic007G215300 Sobic001G213150--Sobic010G273200 Sobic001G213150--Sobic005G144101 Sobic001G213150--Sobic005G204400 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic001G213150--Sobic010G091750 Sobic001G213150--Sobic002G103400 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic001G213150--Sobic003G141400 Sobic005G144101--Sobic010G273200 Sobic005G144101--Sobic002G103400 Sobic005G144101--Sobic001G152240 Sobic005G144101--Sobic010G091750 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic005G144101--Sobic004G173800 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic005G144101--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic005G144101--Sobic008G053700 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic005G144101--Sobic007G087500 Sobic005G144101--Sobic009G029800 Sobic009G029800--Sobic001G213150 Sobic009G029800--Sobic003G060900 Sobic009G029800--Sobic010G273200 Sobic009G029800--Sobic005G144101 Sobic009G029800--Sobic007G215300 Sobic009G029800--Sobic002G103400 Sobic009G029800--Sobic001G152240 Sobic009G029800--Sobic010G091750 Sobic009G029800--Sobic003G141400 Sobic005G204400--Sobic007G215300 Sobic005G204400--Sobic001G213150 Sobic005G204400--Sobic009G029800 Sobic005G204400--Sobic003G060900 Sobic005G204400--Sobic010G273200 Sobic005G204400--Sobic005G144101 Sobic005G204400--Sobic001G152240 Sobic005G204400--Sobic002G103400 Sobic005G204400--Sobic010G091750 Sobic010G273200--Sobic005G144101 Sobic010G273200--Sobic001G152240 Sobic010G273200--Sobic002G103400 Sobic010G273200--Sobic010G091750 Sobic010G273200--Sobic003G060900 Sobic010G273200--Sobic009G029800 Sobic010G273200--Sobic004G173800 Sobic010G273200--Sobic007G087500 Sobic010G273200--Sobic006G004700 Sobic003G060900--Sobic001G213150 Sobic003G060900--Sobic010G273200 Sobic003G060900--Sobic009G029800 Sobic003G060900--Sobic005G144101 Sobic003G060900--Sobic010G091750 Sobic003G060900--Sobic007G215300 Sobic003G060900--Sobic002G103400 Sobic003G060900--Sobic001G152240 Sobic003G060900--Sobic005G204400 Sobic007G215300--Sobic001G213150 Sobic007G215300--Sobic009G029800 Sobic007G215300--Sobic003G060900 Sobic007G215300--Sobic005G204400 Sobic010G228300 Sobic010G228300 Sobic007G215300--Sobic010G228300 Sobic009G142700 Sobic009G142700 Sobic007G215300--Sobic009G142700 Sobic007G095850 Sobic007G095850 Sobic007G215300--Sobic007G095850 Sobic007G215300--Sobic010G273200 Sobic007G215300--Sobic005G144101 Sobic001G152240--Sobic002G103400 Sobic001G152240--Sobic010G273200 Sobic001G152240--Sobic005G144101 Sobic001G152240--Sobic004G173800 Sobic001G152240--Sobic008G053700 Sobic001G152240--Sobic006G004700 Sobic001G152240--Sobic010G091750 Sobic001G152240--Sobic007G087500 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic001G152240--Sobic003G046000 Sobic002G103400--Sobic001G152240 Sobic002G103400--Sobic005G144101 Sobic002G103400--Sobic010G273200 Sobic002G103400--Sobic008G053700 Sobic002G103400--Sobic006G004700 Sobic002G103400--Sobic010G091750 Sobic002G103400--Sobic004G173800 Sobic002G103400--Sobic007G087500 Sobic002G103400--Sobic003G046000
Octagon: transcription factors


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