Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G266000.1
Synonym Sb10g030130
Functional annotation uncharacterized protein (PubMedID : 28640841)
expressed protein
UniProt C5Z1V4
Pfam PF10999
Panther DB PTHR36347 PTHR36347:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17972 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g50130.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018482
Brachypodium PNT75576
Barley HORVU7Hr1G091580.2 , HORVU7Hr1G091580.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G266000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.006G076700 - -
19 Sobic.008G008601 - -
20 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G266000 Sobic010G266000 Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic010G266000--Sobic010G273200 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic010G266000--Sobic001G152240 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic010G266000--Sobic002G103400 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic010G266000--Sobic010G091750 Sobic010G103300 Sobic010G103300 Sobic010G266000--Sobic010G103300 Sobic003G060900 Sobic003G060900 Sobic010G266000--Sobic003G060900 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic010G266000--Sobic005G144101 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic010G266000--Sobic007G087500 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic010G266000--Sobic008G053700 Sobic010G273200--Sobic005G144101 Sobic010G273200--Sobic001G152240 Sobic010G273200--Sobic002G103400 Sobic010G273200--Sobic010G091750 Sobic010G273200--Sobic003G060900 Sobic009G029800 Sobic009G029800 Sobic010G273200--Sobic009G029800 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic010G273200--Sobic004G173800 Sobic010G273200--Sobic007G087500 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic010G273200--Sobic006G004700 Sobic001G152240--Sobic002G103400 Sobic001G152240--Sobic010G273200 Sobic001G152240--Sobic005G144101 Sobic001G152240--Sobic004G173800 Sobic001G152240--Sobic008G053700 Sobic001G152240--Sobic006G004700 Sobic001G152240--Sobic010G091750 Sobic001G152240--Sobic007G087500 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic001G152240--Sobic003G046000 Sobic002G103400--Sobic001G152240 Sobic002G103400--Sobic005G144101 Sobic002G103400--Sobic010G273200 Sobic002G103400--Sobic008G053700 Sobic002G103400--Sobic006G004700 Sobic002G103400--Sobic010G091750 Sobic002G103400--Sobic004G173800 Sobic002G103400--Sobic007G087500 Sobic002G103400--Sobic003G046000 Sobic010G091750--Sobic002G103400 Sobic010G091750--Sobic010G273200 Sobic010G091750--Sobic007G087500 Sobic010G091750--Sobic005G144101 Sobic010G091750--Sobic001G152240 Sobic010G091750--Sobic006G004700 Sobic010G091750--Sobic008G053700 Sobic010G091750--Sobic004G173800 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic010G091750--Sobic001G452300 Sobic010G103300--Sobic008G053700 Sobic010G103300--Sobic006G004700 Sobic010G103300--Sobic003G046000 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic010G103300--Sobic008G069901 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic010G103300--Sobic004G184900 Sobic010G103300--Sobic001G452300 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic010G103300--Sobic002G063500 Sobic010G103300--Sobic007G087500 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic010G103300--Sobic009G113300 Sobic001G213150 Sobic001G213150 Sobic003G060900--Sobic001G213150 Sobic003G060900--Sobic010G273200 Sobic003G060900--Sobic009G029800 Sobic003G060900--Sobic005G144101 Sobic003G060900--Sobic010G091750 Sobic007G215300 Sobic007G215300 Sobic003G060900--Sobic007G215300 Sobic003G060900--Sobic002G103400 Sobic003G060900--Sobic001G152240 Sobic005G204400 Sobic005G204400 Sobic003G060900--Sobic005G204400 Sobic005G144101--Sobic010G273200 Sobic005G144101--Sobic002G103400 Sobic005G144101--Sobic001G152240 Sobic005G144101--Sobic010G091750 Sobic005G144101--Sobic004G173800 Sobic005G144101--Sobic006G004700 Sobic005G144101--Sobic008G053700 Sobic005G144101--Sobic007G087500 Sobic005G144101--Sobic009G029800 Sobic007G087500--Sobic006G004700 Sobic007G087500--Sobic008G053700 Sobic007G087500--Sobic001G452300 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic007G087500--Sobic008G008601 Sobic007G087500--Sobic002G063500 Sobic007G087500--Sobic004G184900 Sobic007G087500--Sobic008G069901 Sobic007G087500--Sobic010G091750 Sobic007G087500--Sobic003G046000 Sobic008G053700--Sobic006G004700 Sobic008G053700--Sobic003G046000 Sobic008G053700--Sobic008G069901 Sobic008G053700--Sobic004G184900 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic008G053700--Sobic006G076700 Sobic008G053700--Sobic007G087500 Sobic008G053700--Sobic002G063500 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic008G053700--Sobic001G160300 Sobic008G053700--Sobic004G173800
Octagon: transcription factors


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