Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G236300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QD44
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G169650 - -
2 Sobic.002G417700 DUF623 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G094700 - -
4 Sobic.001G259200 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G156400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
6 Sobic.009G022600 - -
7 Sobic.004G264800 expressed protein -
8 Sobic.004G037401 - -
9 Sobic.007G032200 - -
10 Sobic.002G424550 - -
11 Sobic.001G468900 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence./late senescence marker (common during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence)"(PubMedID : 27586543)@DUF623 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.006G155400 expressed protein -
13 Sobic.002G132201 - -
14 Sobic.003G193900 - -
15 Sobic.003G253650 - -
16 Sobic.001G221750 - -
17 Sobic.001G469966 - -
18 Sobic.002G054800 "O2(Ortholog in maize:Hartings et al., 1989)"(PubMedID : 31659852)@bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G172300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
20 Sobic.005G073300 limonoid UDP-glucosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G236300 Sobic002G236300 Sobic008G169650 Sobic008G169650 Sobic002G236300--Sobic008G169650 Sobic002G417700 Sobic002G417700 Sobic002G236300--Sobic002G417700 Sobic002G094700 Sobic002G094700 Sobic002G236300--Sobic002G094700 Sobic001G259200 Sobic001G259200 Sobic002G236300--Sobic001G259200 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic002G236300--Sobic007G156400 Sobic009G022600 Sobic009G022600 Sobic002G236300--Sobic009G022600 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic002G236300--Sobic004G264800 Sobic004G037401 Sobic004G037401 Sobic002G236300--Sobic004G037401 Sobic007G032200 Sobic007G032200 Sobic002G236300--Sobic007G032200 Sobic008G169650--Sobic002G236300 Sobic008G169650--Sobic002G094700 Sobic008G169650--Sobic001G259200 Sobic003G048900 Sobic003G048900 Sobic008G169650--Sobic003G048900 Sobic010G200300 Sobic010G200300 Sobic008G169650--Sobic010G200300 Sobic005G029300 Sobic005G029300 Sobic008G169650--Sobic005G029300 Sobic008G169650--Sobic002G417700 Sobic010G207450 Sobic010G207450 Sobic008G169650--Sobic010G207450 Sobic003G431100 Sobic003G431100 Sobic008G169650--Sobic003G431100 Sobic002G417700--Sobic007G156400 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic002G417700--Sobic007G072700 Sobic002G417700--Sobic002G236300 Sobic002G417700--Sobic004G264800 Sobic004G282200 Sobic004G282200 Sobic002G417700--Sobic004G282200 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic002G417700--Sobic007G064400 Sobic001G130100 Sobic001G130100 Sobic002G417700--Sobic001G130100 Sobic001G347400 Sobic001G347400 Sobic002G417700--Sobic001G347400 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic002G417700--Sobic001G371650 Sobic002G094700--Sobic001G259200 Sobic002G094700--Sobic003G048900 Sobic002G094700--Sobic010G200300 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic002G094700--Sobic001G221750 Sobic001G468900 Sobic001G468900 Sobic002G094700--Sobic001G468900 Sobic002G424550 Sobic002G424550 Sobic002G094700--Sobic002G424550 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic002G094700--Sobic006G155400 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic002G094700--Sobic007G069750 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic002G094700--Sobic001G112300 Sobic001G259200--Sobic001G112300 Sobic001G259200--Sobic002G094700 Sobic001G259200--Sobic010G200300 Sobic001G259200--Sobic007G069750 Sobic001G259200--Sobic001G221750 Sobic001G259200--Sobic006G155400 Sobic009G127201 Sobic009G127201 Sobic001G259200--Sobic009G127201 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic001G259200--Sobic002G213050 Sobic002G237400 Sobic002G237400 Sobic001G259200--Sobic002G237400 Sobic007G156400--Sobic007G072700 Sobic007G156400--Sobic004G264800 Sobic007G156400--Sobic004G282200 Sobic007G156400--Sobic001G371650 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic007G156400--Sobic003G253650 Sobic007G156400--Sobic007G064400 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic007G156400--Sobic002G172300 Sobic007G156400--Sobic007G032200 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic007G156400--Sobic002G054800 Sobic009G022600--Sobic004G037401 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic009G022600--Sobic002G132201 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic009G022600--Sobic005G073300 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic009G022600--Sobic003G149700 Sobic009G022600--Sobic002G054800 Sobic009G022600--Sobic006G155400 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic009G022600--Sobic005G150250 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic009G022600--Sobic001G071500 Sobic002G240200 Sobic002G240200 Sobic009G022600--Sobic002G240200 Sobic004G264800--Sobic007G072700 Sobic004G264800--Sobic007G156400 Sobic004G264800--Sobic004G282200 Sobic004G264800--Sobic003G253650 Sobic004G264800--Sobic002G172300 Sobic004G264800--Sobic001G371650 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic004G264800--Sobic008G030801 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic004G264800--Sobic003G229900 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic004G264800--Sobic010G011500 Sobic004G037401--Sobic009G022600 Sobic004G037401--Sobic003G149700 Sobic004G037401--Sobic005G150250 Sobic004G037401--Sobic006G155400 Sobic004G037401--Sobic002G132201 Sobic004G037401--Sobic005G073300 Sobic004G037401--Sobic002G054800 Sobic004G207350 Sobic004G207350 Sobic004G037401--Sobic004G207350 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic004G037401--Sobic003G356500 Sobic007G032200--Sobic001G371650 Sobic007G032200--Sobic002G132201 Sobic007G032200--Sobic002G054800 Sobic007G032200--Sobic002G240200 Sobic007G032200--Sobic004G282200 Sobic007G032200--Sobic005G073300 Sobic007G032200--Sobic003G048900 Sobic007G032200--Sobic001G071500 Sobic007G032200--Sobic009G022600
Octagon: transcription factors


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