Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G245600.1
Synonym Sb02g028230
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X3V6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g31170.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014197
Brachypodium KQJ90732
Barley HORVU5Hr1G072860.1 , HORVU5Hr1G072860.2 , HORVU5Hr1G072860.3
Wheat TraesCS5A02G263300 , TraesCS5D02G270800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G294000 protein kinase domain containing protein, expressed -
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3 Sobic.009G094000 - -
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7 Sobic.006G256801 - -
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12 Sobic.006G094400 - -
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15 Sobic.001G145300 - -
16 Sobic.002G165401 - -
17 Sobic.008G088863 - -
18 Sobic.010G244701 - -
19 Sobic.004G314750 - -
20 Sobic.003G279600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G245600 Sobic002G245600 Sobic003G294000 Sobic003G294000 Sobic002G245600--Sobic003G294000 Sobic007G209400 Sobic007G209400 Sobic002G245600--Sobic007G209400 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic002G245600--Sobic009G094000 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic002G245600--Sobic004G279150 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic002G245600--Sobic009G127600 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic002G245600--Sobic001G434450 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic002G245600--Sobic006G256801 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic002G245600--Sobic007G157200 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic002G245600--Sobic006G167200 Sobic003G294000--Sobic004G279150 Sobic003G294000--Sobic002G245600 Sobic003G294000--Sobic009G094000 Sobic002G180501 Sobic002G180501 Sobic003G294000--Sobic002G180501 Sobic003G294000--Sobic006G167200 Sobic003G294000--Sobic009G127600 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic003G294000--Sobic006G019901 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic003G294000--Sobic002G165401 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic003G294000--Sobic001G481201 Sobic007G209400--Sobic002G245600 Sobic007G209400--Sobic009G127600 Sobic007G209400--Sobic004G279150 Sobic007G209400--Sobic009G094000 Sobic007G209400--Sobic001G434450 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic007G209400--Sobic006G094400 Sobic001G493800 Sobic001G493800 Sobic007G209400--Sobic001G493800 Sobic007G209400--Sobic006G256801 Sobic002G320200 Sobic002G320200 Sobic007G209400--Sobic002G320200 Sobic009G094000--Sobic001G434450 Sobic009G094000--Sobic006G094400 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic009G094000--Sobic004G314750 Sobic009G094000--Sobic006G256801 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic009G094000--Sobic008G164525 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic009G094000--Sobic004G001900 Sobic009G094000--Sobic002G165401 Sobic009G094000--Sobic004G279150 Sobic003G101600 Sobic003G101600 Sobic009G094000--Sobic003G101600 Sobic004G279150--Sobic009G127600 Sobic001G145300 Sobic001G145300 Sobic004G279150--Sobic001G145300 Sobic001G422800 Sobic001G422800 Sobic004G279150--Sobic001G422800 Sobic004G279150--Sobic009G094000 Sobic004G279150--Sobic006G167200 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic004G279150--Sobic002G284701 Sobic004G279150--Sobic006G019901 Sobic008G088863 Sobic008G088863 Sobic004G279150--Sobic008G088863 Sobic004G279150--Sobic002G165401 Sobic009G127600--Sobic001G145300 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic009G127600--Sobic002G156300 Sobic009G127600--Sobic004G279150 Sobic009G127600--Sobic001G481201 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic009G127600--Sobic010G114400 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic009G127600--Sobic003G008850 Sobic009G127600--Sobic006G019901 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic009G127600--Sobic007G001300 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic009G127600--Sobic003G109400 Sobic001G434450--Sobic008G164525 Sobic001G434450--Sobic004G314750 Sobic001G434450--Sobic006G256801 Sobic001G434450--Sobic006G094400 Sobic001G434450--Sobic003G008850 Sobic001G434450--Sobic009G094000 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic001G434450--Sobic010G244701 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic001G434450--Sobic001G120100 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic001G434450--Sobic006G222800 Sobic006G256801--Sobic003G008850 Sobic006G256801--Sobic008G164525 Sobic006G256801--Sobic006G094400 Sobic006G256801--Sobic001G434450 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic006G256801--Sobic006G180500 Sobic006G256801--Sobic001G120100 Sobic006G256801--Sobic006G222800 Sobic006G256801--Sobic010G244701 Sobic006G256801--Sobic002G165401 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic007G157200--Sobic010G097800 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic007G157200--Sobic001G212701 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic007G157200--Sobic003G279600 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic007G157200--Sobic004G184500 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic007G157200--Sobic002G114600 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic007G157200--Sobic010G132300 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic007G157200--Sobic001G176800 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic007G157200--Sobic009G184500 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic007G157200--Sobic002G018133 Sobic010G122533 Sobic010G122533 Sobic006G167200--Sobic010G122533 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic006G167200--Sobic002G188100 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic006G167200--Sobic009G039400 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic006G167200--Sobic006G133650 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic006G167200--Sobic003G081400 Sobic001G261440 Sobic001G261440 Sobic006G167200--Sobic001G261440 Sobic006G172651 Sobic006G172651 Sobic006G167200--Sobic006G172651 Sobic010G045300 Sobic010G045300 Sobic006G167200--Sobic010G045300 Sobic006G167200--Sobic009G127600
Octagon: transcription factors


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