Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G396600.1
Synonym Sb02g041170, AtDMP1, DMP1
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X403
Pfam PF05078
Panther DB PTHR31621 PTHR31621:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G21520 : DUF679 domain membrane protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g45080.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK22490
Barley HORVU3Hr1G051050.1 , HORVU3Hr1G051050.2 , HORVU3Hr1G051050.3 , HORVU2Hr1G025080.1 , HORVU5Hr1G034760.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G151000 protein kinase domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G313150 - -
3 Sobic.001G127600 ZOS3-15 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
4 Sobic.001G337200 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
5 Sobic.001G443700 MYB family transcription factor, putative, expressed -
6 Sobic.004G155700 LSM domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G090900 late embryogenesis abundant protein D-34, putative, expressed -
8 Sobic.002G105501 - -
9 Sobic.007G220066 - -
10 Sobic.004G251701 - -
11 Sobic.010G046200 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G096566 - -
13 Sobic.002G282800 "Decreased expression levels by drought stress, up-regulated by silicon application under drought stress "(PubMedID : 24813726)@pyridoxal-dependent decarboxylase protein, putative, expressed K01581: E4.1.1.17, ODC1, speC, ornithine decarboxylase
14 Sobic.006G115400 ZOS4-08 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
15 Sobic.009G185000 - -
16 Sobic.003G167200 - -
17 Sobic.004G349500 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.009G165600 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, putative, expressed K03017: RPB9, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
19 Sobic.009G066000 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G458500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G396600 Sobic002G396600 Sobic005G151000 Sobic005G151000 Sobic002G396600--Sobic005G151000 Sobic001G313150 Sobic001G313150 Sobic002G396600--Sobic001G313150 Sobic001G127600 Sobic001G127600 Sobic002G396600--Sobic001G127600 Sobic001G337200 Sobic001G337200 Sobic002G396600--Sobic001G337200 Sobic001G443700 Sobic001G443700 Sobic002G396600--Sobic001G443700 Sobic004G155700 Sobic004G155700 Sobic002G396600--Sobic004G155700 Sobic001G090900 Sobic001G090900 Sobic002G396600--Sobic001G090900 Sobic002G105501 Sobic002G105501 Sobic002G396600--Sobic002G105501 Sobic007G220066 Sobic007G220066 Sobic002G396600--Sobic007G220066 Sobic009G096566 Sobic009G096566 Sobic005G151000--Sobic009G096566 Sobic004G349500 Sobic004G349500 Sobic005G151000--Sobic004G349500 Sobic001G005400 Sobic001G005400 Sobic005G151000--Sobic001G005400 Sobic004G351932 Sobic004G351932 Sobic005G151000--Sobic004G351932 Sobic001G522800 Sobic001G522800 Sobic005G151000--Sobic001G522800 Sobic005G151000--Sobic002G105501 Sobic005G151000--Sobic007G220066 Sobic001G250900 Sobic001G250900 Sobic005G151000--Sobic001G250900 Sobic004G251701 Sobic004G251701 Sobic005G151000--Sobic004G251701 Sobic008G105600 Sobic008G105600 Sobic001G313150--Sobic008G105600 Sobic003G167200 Sobic003G167200 Sobic001G313150--Sobic003G167200 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic001G313150--Sobic006G038700 Sobic001G313150--Sobic004G155700 Sobic010G143633 Sobic010G143633 Sobic001G313150--Sobic010G143633 Sobic009G056900 Sobic009G056900 Sobic001G313150--Sobic009G056900 Sobic001G392700 Sobic001G392700 Sobic001G313150--Sobic001G392700 Sobic008G154600 Sobic008G154600 Sobic001G313150--Sobic008G154600 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic001G313150--Sobic002G066700 Sobic001G122700 Sobic001G122700 Sobic001G127600--Sobic001G122700 Sobic005G102600 Sobic005G102600 Sobic001G127600--Sobic005G102600 Sobic002G089300 Sobic002G089300 Sobic001G127600--Sobic002G089300 Sobic004G196900 Sobic004G196900 Sobic001G127600--Sobic004G196900 Sobic006G229400 Sobic006G229400 Sobic001G127600--Sobic006G229400 Sobic009G185000 Sobic009G185000 Sobic001G127600--Sobic009G185000 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic001G127600--Sobic009G244450 Sobic002G341400 Sobic002G341400 Sobic001G127600--Sobic002G341400 Sobic005G029300 Sobic005G029300 Sobic001G127600--Sobic005G029300 Sobic001G337200--Sobic008G154600 Sobic001G337200--Sobic004G251701 Sobic004G186400 Sobic004G186400 Sobic001G337200--Sobic004G186400 Sobic001G305200 Sobic001G305200 Sobic001G337200--Sobic001G305200 Sobic001G337200--Sobic001G522800 Sobic003G307500 Sobic003G307500 Sobic001G337200--Sobic003G307500 Sobic010G276500 Sobic010G276500 Sobic001G337200--Sobic010G276500 Sobic001G337200--Sobic001G443700 Sobic008G095766 Sobic008G095766 Sobic001G337200--Sobic008G095766 Sobic001G443700--Sobic001G337200 Sobic001G027700 Sobic001G027700 Sobic001G443700--Sobic001G027700 Sobic002G136200 Sobic002G136200 Sobic001G443700--Sobic002G136200 Sobic001G443700--Sobic008G154600 Sobic001G443700--Sobic004G251701 Sobic001G443700--Sobic001G005400 Sobic001G443700--Sobic008G095766 Sobic001G124900 Sobic001G124900 Sobic001G443700--Sobic001G124900 Sobic003G302600 Sobic003G302600 Sobic001G443700--Sobic003G302600 Sobic004G155700--Sobic001G313150 Sobic004G155700--Sobic008G154600 Sobic004G155700--Sobic001G392700 Sobic004G155700--Sobic009G056900 Sobic001G075201 Sobic001G075201 Sobic004G155700--Sobic001G075201 Sobic009G119100 Sobic009G119100 Sobic004G155700--Sobic009G119100 Sobic010G051800 Sobic010G051800 Sobic004G155700--Sobic010G051800 Sobic004G155700--Sobic008G105600 Sobic008G095633 Sobic008G095633 Sobic004G155700--Sobic008G095633 Sobic001G090900--Sobic009G185000 Sobic002G282800 Sobic002G282800 Sobic001G090900--Sobic002G282800 Sobic001G090900--Sobic004G196900 Sobic002G243100 Sobic002G243100 Sobic001G090900--Sobic002G243100 Sobic001G090900--Sobic005G102600 Sobic001G090900--Sobic002G089300 Sobic001G090900--Sobic006G229400 Sobic001G090900--Sobic005G029300 Sobic004G111500 Sobic004G111500 Sobic001G090900--Sobic004G111500 Sobic002G105501--Sobic007G220066 Sobic009G066000 Sobic009G066000 Sobic002G105501--Sobic009G066000 Sobic007G139950 Sobic007G139950 Sobic002G105501--Sobic007G139950 Sobic002G105501--Sobic009G096566 Sobic006G115400 Sobic006G115400 Sobic002G105501--Sobic006G115400 Sobic003G386350 Sobic003G386350 Sobic002G105501--Sobic003G386350 Sobic002G105501--Sobic004G349500 Sobic003G331550 Sobic003G331550 Sobic002G105501--Sobic003G331550 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic002G105501--Sobic010G046200 Sobic007G220066--Sobic002G105501 Sobic007G220066--Sobic009G066000 Sobic007G220066--Sobic007G139950 Sobic007G220066--Sobic009G096566 Sobic007G220066--Sobic006G115400 Sobic007G220066--Sobic003G386350 Sobic007G220066--Sobic004G349500 Sobic007G220066--Sobic003G331550 Sobic007G220066--Sobic010G046200
Octagon: transcription factors


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