Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G026100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q136
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022990 , Zm00025a035868
Brachypodium KQK03225
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G361500 expressed protein -
2 Sobic.005G087600 AP2 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.010G014600 aspartic protease, putative, expressed -
4 Sobic.005G189400 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.004G330500 expressed protein -
6 Sobic.006G185400 - -
7 Sobic.006G090201 - -
8 Sobic.007G152200 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -
9 Sobic.009G164200 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11252: histone H2B
10 Sobic.010G275550 - -
11 Sobic.006G201200 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
12 Sobic.006G209100 - -
13 Sobic.002G205201 - -
14 Sobic.008G023500 expressed protein -
15 Sobic.007G056400 vacuolar ATP synthase subunit D 1, putative, expressed K02149: ATPeV1D, V-type H+-transporting ATPase subunit D
16 Sobic.010G058650 - -
17 Sobic.005G037500 expressed protein -
18 Sobic.002G037000 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.003G245700 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G072901 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G026100 Sobic003G026100 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic003G026100--Sobic001G361500 Sobic005G087600 Sobic005G087600 Sobic003G026100--Sobic005G087600 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic003G026100--Sobic010G014600 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic003G026100--Sobic005G189400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic003G026100--Sobic004G330500 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic003G026100--Sobic006G185400 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic003G026100--Sobic006G090201 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic003G026100--Sobic007G152200 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic003G026100--Sobic009G164200 Sobic001G361500--Sobic006G185400 Sobic001G361500--Sobic004G330500 Sobic001G361500--Sobic005G189400 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic001G361500--Sobic006G209100 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic001G361500--Sobic002G205201 Sobic001G361500--Sobic007G152200 Sobic001G361500--Sobic009G164200 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic001G361500--Sobic008G023500 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic001G361500--Sobic005G037500 Sobic005G087600--Sobic003G026100 Sobic005G087600--Sobic001G361500 Sobic005G087600--Sobic009G164200 Sobic010G231400 Sobic010G231400 Sobic005G087600--Sobic010G231400 Sobic005G087600--Sobic006G185400 Sobic005G087600--Sobic006G090201 Sobic005G087600--Sobic006G209100 Sobic005G087600--Sobic004G330500 Sobic005G087600--Sobic005G189400 Sobic010G014600--Sobic005G189400 Sobic010G014600--Sobic004G330500 Sobic010G014600--Sobic006G090201 Sobic010G014600--Sobic007G152200 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic010G014600--Sobic006G214101 Sobic010G014600--Sobic006G185400 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic010G014600--Sobic010G275550 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic010G014600--Sobic004G325766 Sobic004G072950 Sobic004G072950 Sobic010G014600--Sobic004G072950 Sobic005G189400--Sobic004G330500 Sobic005G189400--Sobic006G185400 Sobic005G189400--Sobic007G152200 Sobic005G189400--Sobic002G205201 Sobic005G189400--Sobic001G361500 Sobic005G189400--Sobic006G209100 Sobic005G189400--Sobic008G023500 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic005G189400--Sobic003G245700 Sobic005G189400--Sobic006G090201 Sobic004G330500--Sobic005G189400 Sobic004G330500--Sobic006G185400 Sobic004G330500--Sobic007G152200 Sobic004G330500--Sobic002G205201 Sobic004G330500--Sobic001G361500 Sobic004G330500--Sobic006G209100 Sobic004G330500--Sobic008G023500 Sobic004G330500--Sobic005G037500 Sobic004G330500--Sobic006G090201 Sobic006G185400--Sobic004G330500 Sobic006G185400--Sobic005G189400 Sobic006G185400--Sobic001G361500 Sobic006G185400--Sobic007G152200 Sobic006G185400--Sobic002G205201 Sobic006G185400--Sobic006G209100 Sobic006G185400--Sobic008G023500 Sobic006G185400--Sobic005G037500 Sobic006G185400--Sobic009G164200 Sobic006G090201--Sobic005G189400 Sobic006G090201--Sobic004G330500 Sobic006G090201--Sobic006G185400 Sobic006G090201--Sobic007G152200 Sobic006G090201--Sobic006G209100 Sobic006G090201--Sobic003G245700 Sobic006G090201--Sobic001G361500 Sobic006G090201--Sobic008G023500 Sobic006G090201--Sobic002G205201 Sobic007G152200--Sobic004G330500 Sobic007G152200--Sobic005G189400 Sobic007G152200--Sobic006G185400 Sobic007G152200--Sobic002G205201 Sobic007G152200--Sobic001G361500 Sobic007G152200--Sobic006G209100 Sobic007G152200--Sobic008G023500 Sobic007G152200--Sobic009G164200 Sobic007G152200--Sobic005G037500 Sobic009G164200--Sobic004G330500 Sobic009G164200--Sobic006G185400 Sobic009G164200--Sobic008G023500 Sobic009G164200--Sobic005G189400 Sobic009G164200--Sobic001G361500 Sobic009G164200--Sobic006G209100 Sobic009G164200--Sobic007G152200 Sobic009G164200--Sobic002G205201 Sobic009G164200--Sobic005G037500
Octagon: transcription factors


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