Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G186200.1
Synonym Sb03g025130
Functional annotation RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed
UniProt C5XN08
Pfam PF02042
Panther DB PTHR10270
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G53040 : RWP-RK domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g37100.1 : RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK08285
Barley -
Wheat TraesCS7A02G135900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G213100 RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed K11699: RDR, RNA-dependent RNA polymerase
2 Sobic.010G265100 - -
3 Sobic.001G148800 hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed -
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19 Sobic.007G171300 - -
20 Sobic.004G019250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G186200 Sobic003G186200 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic003G186200--Sobic010G213100 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic003G186200--Sobic010G265100 Sobic001G148800 Sobic001G148800 Sobic003G186200--Sobic001G148800 Sobic006G212700 Sobic006G212700 Sobic003G186200--Sobic006G212700 Sobic001G521400 Sobic001G521400 Sobic003G186200--Sobic001G521400 Sobic005G122600 Sobic005G122600 Sobic003G186200--Sobic005G122600 Sobic002G268450 Sobic002G268450 Sobic003G186200--Sobic002G268450 Sobic010G120350 Sobic010G120350 Sobic003G186200--Sobic010G120350 Sobic008G176401 Sobic008G176401 Sobic003G186200--Sobic008G176401 Sobic003G091900 Sobic003G091900 Sobic010G213100--Sobic003G091900 Sobic010G054400 Sobic010G054400 Sobic010G213100--Sobic010G054400 Sobic001G062000 Sobic001G062000 Sobic010G213100--Sobic001G062000 Sobic007G182400 Sobic007G182400 Sobic010G213100--Sobic007G182400 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic010G213100--Sobic003G308900 Sobic003G336600 Sobic003G336600 Sobic010G213100--Sobic003G336600 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic010G213100--Sobic009G047033 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic010G213100--Sobic002G377400 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic010G213100--Sobic004G343733 Sobic004G304900 Sobic004G304900 Sobic010G265100--Sobic004G304900 Sobic003G271000 Sobic003G271000 Sobic010G265100--Sobic003G271000 Sobic010G265100--Sobic003G308900 Sobic006G233400 Sobic006G233400 Sobic010G265100--Sobic006G233400 Sobic002G256400 Sobic002G256400 Sobic010G265100--Sobic002G256400 Sobic005G175700 Sobic005G175700 Sobic010G265100--Sobic005G175700 Sobic003G184600 Sobic003G184600 Sobic010G265100--Sobic003G184600 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic010G265100--Sobic003G243750 Sobic010G265100--Sobic002G377400 Sobic009G109600 Sobic009G109600 Sobic001G148800--Sobic009G109600 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic001G148800--Sobic009G247200 Sobic010G064300 Sobic010G064300 Sobic001G148800--Sobic010G064300 Sobic002G208500 Sobic002G208500 Sobic001G148800--Sobic002G208500 Sobic002G342700 Sobic002G342700 Sobic001G148800--Sobic002G342700 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic001G148800--Sobic008G132550 Sobic001G148800--Sobic003G186200 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic001G148800--Sobic002G046150 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic001G148800--Sobic003G023450 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic006G212700--Sobic007G171300 Sobic006G212700--Sobic003G186200 Sobic002G227400 Sobic002G227400 Sobic006G212700--Sobic002G227400 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic006G212700--Sobic001G486400 Sobic001G120750 Sobic001G120750 Sobic006G212700--Sobic001G120750 Sobic001G135000 Sobic001G135000 Sobic006G212700--Sobic001G135000 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic006G212700--Sobic005G078600 Sobic002G265500 Sobic002G265500 Sobic006G212700--Sobic002G265500 Sobic006G212700--Sobic010G213100 Sobic001G521400--Sobic003G186200 Sobic001G521400--Sobic010G265100 Sobic001G521400--Sobic003G184600 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic001G521400--Sobic003G092150 Sobic001G521400--Sobic003G091900 Sobic006G128450 Sobic006G128450 Sobic001G521400--Sobic006G128450 Sobic003G157800 Sobic003G157800 Sobic001G521400--Sobic003G157800 Sobic003G108401 Sobic003G108401 Sobic001G521400--Sobic003G108401 Sobic001G080500 Sobic001G080500 Sobic001G521400--Sobic001G080500 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic005G122600--Sobic008G098032 Sobic004G087750 Sobic004G087750 Sobic005G122600--Sobic004G087750 Sobic009G174200 Sobic009G174200 Sobic005G122600--Sobic009G174200 Sobic005G122600--Sobic008G176401 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic005G122600--Sobic004G139800 Sobic004G019250 Sobic004G019250 Sobic005G122600--Sobic004G019250 Sobic003G014832 Sobic003G014832 Sobic005G122600--Sobic003G014832 Sobic005G122600--Sobic002G268450 Sobic004G342700 Sobic004G342700 Sobic005G122600--Sobic004G342700 Sobic002G268450--Sobic008G176401 Sobic006G246800 Sobic006G246800 Sobic002G268450--Sobic006G246800 Sobic004G355101 Sobic004G355101 Sobic002G268450--Sobic004G355101 Sobic002G268450--Sobic004G342700 Sobic006G035950 Sobic006G035950 Sobic002G268450--Sobic006G035950 Sobic001G121000 Sobic001G121000 Sobic002G268450--Sobic001G121000 Sobic002G268450--Sobic003G014832 Sobic002G268450--Sobic009G174200 Sobic002G268450--Sobic004G087750 Sobic004G319500 Sobic004G319500 Sobic010G120350--Sobic004G319500 Sobic003G201800 Sobic003G201800 Sobic010G120350--Sobic003G201800 Sobic002G382400 Sobic002G382400 Sobic010G120350--Sobic002G382400 Sobic002G249400 Sobic002G249400 Sobic010G120350--Sobic002G249400 Sobic006G001600 Sobic006G001600 Sobic010G120350--Sobic006G001600 Sobic003G236501 Sobic003G236501 Sobic010G120350--Sobic003G236501 Sobic010G120350--Sobic004G342700 Sobic010G120350--Sobic006G246800 Sobic010G120350--Sobic008G176401 Sobic008G176401--Sobic004G342700 Sobic008G176401--Sobic009G174200 Sobic008G176401--Sobic004G087750 Sobic008G176401--Sobic003G014832 Sobic008G176401--Sobic006G246800 Sobic008G176401--Sobic002G268450 Sobic008G176401--Sobic004G355101 Sobic008G176401--Sobic006G035950 Sobic008G176401--Sobic004G019250
Octagon: transcription factors


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